More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4224 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4224  NLPA lipoprotein  100 
 
 
266 aa  534  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00732544 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1782  NLPA lipoprotein  67.9 
 
 
268 aa  347  9e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7233  outer membrane lipoprotein  65.99 
 
 
266 aa  324  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1783  NLPA lipoprotein  56.2 
 
 
264 aa  281  7.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1777  NLPA lipoprotein  54.58 
 
 
274 aa  281  7.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28691  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4537  NLPA lipoprotein  52.53 
 
 
279 aa  268  7e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163083  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0852  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  51.95 
 
 
279 aa  265  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00818473  hitchhiker  0.0030003 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1441  putative D-methionine-binding lipoprotein metQ  52.44 
 
 
279 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.404367  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0856  putative D-methionine-binding lipoprotein metQ  52.44 
 
 
279 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.672009  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0446  methionine ABC transporter periiplasmic amino-acid binding protein  52.44 
 
 
279 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2172  putative D-methionine-binding lipoprotein metQ  52.44 
 
 
279 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.410212  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1864  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  52.44 
 
 
248 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00940719  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0544  methionine ABC transporter periiplasmic amino-acid binding protein  52.44 
 
 
279 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3391  NLPA lipoprotein  52.43 
 
 
283 aa  263  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423711  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0309  NLPA lipoprotein  50.95 
 
 
276 aa  253  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4929  NLPA lipoprotein  50.41 
 
 
279 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.7748  normal  0.886888 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5339  NLPA lipoprotein  50.41 
 
 
279 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5218  NLPA lipoprotein  49.8 
 
 
286 aa  248  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.431973 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4689  NLPA lipoprotein  49.8 
 
 
286 aa  248  6e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53578  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4991  NLPA lipoprotein  46.62 
 
 
266 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0245  NLPA lipoprotein  46.24 
 
 
266 aa  241  9e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.590029  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2913  hypothetical protein  45.52 
 
 
264 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.828858  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31510  NLPA lipoprotein  46.44 
 
 
273 aa  238  5.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0866594  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2364  NLPA lipoprotein  47.33 
 
 
264 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0111009  hitchhiker  0.00286659 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34280  hypothetical protein  45.52 
 
 
264 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.595717  decreased coverage  0.00469522 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3027  NLPA lipoprotein  52.04 
 
 
257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.15305  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0237  NLPA lipoprotein  46.91 
 
 
269 aa  229  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200335  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5187  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  45.75 
 
 
262 aa  226  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0236  NLPA lipoprotein  46.82 
 
 
266 aa  225  6e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.643505 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0221  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  46.82 
 
 
266 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542967  hitchhiker  0.00586587 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0351  NLPA lipoprotein  44.53 
 
 
262 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2682  NLPA lipoprotein  41.31 
 
 
271 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2455  NLPA lipoprotein  42.45 
 
 
273 aa  191  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  41.32 
 
 
281 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  41.32 
 
 
272 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  41.32 
 
 
272 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  40.08 
 
 
271 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  41.32 
 
 
272 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  41.32 
 
 
272 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  40.08 
 
 
271 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  40.08 
 
 
271 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  41.32 
 
 
272 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0562  NLPA lipoprotein  39.15 
 
 
263 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  39.69 
 
 
271 aa  175  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  41.84 
 
 
272 aa  175  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  40.15 
 
 
271 aa  175  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  39.69 
 
 
271 aa  175  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  40.91 
 
 
272 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  42.39 
 
 
270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3221  NLPA lipoprotein  37.96 
 
 
260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3301  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  40.52 
 
 
259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal  0.569217 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  39.31 
 
 
271 aa  172  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  40.74 
 
 
270 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  40.15 
 
 
271 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1127  NLPA lipoprotein  38.78 
 
 
281 aa  172  5.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  40.81 
 
 
262 aa  171  9e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4845  putative D-methionine-binding lipoprotein precursor  38.52 
 
 
268 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.768272  normal  0.268623 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2666  NLPA lipoprotein  40.89 
 
 
264 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0565  lipoprotein YaeC  37.26 
 
 
258 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1614  NLPA lipoprotein  38.46 
 
 
261 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.141443  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  40.74 
 
 
270 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  41.18 
 
 
268 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0208  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  41.43 
 
 
271 aa  169  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0183748  normal  0.50615 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0786  NLPA lipoprotein  39.46 
 
 
264 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122075  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4789  DL-methionine ABC transporter periplasmic-binding protein  40.98 
 
 
270 aa  169  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0735  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  42.24 
 
 
271 aa  169  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.005469  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00196  DL-methionine transporter subunit  41.43 
 
 
271 aa  169  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00228683  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0191  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  41.43 
 
 
271 aa  169  6e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0075131  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0204  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  41.43 
 
 
271 aa  169  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000208912  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00195  hypothetical protein  41.43 
 
 
271 aa  169  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00217092  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0201  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  41.43 
 
 
271 aa  169  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3405  lipoprotein, YaeC family  41.04 
 
 
271 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434725  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0283  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  41.04 
 
 
271 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188868  normal  0.293421 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  37.6 
 
 
258 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  41.04 
 
 
271 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.217766  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0209  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  41.04 
 
 
271 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.127497  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0286  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  41.04 
 
 
271 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00047573  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  37.6 
 
 
258 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  41.04 
 
 
271 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0381792  normal  0.291732 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3462  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  41.04 
 
 
271 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000417542  normal  0.876119 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0272  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  41.04 
 
 
271 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.922304  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1094  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.49 
 
 
271 aa  165  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174386  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5426  YaeC family lipoprotein  42.08 
 
 
268 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263894  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4843  YaeC family lipoprotein  42.08 
 
 
268 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3407  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.49 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430128  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1041  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.49 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3344  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  39.08 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3755  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.89 
 
 
271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000728433  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  38.91 
 
 
262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5162  lipoprotein, YaeC family  37.04 
 
 
257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712142  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3501  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.24 
 
 
271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000464416  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5436  lipoprotein YaeC  41.67 
 
 
268 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0876  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.65 
 
 
271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00171435  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001625  methionine ABC transporter substrate-binding protein  39.08 
 
 
267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4489  YaeC family lipoprotein  39.11 
 
 
260 aa  162  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0112568  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1905  lipoprotein, YaeC family  38.65 
 
 
286 aa  162  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.279671  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5310  YaeC family lipoprotein  41.67 
 
 
268 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4767  YaeC family lipoprotein  41.67 
 
 
268 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3343  YaeC family lipoprotein  40.83 
 
 
268 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00298632 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3285  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  35.63 
 
 
258 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.190767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>