More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_31510 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_31510  NLPA lipoprotein  100 
 
 		 273 aa  552  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0866594  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0237  NLPA lipoprotein  70.99 
 
 		 269 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2364  NLPA lipoprotein  76.89 
 
 		 264 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0111009  hitchhiker  0.00286659 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34280  hypothetical protein  70.5 
 
 		 264 aa  371  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.595717  decreased coverage  0.00469522 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2913  hypothetical protein  70.5 
 
 		 264 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.828858  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4991  NLPA lipoprotein  71.83 
 
 		 266 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0245  NLPA lipoprotein  69.53 
 
 		 266 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.590029  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5187  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  70.08 
 
 		 262 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0351  NLPA lipoprotein  69.26 
 
 		 262 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0221  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  70.31 
 
 		 266 aa  351  7e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542967  hitchhiker  0.00586587 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0236  NLPA lipoprotein  70.7 
 
 		 266 aa  351  8e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.643505 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3391  NLPA lipoprotein  61.73 
 
 		 283 aa  317  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4929  NLPA lipoprotein  61.32 
 
 		 279 aa  315  5e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.7748  normal  0.886888 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4537  NLPA lipoprotein  60.63 
 
 		 279 aa  315  5e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5339  NLPA lipoprotein  61.32 
 
 		 279 aa  315  5e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4689  NLPA lipoprotein  61.32 
 
 		 286 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53578  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5218  NLPA lipoprotein  60.91 
 
 		 286 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.431973 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0852  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  59.36 
 
 		 279 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00818473  hitchhiker  0.0030003 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0309  NLPA lipoprotein  59.46 
 
 		 276 aa  310  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1441  putative D-methionine-binding lipoprotein metQ  59.35 
 
 		 279 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.404367  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2172  putative D-methionine-binding lipoprotein metQ  59.35 
 
 		 279 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.410212  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0856  putative D-methionine-binding lipoprotein metQ  59.35 
 
 		 279 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.672009  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0446  methionine ABC transporter periiplasmic amino-acid binding protein  59.35 
 
 		 279 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1864  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  59.35 
 
 		 248 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00940719  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0544  methionine ABC transporter periiplasmic amino-acid binding protein  59.35 
 
 		 279 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3027  NLPA lipoprotein  61.54 
 
 		 257 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.15305  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2682  NLPA lipoprotein  51.35 
 
 		 271 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1783  NLPA lipoprotein  53.88 
 
 		 264 aa  246  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1782  NLPA lipoprotein  51.03 
 
 		 268 aa  239  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4224  NLPA lipoprotein  46.44 
 
 		 266 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00732544 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7233  outer membrane lipoprotein  51.41 
 
 		 266 aa  233  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2455  NLPA lipoprotein  47.22 
 
 		 273 aa  219  3.9999999999999997e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1777  NLPA lipoprotein  48.44 
 
 		 274 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2666  NLPA lipoprotein  45.78 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3221  NLPA lipoprotein  46.64 
 
 		 260 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1614  NLPA lipoprotein  45.38 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.141443  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0786  NLPA lipoprotein  42.26 
 
 		 264 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0562  NLPA lipoprotein  42.51 
 
 		 263 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001625  methionine ABC transporter substrate-binding protein  42.91 
 
 		 267 aa  189  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3174  YaeC family lipoprotein  43.21 
 
 		 269 aa  189  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0987485  hitchhiker  0.00336429 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1127  NLPA lipoprotein  39.43 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4845  putative D-methionine-binding lipoprotein precursor  43.68 
 
 		 268 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.768272  normal  0.268623 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  41.64 
 
 		 266 aa  186  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  40.29 
 
 		 271 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  40.29 
 
 		 271 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  38.89 
 
 		 268 aa  175  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3285  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  41.44 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  40.73 
 
 		 271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  39.19 
 
 		 271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  40.76 
 
 		 262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  39.19 
 
 		 271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  39.19 
 
 		 271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  41.32 
 
 		 278 aa  172  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4843  YaeC family lipoprotein  42.68 
 
 		 268 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5426  YaeC family lipoprotein  42.68 
 
 		 268 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263894  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2369  NLPA lipoprotein  41.76 
 
 		 246 aa  171  7.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0617625  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3223  lipoprotein YaeC  41.08 
 
 		 257 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  41.87 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  39.19 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0565  lipoprotein YaeC  38.7 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5436  lipoprotein YaeC  42.68 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0783  YaeC family lipoprotein  41.77 
 
 		 263 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  39.69 
 
 		 259 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  40.59 
 
 		 258 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3343  YaeC family lipoprotein  41.91 
 
 		 268 aa  169  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298632 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  40.59 
 
 		 258 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.34 
 
 		 270 aa  169  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2539  YaeC family lipoprotein  40.07 
 
 		 281 aa  169  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124943  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  41.39 
 
 		 264 aa  168  7e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5162  lipoprotein, YaeC family  41.18 
 
 		 257 aa  168  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712142  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1515  lipoprotein, YaeC family  41.79 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2342  YaeC family lipoprotein  41.79 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1612  lipoprotein, YaeC family  41.42 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5310  YaeC family lipoprotein  42.32 
 
 		 268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0791  NLPA lipoprotein  45.42 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.37545  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4767  YaeC family lipoprotein  42.32 
 
 		 268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0272  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  41.2 
 
 		 271 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.922304  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  39.62 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  41.2 
 
 		 271 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.217766  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  41.2 
 
 		 271 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0381792  normal  0.291732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0286  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  41.2 
 
 		 271 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00047573  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0283  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  41.2 
 
 		 271 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188868  normal  0.293421 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3301  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  42.32 
 
 		 259 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal  0.569217 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00196  DL-methionine transporter subunit  40.07 
 
 		 271 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00228683  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00195  hypothetical protein  40.07 
 
 		 271 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00217092  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0201  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  40.07 
 
 		 271 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0204  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  40.07 
 
 		 271 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000208912  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0191  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  40.07 
 
 		 271 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0075131  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4489  YaeC family lipoprotein  40.89 
 
 		 260 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0112568  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0735  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  39.71 
 
 		 271 aa  165  6.9999999999999995e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.005469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0208  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  39.7 
 
 		 271 aa  165  9e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0183748  normal  0.50615 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  39.23 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0845  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  40.89 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000174258  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0226  YaeC family lipoprotein  42.32 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.951808 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  41.06 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3755  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  40.45 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000728433  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0209  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  39.7 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.127497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3462  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  39.7 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000417542  normal  0.876119 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  40.17 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  39.59 
 
 		 264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>