More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1777 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1777  NLPA lipoprotein  100 
 
 		 274 aa  553  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1782  NLPA lipoprotein  58.85 
 
 		 268 aa  294  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4224  NLPA lipoprotein  53.46 
 
 		 266 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00732544 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1783  NLPA lipoprotein  56.79 
 
 		 264 aa  270  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7233  outer membrane lipoprotein  53.41 
 
 		 266 aa  256  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0245  NLPA lipoprotein  49 
 
 		 266 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.590029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4991  NLPA lipoprotein  46.74 
 
 		 266 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0309  NLPA lipoprotein  49.62 
 
 		 276 aa  237  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3391  NLPA lipoprotein  49.04 
 
 		 283 aa  236  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4929  NLPA lipoprotein  48.44 
 
 		 279 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.7748  normal  0.886888 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5339  NLPA lipoprotein  48.44 
 
 		 279 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4689  NLPA lipoprotein  48.77 
 
 		 286 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53578  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5187  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  47.11 
 
 		 262 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0237  NLPA lipoprotein  47.33 
 
 		 269 aa  230  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5218  NLPA lipoprotein  48.56 
 
 		 286 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.431973 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0221  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  47.49 
 
 		 266 aa  228  7e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542967  hitchhiker  0.00586587 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0856  putative D-methionine-binding lipoprotein metQ  47.13 
 
 		 279 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.672009  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1441  putative D-methionine-binding lipoprotein metQ  47.13 
 
 		 279 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.404367  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1864  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  47.13 
 
 		 248 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00940719  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2172  putative D-methionine-binding lipoprotein metQ  47.13 
 
 		 279 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.410212  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0544  methionine ABC transporter periiplasmic amino-acid binding protein  47.13 
 
 		 279 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0446  methionine ABC transporter periiplasmic amino-acid binding protein  47.13 
 
 		 279 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0351  NLPA lipoprotein  46.28 
 
 		 262 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31510  NLPA lipoprotein  48.36 
 
 		 273 aa  225  5.0000000000000005e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0866594  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0236  NLPA lipoprotein  45.98 
 
 		 266 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.643505 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3027  NLPA lipoprotein  50 
 
 		 257 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.15305  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2913  hypothetical protein  45.39 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.828858  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34280  hypothetical protein  45.39 
 
 		 264 aa  219  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.595717  decreased coverage  0.00469522 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2364  NLPA lipoprotein  44.81 
 
 		 264 aa  219  5e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0111009  hitchhiker  0.00286659 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4537  NLPA lipoprotein  45.38 
 
 		 279 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0852  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  44.58 
 
 		 279 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00818473  hitchhiker  0.0030003 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2682  NLPA lipoprotein  43.6 
 
 		 271 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1127  NLPA lipoprotein  43.04 
 
 		 281 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2455  NLPA lipoprotein  41.63 
 
 		 273 aa  189  5.999999999999999e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2666  NLPA lipoprotein  42.13 
 
 		 264 aa  178  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0786  NLPA lipoprotein  40 
 
 		 264 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0565  lipoprotein YaeC  36.82 
 
 		 258 aa  161  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  40 
 
 		 272 aa  156  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  39.75 
 
 		 262 aa  155  9e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4845  putative D-methionine-binding lipoprotein precursor  36.19 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.768272  normal  0.268623 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  45.45 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  37.07 
 
 		 258 aa  152  7e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  37.07 
 
 		 258 aa  152  7e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0562  NLPA lipoprotein  35.59 
 
 		 263 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3221  NLPA lipoprotein  35.59 
 
 		 260 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3344  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  36.33 
 
 		 271 aa  150  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0845  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  35.97 
 
 		 271 aa  149  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000174258  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3501  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  35.92 
 
 		 271 aa  149  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000464416  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2369  NLPA lipoprotein  46.63 
 
 		 246 aa  148  8e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0617625  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2603  lipoprotein, YaeC family  36.82 
 
 		 260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.946899  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  42.68 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3407  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  36.36 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1094  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  36.36 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174386  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1906  NLPA lipoprotein  36.02 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800256  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1041  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  36.36 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0735  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  34.39 
 
 		 271 aa  147  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.005469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3301  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  45.73 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal  0.569217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1614  NLPA lipoprotein  35.14 
 
 		 261 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.141443  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  42.13 
 
 		 264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  35.57 
 
 		 271 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0381792  normal  0.291732 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  35.57 
 
 		 271 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.217766  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0876  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  36.36 
 
 		 271 aa  145  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00171435  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0286  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  35.57 
 
 		 271 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00047573  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0283  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  35.57 
 
 		 271 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188868  normal  0.293421 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0272  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  35.57 
 
 		 271 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.922304  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3285  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  36.61 
 
 		 258 aa  145  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0792  lipoprotein, YaeC family  41.11 
 
 		 266 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0791  NLPA lipoprotein  40.81 
 
 		 262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.37545  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  37.65 
 
 		 271 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  36.36 
 
 		 264 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0783  YaeC family lipoprotein  45.4 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  36.64 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3755  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  35.92 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000728433  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  35.1 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3223  lipoprotein YaeC  36.92 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1515  lipoprotein, YaeC family  41.18 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2342  YaeC family lipoprotein  41.18 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0863  lipoprotein, YaeC family  46.49 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136461  normal  0.522332 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001625  methionine ABC transporter substrate-binding protein  40.18 
 
 		 267 aa  143  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0648  NLPA lipoprotein  38.4 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4489  YaeC family lipoprotein  47.47 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0112568  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0736  lipoprotein YaeC  46.93 
 
 		 264 aa  143  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  36.61 
 
 		 270 aa  143  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2551  lipoprotein YaeC  46.45 
 
 		 265 aa  142  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2810  NLPA lipoprotein  39.5 
 
 		 272 aa  142  7e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0208  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  34.39 
 
 		 271 aa  142  8e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0183748  normal  0.50615 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4789  DL-methionine ABC transporter periplasmic-binding protein  37.02 
 
 		 270 aa  142  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.67321 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00196  DL-methionine transporter subunit  34.39 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00228683  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0201  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  34.39 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0204  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  34.39 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000208912  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  40.66 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1612  lipoprotein, YaeC family  36.95 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00195  hypothetical protein  34.39 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00217092  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0191  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  34.39 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0075131  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5162  lipoprotein, YaeC family  43.9 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712142  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2134  D-methionine-binding lipoprotein metQ  36.65 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2103  D-methionine-binding lipoprotein metQ  35.62 
 
 		 269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83423  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1501  D-methionine-binding lipoprotein metQ  35.62 
 
 		 269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0209  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  33.99 
 
 		 271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.127497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  43.11 
 
 		 270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>