More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2364 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2364  NLPA lipoprotein  100 
 
 		 264 aa  532  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0111009  hitchhiker  0.00286659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31510  NLPA lipoprotein  74.23 
 
 		 273 aa  391  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0866594  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34280  hypothetical protein  70.45 
 
 		 264 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.595717  decreased coverage  0.00469522 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0237  NLPA lipoprotein  72.69 
 
 		 269 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2913  hypothetical protein  70.08 
 
 		 264 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.828858  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0245  NLPA lipoprotein  68.06 
 
 		 266 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.590029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4991  NLPA lipoprotein  68.82 
 
 		 266 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5187  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  71.85 
 
 		 262 aa  349  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0351  NLPA lipoprotein  71.43 
 
 		 262 aa  347  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0221  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  69.02 
 
 		 266 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542967  hitchhiker  0.00586587 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0236  NLPA lipoprotein  66.92 
 
 		 266 aa  342  4e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.643505 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4537  NLPA lipoprotein  60.38 
 
 		 279 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3391  NLPA lipoprotein  60.69 
 
 		 283 aa  314  8e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0852  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  60.94 
 
 		 279 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00818473  hitchhiker  0.0030003 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4929  NLPA lipoprotein  62.18 
 
 		 279 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.7748  normal  0.886888 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5339  NLPA lipoprotein  62.18 
 
 		 279 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5218  NLPA lipoprotein  61.76 
 
 		 286 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.431973 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4689  NLPA lipoprotein  61.76 
 
 		 286 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53578  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0309  NLPA lipoprotein  62.18 
 
 		 276 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0544  methionine ABC transporter periiplasmic amino-acid binding protein  62.22 
 
 		 279 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0856  putative D-methionine-binding lipoprotein metQ  62.22 
 
 		 279 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.672009  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1441  putative D-methionine-binding lipoprotein metQ  62.22 
 
 		 279 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.404367  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1864  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  62.22 
 
 		 248 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00940719  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2172  putative D-methionine-binding lipoprotein metQ  62.22 
 
 		 279 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.410212  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0446  methionine ABC transporter periiplasmic amino-acid binding protein  62.22 
 
 		 279 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3027  NLPA lipoprotein  61.57 
 
 		 257 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.15305  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2682  NLPA lipoprotein  52.14 
 
 		 271 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4224  NLPA lipoprotein  46.07 
 
 		 266 aa  243  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00732544 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7233  outer membrane lipoprotein  50.94 
 
 		 266 aa  238  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1782  NLPA lipoprotein  49.79 
 
 		 268 aa  236  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1783  NLPA lipoprotein  49.17 
 
 		 264 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1777  NLPA lipoprotein  45.26 
 
 		 274 aa  219  5e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2455  NLPA lipoprotein  46.25 
 
 		 273 aa  217  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1614  NLPA lipoprotein  43.28 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.141443  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3174  YaeC family lipoprotein  42.98 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0987485  hitchhiker  0.00336429 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3221  NLPA lipoprotein  42.62 
 
 		 260 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  38.78 
 
 		 266 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0562  NLPA lipoprotein  41.15 
 
 		 263 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2666  NLPA lipoprotein  40.98 
 
 		 264 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  37.97 
 
 		 264 aa  169  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001625  methionine ABC transporter substrate-binding protein  38.37 
 
 		 267 aa  169  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0786  NLPA lipoprotein  38.2 
 
 		 264 aa  168  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1127  NLPA lipoprotein  39 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  39.09 
 
 		 278 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0783  YaeC family lipoprotein  40 
 
 		 263 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0791  NLPA lipoprotein  43.93 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.37545  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  37.84 
 
 		 259 aa  158  8e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  36.54 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  36.54 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3301  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  39.33 
 
 		 259 aa  155  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal  0.569217 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  37.55 
 
 		 262 aa  155  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5162  lipoprotein, YaeC family  37.84 
 
 		 257 aa  155  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712142  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4845  putative D-methionine-binding lipoprotein precursor  36.29 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.768272  normal  0.268623 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4489  YaeC family lipoprotein  38.22 
 
 		 260 aa  153  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0112568  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2369  NLPA lipoprotein  39.91 
 
 		 246 aa  153  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0617625  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3344  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  42.61 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  37.07 
 
 		 259 aa  152  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3501  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  41.74 
 
 		 271 aa  152  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000464416  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  35.14 
 
 		 258 aa  152  7e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3285  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  37.07 
 
 		 258 aa  152  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  37.39 
 
 		 258 aa  151  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  36.68 
 
 		 259 aa  151  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1999  methionine-binding protein  37.92 
 
 		 267 aa  151  1e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.344493  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0197  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  37.92 
 
 		 267 aa  151  1e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  42.06 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0778  lipoprotein YaeC  39.75 
 
 		 268 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1612  lipoprotein, YaeC family  37.07 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  39.17 
 
 		 272 aa  149  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0736  lipoprotein YaeC  37.5 
 
 		 264 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2551  lipoprotein YaeC  40.32 
 
 		 265 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  35.98 
 
 		 262 aa  148  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1966  YaeC family lipoprotein  37.73 
 
 		 271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00914469 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3223  lipoprotein YaeC  35.14 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  41.41 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.217766  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  41.41 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0381792  normal  0.291732 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  41.75 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0565  lipoprotein YaeC  37.07 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1247  nlpa lipoprotein  37.39 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0272  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  41.41 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.922304  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0286  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  41.41 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00047573  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0283  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  41.41 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188868  normal  0.293421 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3789  lipoprotein, YaeC family  38.61 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0208  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  40.97 
 
 		 271 aa  146  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0183748  normal  0.50615 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00196  DL-methionine transporter subunit  40.97 
 
 		 271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00228683  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0191  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  40.97 
 
 		 271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0075131  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0201  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  40.97 
 
 		 271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00195  hypothetical protein  40.97 
 
 		 271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00217092  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2102  lipoprotein YaeC  38.17 
 
 		 275 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000812987  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0204  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  40.97 
 
 		 271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000208912  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0845  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  40.43 
 
 		 271 aa  145  6e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000174258  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0997  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  37.65 
 
 		 265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.903774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2243  YaeC family lipoprotein  38.66 
 
 		 265 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567581  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3405  lipoprotein, YaeC family  40.53 
 
 		 271 aa  144  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434725  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3462  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  40.53 
 
 		 271 aa  144  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000417542  normal  0.876119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0209  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  40.53 
 
 		 271 aa  144  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.127497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3755  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  40.09 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000728433  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  38.31 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  38.31 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3792  YaeC family lipoprotein  37.36 
 
 		 265 aa  143  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.293535  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  38.25 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>