More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0791 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0791  NLPA lipoprotein  100 
 
 		 262 aa  521  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.37545  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3221  NLPA lipoprotein  60.33 
 
 		 260 aa  308  5e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1614  NLPA lipoprotein  59.17 
 
 		 261 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.141443  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0562  NLPA lipoprotein  57.02 
 
 		 263 aa  299  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0786  NLPA lipoprotein  53.96 
 
 		 264 aa  272  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1127  NLPA lipoprotein  51.67 
 
 		 281 aa  254  8e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  48.09 
 
 		 259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  47.71 
 
 		 259 aa  243  3e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  49.01 
 
 		 258 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  49.01 
 
 		 258 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  47.06 
 
 		 266 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  47.17 
 
 		 264 aa  241  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  45.8 
 
 		 259 aa  236  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3789  lipoprotein, YaeC family  47.97 
 
 		 274 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  50.43 
 
 		 264 aa  236  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  48.62 
 
 		 258 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2455  NLPA lipoprotein  47.22 
 
 		 273 aa  231  7.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  47.28 
 
 		 272 aa  231  9e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2243  YaeC family lipoprotein  51.05 
 
 		 265 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1515  lipoprotein, YaeC family  48.06 
 
 		 266 aa  229  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2342  YaeC family lipoprotein  48.06 
 
 		 266 aa  229  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0736  lipoprotein YaeC  47.1 
 
 		 264 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  45.61 
 
 		 258 aa  228  8e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  45.9 
 
 		 270 aa  227  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0937  YaeC family lipoprotein  49.8 
 
 		 264 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  47.43 
 
 		 271 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0941  YaeC family lipoprotein  50 
 
 		 264 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0582  lipoprotein YaeC  50.42 
 
 		 264 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1061  YaeC family lipoprotein  50.42 
 
 		 264 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1020  YaeC family lipoprotein  50.42 
 
 		 264 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0997  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  49.38 
 
 		 265 aa  226  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.903774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4174  ABC metal ion transporter, periplasmic ligand binding protein  50 
 
 		 264 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436245  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  47.52 
 
 		 262 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  48.33 
 
 		 270 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3174  YaeC family lipoprotein  47.41 
 
 		 269 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0987485  hitchhiker  0.00336429 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  46.09 
 
 		 271 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  45.7 
 
 		 271 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  46.09 
 
 		 271 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  45.7 
 
 		 271 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  46.09 
 
 		 271 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  45.7 
 
 		 271 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  49.17 
 
 		 270 aa  223  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2369  NLPA lipoprotein  53.81 
 
 		 246 aa  223  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0617625  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2986  lipoprotein, YaeC family  48.96 
 
 		 265 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.00263956 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0792  lipoprotein, YaeC family  48.22 
 
 		 266 aa  221  8e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2551  lipoprotein YaeC  46.69 
 
 		 265 aa  221  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0863  lipoprotein, YaeC family  48.22 
 
 		 266 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136461  normal  0.522332 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4789  DL-methionine ABC transporter periplasmic-binding protein  46.92 
 
 		 270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  46.89 
 
 		 262 aa  219  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  45.7 
 
 		 271 aa  219  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  46.67 
 
 		 272 aa  219  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  46.25 
 
 		 281 aa  218  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  46.25 
 
 		 272 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3386  putative outermembrane signal peptide protein  45.68 
 
 		 529 aa  217  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000211663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  46.25 
 
 		 272 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  46.25 
 
 		 272 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  46.25 
 
 		 272 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  46.25 
 
 		 272 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  46.25 
 
 		 272 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0922  signal peptide protein  48.12 
 
 		 266 aa  216  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5162  lipoprotein, YaeC family  46.19 
 
 		 257 aa  216  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712142  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2539  YaeC family lipoprotein  47.64 
 
 		 281 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124943  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3285  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  44.79 
 
 		 258 aa  214  8e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1905  lipoprotein, YaeC family  42.32 
 
 		 286 aa  214  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.279671  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1612  lipoprotein, YaeC family  47.7 
 
 		 257 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  47.7 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1652  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  51.05 
 
 		 266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0177  ABC transporter substrate-binding protein  42.53 
 
 		 270 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000167969  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0167  NLPA family lipoprotein  42.53 
 
 		 270 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1501  D-methionine-binding lipoprotein metQ  45.17 
 
 		 269 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0175  ABC transporter substrate-binding protein  42.53 
 
 		 270 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104149  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2103  D-methionine-binding lipoprotein metQ  45.17 
 
 		 269 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0196  putative ABC transporter, substrate-binding protein  42.53 
 
 		 270 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0787  D-methionine-binding lipoprotein metQ  45.17 
 
 		 266 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0468  YaeC family lipoprotein  45.17 
 
 		 259 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0371  YaeC family lipoprotein  45.17 
 
 		 259 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3223  lipoprotein YaeC  46.03 
 
 		 257 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5426  YaeC family lipoprotein  44.86 
 
 		 268 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263894  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4843  YaeC family lipoprotein  44.86 
 
 		 268 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0197  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  42.15 
 
 		 270 aa  211  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000066517  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3271  lipoprotein, YaeC family  45.42 
 
 		 268 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000895864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3593  lipoprotein, YaeC family  45.42 
 
 		 268 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000081124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5310  YaeC family lipoprotein  45.45 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1802  D-methionine-binding lipoprotein metQ  44.79 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  44.02 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5436  lipoprotein YaeC  44.44 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4767  YaeC family lipoprotein  45.45 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3301  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  43.08 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal  0.569217 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0219  putative ABC transporter, substrate-binding protein  41.38 
 
 		 270 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433616  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0783  YaeC family lipoprotein  45.11 
 
 		 263 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0226  YaeC family lipoprotein  45.87 
 
 		 268 aa  209  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.951808 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2841  YaeC family lipoprotein  45.04 
 
 		 261 aa  209  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  44.79 
 
 		 260 aa  209  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  44.23 
 
 		 271 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.217766  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0286  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  44.23 
 
 		 271 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00047573  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0197  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  43.98 
 
 		 267 aa  209  5e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0272  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  44.23 
 
 		 271 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.922304  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  44.23 
 
 		 271 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0381792  normal  0.291732 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0283  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  44.23 
 
 		 271 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188868  normal  0.293421 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1999  methionine-binding protein  43.98 
 
 		 267 aa  209  5e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.344493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>