More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4689 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4689  NLPA lipoprotein  100 
 
 		 286 aa  578  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53578  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5218  NLPA lipoprotein  98.6 
 
 		 286 aa  573  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.431973 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3391  NLPA lipoprotein  87.41 
 
 		 283 aa  509  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0309  NLPA lipoprotein  87.76 
 
 		 276 aa  498  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4929  NLPA lipoprotein  89.16 
 
 		 279 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.7748  normal  0.886888 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5339  NLPA lipoprotein  89.16 
 
 		 279 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0852  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  82.95 
 
 		 279 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00818473  hitchhiker  0.0030003 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4537  NLPA lipoprotein  83.46 
 
 		 279 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3027  NLPA lipoprotein  88.26 
 
 		 257 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.15305  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2172  putative D-methionine-binding lipoprotein metQ  86.12 
 
 		 279 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.410212  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1441  putative D-methionine-binding lipoprotein metQ  86.12 
 
 		 279 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.404367  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1864  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  86.12 
 
 		 248 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00940719  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0856  putative D-methionine-binding lipoprotein metQ  86.12 
 
 		 279 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.672009  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0544  methionine ABC transporter periiplasmic amino-acid binding protein  86.12 
 
 		 279 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0446  methionine ABC transporter periiplasmic amino-acid binding protein  86.12 
 
 		 279 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31510  NLPA lipoprotein  61.32 
 
 		 273 aa  314  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0866594  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4991  NLPA lipoprotein  60.08 
 
 		 266 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2364  NLPA lipoprotein  61.76 
 
 		 264 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0111009  hitchhiker  0.00286659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0245  NLPA lipoprotein  60.67 
 
 		 266 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.590029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0237  NLPA lipoprotein  60.91 
 
 		 269 aa  301  6.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34280  hypothetical protein  56.86 
 
 		 264 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.595717  decreased coverage  0.00469522 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0221  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  59.68 
 
 		 266 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542967  hitchhiker  0.00586587 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2913  hypothetical protein  56.86 
 
 		 264 aa  289  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.828858  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0236  NLPA lipoprotein  58.82 
 
 		 266 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.643505 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5187  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  58.16 
 
 		 262 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0351  NLPA lipoprotein  56.38 
 
 		 262 aa  278  6e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4224  NLPA lipoprotein  49.44 
 
 		 266 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00732544 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1783  NLPA lipoprotein  51.04 
 
 		 264 aa  248  7e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2455  NLPA lipoprotein  49.61 
 
 		 273 aa  242  6e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1782  NLPA lipoprotein  50.21 
 
 		 268 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7233  outer membrane lipoprotein  51.6 
 
 		 266 aa  226  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1777  NLPA lipoprotein  48.13 
 
 		 274 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2682  NLPA lipoprotein  45.76 
 
 		 271 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0562  NLPA lipoprotein  44.44 
 
 		 263 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1614  NLPA lipoprotein  44.81 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.141443  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3221  NLPA lipoprotein  44.96 
 
 		 260 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2666  NLPA lipoprotein  44.76 
 
 		 264 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4845  putative D-methionine-binding lipoprotein precursor  42.74 
 
 		 268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.768272  normal  0.268623 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3174  YaeC family lipoprotein  40.4 
 
 		 269 aa  190  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0987485  hitchhiker  0.00336429 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1127  NLPA lipoprotein  42.98 
 
 		 281 aa  189  5.999999999999999e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  40.3 
 
 		 266 aa  186  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2551  lipoprotein YaeC  41.09 
 
 		 265 aa  185  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0736  lipoprotein YaeC  40.71 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2243  YaeC family lipoprotein  44.12 
 
 		 265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0791  NLPA lipoprotein  46.67 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.37545  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1999  methionine-binding protein  42.26 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.344493  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0197  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  42.26 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0565  lipoprotein YaeC  40.96 
 
 		 258 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3285  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  40.3 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1515  lipoprotein, YaeC family  40.67 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0786  NLPA lipoprotein  40.74 
 
 		 264 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2342  YaeC family lipoprotein  40.67 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1612  lipoprotein, YaeC family  42.56 
 
 		 257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2369  NLPA lipoprotein  48.62 
 
 		 246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0617625  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4174  ABC metal ion transporter, periplasmic ligand binding protein  41.87 
 
 		 264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436245  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3789  lipoprotein, YaeC family  40.3 
 
 		 274 aa  172  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3593  lipoprotein, YaeC family  40.51 
 
 		 268 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000081124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0863  lipoprotein, YaeC family  39.54 
 
 		 266 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136461  normal  0.522332 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0792  lipoprotein, YaeC family  39.54 
 
 		 266 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0283  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  40.52 
 
 		 271 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188868  normal  0.293421 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  40.52 
 
 		 271 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0381792  normal  0.291732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0286  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  40.52 
 
 		 271 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00047573  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0272  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  40.52 
 
 		 271 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.922304  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  40.52 
 
 		 271 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.217766  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1072  lipoprotein 28  41.63 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1020  YaeC family lipoprotein  42.45 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0582  lipoprotein YaeC  42.45 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1061  YaeC family lipoprotein  42.45 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2539  YaeC family lipoprotein  39.29 
 
 		 281 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124943  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  41.3 
 
 		 278 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  39.83 
 
 		 262 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0937  YaeC family lipoprotein  41.22 
 
 		 264 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  40.08 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3386  putative outermembrane signal peptide protein  39.24 
 
 		 529 aa  170  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000211663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2603  lipoprotein, YaeC family  36.5 
 
 		 260 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.946899  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001625  methionine ABC transporter substrate-binding protein  40.98 
 
 		 267 aa  170  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2086  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  74.34 
 
 		 190 aa  170  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.557351  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  40.31 
 
 		 270 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3271  lipoprotein, YaeC family  40.08 
 
 		 268 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000895864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3223  lipoprotein YaeC  40.5 
 
 		 257 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  41.13 
 
 		 271 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  41.13 
 
 		 271 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0941  YaeC family lipoprotein  41.18 
 
 		 264 aa  168  9e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3755  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  39.78 
 
 		 271 aa  168  9e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000728433  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  39.57 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  39.17 
 
 		 268 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3344  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.83 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0922  signal peptide protein  39.75 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  40.33 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3501  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.83 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000464416  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0997  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  40.34 
 
 		 265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.903774  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0960  YaeC family lipoprotein  37.82 
 
 		 278 aa  166  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  40.75 
 
 		 271 aa  166  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004240  methionine ABC transporter substrate-binding protein  42.28 
 
 		 269 aa  166  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  40.38 
 
 		 271 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  40.38 
 
 		 271 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  40.38 
 
 		 271 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0204  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  39.26 
 
 		 271 aa  165  8e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000208912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0208  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  39.26 
 
 		 271 aa  165  8e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0183748  normal  0.50615 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5426  YaeC family lipoprotein  40 
 
 		 268 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263894  normal  0.429699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>