More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5187 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5187  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  100 
 
 		 262 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0351  NLPA lipoprotein  95.8 
 
 		 262 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0237  NLPA lipoprotein  83.98 
 
 		 269 aa  441  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4991  NLPA lipoprotein  77.78 
 
 		 266 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0245  NLPA lipoprotein  78.63 
 
 		 266 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.590029  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0221  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  78.54 
 
 		 266 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542967  hitchhiker  0.00586587 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0236  NLPA lipoprotein  77.78 
 
 		 266 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.643505 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31510  NLPA lipoprotein  68.08 
 
 		 273 aa  362  2e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0866594  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2913  hypothetical protein  67.8 
 
 		 264 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.828858  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34280  hypothetical protein  67.05 
 
 		 264 aa  353  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.595717  decreased coverage  0.00469522 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2364  NLPA lipoprotein  71.85 
 
 		 264 aa  348  4e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0111009  hitchhiker  0.00286659 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4537  NLPA lipoprotein  58.43 
 
 		 279 aa  295  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0852  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  57.65 
 
 		 279 aa  291  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00818473  hitchhiker  0.0030003 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3391  NLPA lipoprotein  57.36 
 
 		 283 aa  290  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0856  putative D-methionine-binding lipoprotein metQ  56.33 
 
 		 279 aa  288  8e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.672009  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1441  putative D-methionine-binding lipoprotein metQ  56.33 
 
 		 279 aa  288  8e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.404367  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0446  methionine ABC transporter periiplasmic amino-acid binding protein  56.33 
 
 		 279 aa  288  8e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2172  putative D-methionine-binding lipoprotein metQ  56.33 
 
 		 279 aa  288  8e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.410212  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0544  methionine ABC transporter periiplasmic amino-acid binding protein  56.33 
 
 		 279 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1864  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  56.33 
 
 		 248 aa  287  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00940719  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0309  NLPA lipoprotein  55.34 
 
 		 276 aa  285  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4929  NLPA lipoprotein  57.55 
 
 		 279 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.7748  normal  0.886888 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5339  NLPA lipoprotein  57.55 
 
 		 279 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4689  NLPA lipoprotein  57.55 
 
 		 286 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53578  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5218  NLPA lipoprotein  57.55 
 
 		 286 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.431973 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3027  NLPA lipoprotein  57.4 
 
 		 257 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.15305  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2682  NLPA lipoprotein  48.3 
 
 		 271 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4224  NLPA lipoprotein  45.45 
 
 		 266 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00732544 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1783  NLPA lipoprotein  47.74 
 
 		 264 aa  228  7e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1777  NLPA lipoprotein  47.41 
 
 		 274 aa  226  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1782  NLPA lipoprotein  46.91 
 
 		 268 aa  221  8e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7233  outer membrane lipoprotein  50.41 
 
 		 266 aa  218  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2455  NLPA lipoprotein  45.85 
 
 		 273 aa  199  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2666  NLPA lipoprotein  42.08 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3221  NLPA lipoprotein  44.3 
 
 		 260 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3174  YaeC family lipoprotein  39.84 
 
 		 269 aa  175  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0987485  hitchhiker  0.00336429 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1127  NLPA lipoprotein  40.25 
 
 		 281 aa  175  8e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0786  NLPA lipoprotein  40.39 
 
 		 264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0562  NLPA lipoprotein  43.21 
 
 		 263 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001625  methionine ABC transporter substrate-binding protein  42.41 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1614  NLPA lipoprotein  42.54 
 
 		 261 aa  168  9e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.141443  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7906  NlpA lipoprotein  45.28 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3285  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  40.57 
 
 		 258 aa  159  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0283  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  39.85 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188868  normal  0.293421 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  39.85 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.217766  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0286  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  39.85 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00047573  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0272  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  39.85 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.922304  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  39.85 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0381792  normal  0.291732 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3223  lipoprotein YaeC  42.08 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4845  putative D-methionine-binding lipoprotein precursor  37.7 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.768272  normal  0.268623 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5162  lipoprotein, YaeC family  41.23 
 
 		 257 aa  156  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712142  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  40.18 
 
 		 262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  39.53 
 
 		 271 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  39.53 
 
 		 271 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0208  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  39.48 
 
 		 271 aa  155  8e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0183748  normal  0.50615 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00196  DL-methionine transporter subunit  39.48 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00228683  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0201  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  39.48 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0735  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  39.11 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.005469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0191  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  39.48 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0075131  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0204  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  39.48 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000208912  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1906  NLPA lipoprotein  42.08 
 
 		 280 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800256  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00195  hypothetical protein  39.48 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00217092  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1612  lipoprotein, YaeC family  41.63 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0197  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  36.92 
 
 		 267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1999  methionine-binding protein  36.92 
 
 		 267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.344493  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  39.36 
 
 		 265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1905  lipoprotein, YaeC family  39.74 
 
 		 286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.279671  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  38.08 
 
 		 262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3405  lipoprotein, YaeC family  39.11 
 
 		 271 aa  152  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434725  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  39.75 
 
 		 272 aa  152  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3462  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  39.11 
 
 		 271 aa  152  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000417542  normal  0.876119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0209  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  39.11 
 
 		 271 aa  152  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.127497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  36.78 
 
 		 266 aa  152  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3755  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.38 
 
 		 271 aa  151  8e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000728433  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  39.33 
 
 		 281 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4489  YaeC family lipoprotein  40.65 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0112568  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3789  lipoprotein, YaeC family  40.55 
 
 		 274 aa  150  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  39.33 
 
 		 272 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  39.33 
 
 		 272 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  39.33 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  39.33 
 
 		 272 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  39.33 
 
 		 272 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  39.33 
 
 		 272 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  39.04 
 
 		 271 aa  150  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  39.74 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0565  lipoprotein YaeC  35.91 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  37.98 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  37.98 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  37.98 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3407  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.01 
 
 		 271 aa  150  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  38.15 
 
 		 268 aa  149  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0736  lipoprotein YaeC  40.91 
 
 		 264 aa  149  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3250  putative TonB-dependent receptor  38.96 
 
 		 277 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3301  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  39.83 
 
 		 259 aa  149  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal  0.569217 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0845  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.75 
 
 		 271 aa  149  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000174258  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  37.98 
 
 		 271 aa  149  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1094  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  37.64 
 
 		 271 aa  148  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174386  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3344  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  39.43 
 
 		 271 aa  148  8e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1966  YaeC family lipoprotein  37.68 
 
 		 271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00914469 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  37.45 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>