More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1783 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1783  NLPA lipoprotein  100 
 
 		 264 aa  530  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1782  NLPA lipoprotein  58.78 
 
 		 268 aa  288  5.0000000000000004e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4224  NLPA lipoprotein  56.13 
 
 		 266 aa  287  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00732544 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1777  NLPA lipoprotein  56.79 
 
 		 274 aa  270  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7233  outer membrane lipoprotein  55.2 
 
 		 266 aa  259  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3391  NLPA lipoprotein  51.15 
 
 		 283 aa  255  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0309  NLPA lipoprotein  51.42 
 
 		 276 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31510  NLPA lipoprotein  53.75 
 
 		 273 aa  253  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0866594  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4929  NLPA lipoprotein  51.01 
 
 		 279 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.7748  normal  0.886888 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5339  NLPA lipoprotein  51.01 
 
 		 279 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4689  NLPA lipoprotein  51.19 
 
 		 286 aa  251  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53578  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0446  methionine ABC transporter periiplasmic amino-acid binding protein  52.23 
 
 		 279 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0856  putative D-methionine-binding lipoprotein metQ  52.23 
 
 		 279 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.672009  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1441  putative D-methionine-binding lipoprotein metQ  52.23 
 
 		 279 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.404367  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1864  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  52.23 
 
 		 248 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00940719  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2172  putative D-methionine-binding lipoprotein metQ  52.23 
 
 		 279 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.410212  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4537  NLPA lipoprotein  51.38 
 
 		 279 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0544  methionine ABC transporter periiplasmic amino-acid binding protein  52.23 
 
 		 279 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5218  NLPA lipoprotein  51.24 
 
 		 286 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.431973 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0852  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  49.43 
 
 		 279 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00818473  hitchhiker  0.0030003 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3027  NLPA lipoprotein  53.15 
 
 		 257 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.15305  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0237  NLPA lipoprotein  50.2 
 
 		 269 aa  238  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0245  NLPA lipoprotein  49.23 
 
 		 266 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.590029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4991  NLPA lipoprotein  49.6 
 
 		 266 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2364  NLPA lipoprotein  49.59 
 
 		 264 aa  235  6e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0111009  hitchhiker  0.00286659 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2913  hypothetical protein  51.19 
 
 		 264 aa  234  9e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.828858  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0351  NLPA lipoprotein  48.77 
 
 		 262 aa  234  9e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34280  hypothetical protein  51.59 
 
 		 264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.595717  decreased coverage  0.00469522 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5187  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  47.95 
 
 		 262 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0236  NLPA lipoprotein  49.23 
 
 		 266 aa  218  6e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.643505 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0221  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  49.2 
 
 		 266 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542967  hitchhiker  0.00586587 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2682  NLPA lipoprotein  46.18 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2455  NLPA lipoprotein  43.39 
 
 		 273 aa  196  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3174  YaeC family lipoprotein  43.04 
 
 		 269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0987485  hitchhiker  0.00336429 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1127  NLPA lipoprotein  41.59 
 
 		 281 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  41.1 
 
 		 272 aa  172  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0562  NLPA lipoprotein  40.62 
 
 		 263 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  40.85 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  41.41 
 
 		 264 aa  169  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1515  lipoprotein, YaeC family  44.3 
 
 		 266 aa  169  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2342  YaeC family lipoprotein  44.3 
 
 		 266 aa  169  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1614  NLPA lipoprotein  40.52 
 
 		 261 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.141443  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1905  lipoprotein, YaeC family  43.04 
 
 		 286 aa  167  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.279671  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3221  NLPA lipoprotein  40.25 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  40.17 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  40.17 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2666  NLPA lipoprotein  41.45 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2369  NLPA lipoprotein  47.49 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0617625  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0286  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  39.2 
 
 		 271 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00047573  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  39.2 
 
 		 271 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0381792  normal  0.291732 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0283  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  39.2 
 
 		 271 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188868  normal  0.293421 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0272  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  39.2 
 
 		 271 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.922304  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  39.2 
 
 		 271 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.217766  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0565  lipoprotein YaeC  38.56 
 
 		 258 aa  161  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0735  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.55 
 
 		 271 aa  161  9e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.005469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3285  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  38.87 
 
 		 258 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0786  NLPA lipoprotein  40.95 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1966  YaeC family lipoprotein  40.82 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00914469 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1094  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.55 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174386  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1041  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.55 
 
 		 271 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3755  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  37.1 
 
 		 271 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000728433  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3344  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.62 
 
 		 271 aa  158  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3407  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.15 
 
 		 271 aa  158  8e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0208  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  37.6 
 
 		 271 aa  158  9e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0183748  normal  0.50615 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00196  DL-methionine transporter subunit  37.6 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00228683  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0204  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  37.6 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000208912  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0201  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  37.6 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3501  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  37.8 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000464416  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00195  hypothetical protein  37.6 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00217092  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0191  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  37.6 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0075131  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4845  putative D-methionine-binding lipoprotein precursor  37.55 
 
 		 268 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.768272  normal  0.268623 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0876  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  37.65 
 
 		 271 aa  158  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00171435  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2551  lipoprotein YaeC  41.67 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2539  YaeC family lipoprotein  41.13 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124943  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0845  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.76 
 
 		 271 aa  156  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000174258  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0209  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  37.2 
 
 		 271 aa  156  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.127497  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3405  lipoprotein, YaeC family  37.2 
 
 		 271 aa  156  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434725  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3223  lipoprotein YaeC  39.29 
 
 		 257 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3462  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  37.2 
 
 		 271 aa  156  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000417542  normal  0.876119 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3536  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  39.6 
 
 		 271 aa  155  7e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.784209  normal  0.0236747 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3386  putative outermembrane signal peptide protein  39.74 
 
 		 529 aa  154  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000211663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3593  lipoprotein, YaeC family  40.71 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000081124  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1501  D-methionine-binding lipoprotein metQ  40.66 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0371  YaeC family lipoprotein  40.66 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  37.23 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0787  D-methionine-binding lipoprotein metQ  40.66 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2103  D-methionine-binding lipoprotein metQ  40.66 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83423  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0468  YaeC family lipoprotein  40.66 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1612  lipoprotein, YaeC family  37.95 
 
 		 257 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  38.91 
 
 		 258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  35.66 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3301  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  46.67 
 
 		 259 aa  152  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal  0.569217 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5369  YaeC family lipoprotein  38.67 
 
 		 260 aa  153  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0173047 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3271  lipoprotein, YaeC family  40.27 
 
 		 268 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000895864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5162  lipoprotein, YaeC family  38.72 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712142  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  38 
 
 		 271 aa  152  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1802  D-methionine-binding lipoprotein metQ  40.25 
 
 		 259 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  40.48 
 
 		 268 aa  152  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0863  lipoprotein, YaeC family  47.54 
 
 		 266 aa  151  8e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136461  normal  0.522332 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0792  lipoprotein, YaeC family  47.54 
 
 		 266 aa  151  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.375673 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>