More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II2086 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II2086  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  100 
 
 
190 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.557351  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0544  methionine ABC transporter periiplasmic amino-acid binding protein  80.27 
 
 
279 aa  187  7e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0856  putative D-methionine-binding lipoprotein metQ  82.61 
 
 
279 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.672009  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0446  methionine ABC transporter periiplasmic amino-acid binding protein  82.61 
 
 
279 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1441  putative D-methionine-binding lipoprotein metQ  82.61 
 
 
279 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.404367  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1864  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  82.61 
 
 
248 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00940719  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2172  putative D-methionine-binding lipoprotein metQ  82.61 
 
 
279 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.410212  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3391  NLPA lipoprotein  69.86 
 
 
283 aa  186  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423711  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4537  NLPA lipoprotein  67.81 
 
 
279 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163083  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0852  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  65.99 
 
 
279 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00818473  hitchhiker  0.0030003 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0309  NLPA lipoprotein  70.45 
 
 
276 aa  177  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3027  NLPA lipoprotein  74.34 
 
 
257 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.15305  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4929  NLPA lipoprotein  74.34 
 
 
279 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.7748  normal  0.886888 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4689  NLPA lipoprotein  74.34 
 
 
286 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53578  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5339  NLPA lipoprotein  74.34 
 
 
279 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5218  NLPA lipoprotein  73.45 
 
 
286 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.431973 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31510  NLPA lipoprotein  48.12 
 
 
273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0866594  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0237  NLPA lipoprotein  50 
 
 
269 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200335  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2364  NLPA lipoprotein  60.22 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0111009  hitchhiker  0.00286659 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0351  NLPA lipoprotein  52.68 
 
 
262 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4991  NLPA lipoprotein  46.53 
 
 
266 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0221  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  50.39 
 
 
266 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542967  hitchhiker  0.00586587 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0236  NLPA lipoprotein  49.61 
 
 
266 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.643505 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5187  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  50.89 
 
 
262 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0245  NLPA lipoprotein  49.61 
 
 
266 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.590029  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34280  hypothetical protein  45.16 
 
 
264 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.595717  decreased coverage  0.00469522 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1783  NLPA lipoprotein  48.57 
 
 
264 aa  98.6  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2913  hypothetical protein  47.79 
 
 
264 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.828858  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0562  NLPA lipoprotein  45.05 
 
 
263 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4224  NLPA lipoprotein  48.65 
 
 
266 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00732544 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2455  NLPA lipoprotein  49.54 
 
 
273 aa  96.3  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3221  NLPA lipoprotein  44.34 
 
 
260 aa  91.7  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7233  outer membrane lipoprotein  52.94 
 
 
266 aa  90.5  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0960  YaeC family lipoprotein  37.41 
 
 
278 aa  90.9  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1614  NLPA lipoprotein  44.34 
 
 
261 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.141443  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1396  YaeC family lipoprotein  36.73 
 
 
278 aa  86.3  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760284  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0791  NLPA lipoprotein  43.52 
 
 
262 aa  85.1  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.37545  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2682  NLPA lipoprotein  42.65 
 
 
271 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  38.52 
 
 
268 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3789  lipoprotein, YaeC family  37.24 
 
 
274 aa  83.6  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  36.3 
 
 
271 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001625  methionine ABC transporter substrate-binding protein  32.85 
 
 
267 aa  82.4  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  36.3 
 
 
271 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2134  D-methionine-binding lipoprotein metQ  36.36 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  36.3 
 
 
271 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0786  NLPA lipoprotein  35.04 
 
 
264 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122075  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  36.3 
 
 
271 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  36.3 
 
 
271 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  35.56 
 
 
271 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  40.35 
 
 
281 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  40.35 
 
 
272 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  40.35 
 
 
272 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  40.35 
 
 
272 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  40.35 
 
 
272 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  40.35 
 
 
272 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2924  NLPA lipoprotein  46.91 
 
 
279 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.112237  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  44.05 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1782  NLPA lipoprotein  42.17 
 
 
268 aa  79.3  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  38.76 
 
 
264 aa  79.3  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2102  lipoprotein YaeC  37.8 
 
 
275 aa  79  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000812987  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.72 
 
 
270 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  39.47 
 
 
272 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  36.57 
 
 
270 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0937  YaeC family lipoprotein  33.63 
 
 
264 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2103  D-methionine-binding lipoprotein metQ  38.57 
 
 
269 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83423  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1501  D-methionine-binding lipoprotein metQ  38.57 
 
 
269 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  38.1 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4174  ABC metal ion transporter, periplasmic ligand binding protein  33.63 
 
 
264 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436245  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  34.81 
 
 
271 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0565  lipoprotein YaeC  36.07 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2810  NLPA lipoprotein  35.71 
 
 
272 aa  77  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  38.1 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3077  NLPA lipoprotein  41.35 
 
 
283 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0360  putative ABC transporter, substrate-binding protein  41.18 
 
 
284 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4960  putative ABC transporter, substrate-binding protein  43.53 
 
 
284 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3386  putative outermembrane signal peptide protein  39.09 
 
 
529 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000211663  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  38.94 
 
 
270 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  40.96 
 
 
258 aa  77  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0787  D-methionine-binding lipoprotein metQ  37.86 
 
 
266 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0736  lipoprotein YaeC  37.04 
 
 
264 aa  76.3  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356479  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0272  NLPA lipoprotein  37.27 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0283  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.32 
 
 
271 aa  75.9  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188868  normal  0.293421 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0272  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.32 
 
 
271 aa  75.9  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.922304  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0343  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  42.35 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.32 
 
 
271 aa  75.9  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0381792  normal  0.291732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0286  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.32 
 
 
271 aa  75.9  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00047573  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.32 
 
 
271 aa  75.9  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.217766  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  39.47 
 
 
272 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0582  lipoprotein YaeC  33.93 
 
 
264 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3755  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  42.53 
 
 
271 aa  76.3  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000728433  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1020  YaeC family lipoprotein  33.93 
 
 
264 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0294  NLPA lipoprotein  41.18 
 
 
284 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1061  YaeC family lipoprotein  33.93 
 
 
264 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0283  lipoprotein ABC transporter substrate-binding protein  42.35 
 
 
280 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0286  lipoprotein ABC transporter substrate-binding protein  42.35 
 
 
280 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4843  YaeC family lipoprotein  42.98 
 
 
268 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3174  YaeC family lipoprotein  37.82 
 
 
269 aa  75.9  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0987485  hitchhiker  0.00336429 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0387  putative ABC transporter, substrate-binding protein  42.35 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5426  YaeC family lipoprotein  42.98 
 
 
268 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263894  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1777  NLPA lipoprotein  36.44 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28691  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>