More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0446 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008835  BMA10229_2172  putative D-methionine-binding lipoprotein metQ  100 
 
 		 279 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.410212  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0856  putative D-methionine-binding lipoprotein metQ  100 
 
 		 279 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.672009  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0544  methionine ABC transporter periiplasmic amino-acid binding protein  99.64 
 
 		 279 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1441  putative D-methionine-binding lipoprotein metQ  100 
 
 		 279 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.404367  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0446  methionine ABC transporter periiplasmic amino-acid binding protein  100 
 
 		 279 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1864  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  99.6 
 
 		 248 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00940719  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3391  NLPA lipoprotein  82.5 
 
 		 283 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4537  NLPA lipoprotein  79.57 
 
 		 279 aa  447  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0309  NLPA lipoprotein  79.72 
 
 		 276 aa  447  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4929  NLPA lipoprotein  86.12 
 
 		 279 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.7748  normal  0.886888 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0852  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  77.78 
 
 		 279 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00818473  hitchhiker  0.0030003 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4689  NLPA lipoprotein  86.12 
 
 		 286 aa  441  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53578  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5339  NLPA lipoprotein  86.12 
 
 		 279 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5218  NLPA lipoprotein  86.53 
 
 		 286 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.431973 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3027  NLPA lipoprotein  86.1 
 
 		 257 aa  401  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.15305  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0237  NLPA lipoprotein  57.56 
 
 		 269 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31510  NLPA lipoprotein  56.67 
 
 		 273 aa  304  9.000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0866594  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4991  NLPA lipoprotein  57.69 
 
 		 266 aa  299  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0245  NLPA lipoprotein  59.34 
 
 		 266 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.590029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2364  NLPA lipoprotein  62.22 
 
 		 264 aa  297  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0111009  hitchhiker  0.00286659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5187  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  56.15 
 
 		 262 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0221  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  59.75 
 
 		 266 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542967  hitchhiker  0.00586587 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0351  NLPA lipoprotein  54.92 
 
 		 262 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0236  NLPA lipoprotein  59.34 
 
 		 266 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.643505 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34280  hypothetical protein  55.65 
 
 		 264 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.595717  decreased coverage  0.00469522 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2913  hypothetical protein  55.28 
 
 		 264 aa  275  8e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.828858  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4224  NLPA lipoprotein  50.96 
 
 		 266 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00732544 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1783  NLPA lipoprotein  52.7 
 
 		 264 aa  249  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1782  NLPA lipoprotein  50.21 
 
 		 268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2455  NLPA lipoprotein  50.21 
 
 		 273 aa  232  6e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7233  outer membrane lipoprotein  51.87 
 
 		 266 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2682  NLPA lipoprotein  46.69 
 
 		 271 aa  225  6e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1777  NLPA lipoprotein  47.08 
 
 		 274 aa  222  6e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0562  NLPA lipoprotein  45.27 
 
 		 263 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3221  NLPA lipoprotein  45.8 
 
 		 260 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1614  NLPA lipoprotein  43.7 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.141443  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2666  NLPA lipoprotein  44.49 
 
 		 264 aa  199  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4845  putative D-methionine-binding lipoprotein precursor  41.6 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.768272  normal  0.268623 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1127  NLPA lipoprotein  45.54 
 
 		 281 aa  189  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3174  YaeC family lipoprotein  41.22 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0987485  hitchhiker  0.00336429 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0786  NLPA lipoprotein  41.53 
 
 		 264 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2086  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  82.61 
 
 		 190 aa  185  7e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.557351  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  41.37 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0736  lipoprotein YaeC  40.15 
 
 		 264 aa  183  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1999  methionine-binding protein  43.93 
 
 		 267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.344493  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0197  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  43.93 
 
 		 267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2551  lipoprotein YaeC  42.45 
 
 		 265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3789  lipoprotein, YaeC family  41.97 
 
 		 274 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0791  NLPA lipoprotein  45.83 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.37545  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0960  YaeC family lipoprotein  38.35 
 
 		 278 aa  176  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1396  YaeC family lipoprotein  38.71 
 
 		 278 aa  176  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760284  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2243  YaeC family lipoprotein  42.86 
 
 		 265 aa  175  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  39.42 
 
 		 268 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  41.38 
 
 		 278 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  42.5 
 
 		 270 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  39.78 
 
 		 270 aa  169  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3593  lipoprotein, YaeC family  42.19 
 
 		 268 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000081124  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3386  putative outermembrane signal peptide protein  41.77 
 
 		 529 aa  169  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000211663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4843  YaeC family lipoprotein  42.08 
 
 		 268 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  40.17 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0997  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  40.65 
 
 		 265 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.903774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1612  lipoprotein, YaeC family  41.32 
 
 		 257 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5426  YaeC family lipoprotein  42.08 
 
 		 268 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263894  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  42.08 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  38.2 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  40.8 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.217766  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0286  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  40.8 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00047573  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0283  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  40.8 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188868  normal  0.293421 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4174  ABC metal ion transporter, periplasmic ligand binding protein  40.41 
 
 		 264 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436245  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  40.8 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0381792  normal  0.291732 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5436  lipoprotein YaeC  41.67 
 
 		 268 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0937  YaeC family lipoprotein  40.41 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0272  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  40.8 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.922304  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2369  NLPA lipoprotein  47.28 
 
 		 246 aa  166  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0617625  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1020  YaeC family lipoprotein  40.98 
 
 		 264 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0565  lipoprotein YaeC  37.84 
 
 		 258 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3223  lipoprotein YaeC  41.32 
 
 		 257 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0208  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  40.8 
 
 		 271 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0183748  normal  0.50615 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0582  lipoprotein YaeC  40.98 
 
 		 264 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1061  YaeC family lipoprotein  40.98 
 
 		 264 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  41.77 
 
 		 262 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3271  lipoprotein, YaeC family  40.93 
 
 		 268 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000895864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1102  D-methionine ABC transporter, periplasmic methionine-binding protein  36.65 
 
 		 272 aa  165  9e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001625  methionine ABC transporter substrate-binding protein  40.17 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00196  DL-methionine transporter subunit  40.4 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00228683  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3405  lipoprotein, YaeC family  40.4 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434725  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0191  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  40.4 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0075131  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0201  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  40.4 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3462  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  40.4 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000417542  normal  0.876119 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  40.91 
 
 		 272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0209  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  40.4 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.127497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0204  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  40.4 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000208912  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  41.91 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  41.91 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00195  hypothetical protein  40.4 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00217092  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3343  YaeC family lipoprotein  40.42 
 
 		 268 aa  163  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298632 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0863  lipoprotein, YaeC family  37.64 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136461  normal  0.522332 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  40.42 
 
 		 271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5086  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  39.11 
 
 		 272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.121383 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1072  lipoprotein 28  40.45 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>