More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0309 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0309  NLPA lipoprotein  100 
 
 
276 aa  557  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4929  NLPA lipoprotein  90.68 
 
 
279 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.7748  normal  0.886888 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5339  NLPA lipoprotein  90.68 
 
 
279 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3391  NLPA lipoprotein  87.99 
 
 
283 aa  497  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423711  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5218  NLPA lipoprotein  87.06 
 
 
286 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.431973 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4689  NLPA lipoprotein  86.71 
 
 
286 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53578  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3027  NLPA lipoprotein  90.66 
 
 
257 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.15305  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0544  methionine ABC transporter periiplasmic amino-acid binding protein  86.94 
 
 
279 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1441  putative D-methionine-binding lipoprotein metQ  86.94 
 
 
279 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.404367  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1864  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  86.94 
 
 
248 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00940719  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0856  putative D-methionine-binding lipoprotein metQ  86.94 
 
 
279 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.672009  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0446  methionine ABC transporter periiplasmic amino-acid binding protein  86.94 
 
 
279 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2172  putative D-methionine-binding lipoprotein metQ  86.94 
 
 
279 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.410212  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4537  NLPA lipoprotein  80.51 
 
 
279 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163083  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0852  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  86.01 
 
 
279 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00818473  hitchhiker  0.0030003 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31510  NLPA lipoprotein  59.46 
 
 
273 aa  310  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0866594  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4991  NLPA lipoprotein  57.41 
 
 
266 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2364  NLPA lipoprotein  62.18 
 
 
264 aa  300  3e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0111009  hitchhiker  0.00286659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0245  NLPA lipoprotein  57.03 
 
 
266 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.590029  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0237  NLPA lipoprotein  58.53 
 
 
269 aa  296  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200335  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34280  hypothetical protein  57.55 
 
 
264 aa  287  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.595717  decreased coverage  0.00469522 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2913  hypothetical protein  57.32 
 
 
264 aa  286  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.828858  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0221  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  57.79 
 
 
266 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542967  hitchhiker  0.00586587 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5187  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  56.97 
 
 
262 aa  280  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0236  NLPA lipoprotein  56.65 
 
 
266 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.643505 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0351  NLPA lipoprotein  56.56 
 
 
262 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4224  NLPA lipoprotein  50.95 
 
 
266 aa  253  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00732544 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1783  NLPA lipoprotein  51.45 
 
 
264 aa  250  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2455  NLPA lipoprotein  50.8 
 
 
273 aa  237  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1782  NLPA lipoprotein  51.04 
 
 
268 aa  232  5e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1777  NLPA lipoprotein  48.96 
 
 
274 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28691  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7233  outer membrane lipoprotein  51.61 
 
 
266 aa  223  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2682  NLPA lipoprotein  47.31 
 
 
271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0562  NLPA lipoprotein  45.93 
 
 
263 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1614  NLPA lipoprotein  45.49 
 
 
261 aa  205  7e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.141443  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3221  NLPA lipoprotein  45.8 
 
 
260 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2666  NLPA lipoprotein  44.31 
 
 
264 aa  201  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3174  YaeC family lipoprotein  41.22 
 
 
269 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0987485  hitchhiker  0.00336429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4845  putative D-methionine-binding lipoprotein precursor  42.97 
 
 
268 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.768272  normal  0.268623 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1127  NLPA lipoprotein  44.64 
 
 
281 aa  189  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  41.79 
 
 
266 aa  188  9e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2551  lipoprotein YaeC  41.7 
 
 
265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0197  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  41.35 
 
 
267 aa  183  3e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1999  methionine-binding protein  41.35 
 
 
267 aa  183  3e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.344493  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0565  lipoprotein YaeC  40.91 
 
 
258 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0791  NLPA lipoprotein  47.08 
 
 
262 aa  180  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.37545  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0736  lipoprotein YaeC  40.32 
 
 
264 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356479  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3789  lipoprotein, YaeC family  42.53 
 
 
274 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  42.08 
 
 
270 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2243  YaeC family lipoprotein  43.28 
 
 
265 aa  176  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567581  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0786  NLPA lipoprotein  40.74 
 
 
264 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122075  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3285  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  40.61 
 
 
258 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1072  lipoprotein 28  41.18 
 
 
259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2086  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  76.11 
 
 
190 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.557351  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  43.04 
 
 
278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3593  lipoprotein, YaeC family  42.19 
 
 
268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000081124  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  40.39 
 
 
265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  41.25 
 
 
268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0960  YaeC family lipoprotein  38.32 
 
 
278 aa  172  5e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3386  putative outermembrane signal peptide protein  40.93 
 
 
529 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000211663  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001625  methionine ABC transporter substrate-binding protein  39.45 
 
 
267 aa  170  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4174  ABC metal ion transporter, periplasmic ligand binding protein  40.73 
 
 
264 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436245  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2603  lipoprotein, YaeC family  37.64 
 
 
260 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.946899  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3271  lipoprotein, YaeC family  41.77 
 
 
268 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000895864  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1612  lipoprotein, YaeC family  41.29 
 
 
257 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  40.54 
 
 
270 aa  169  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  41.13 
 
 
271 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.217766  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4843  YaeC family lipoprotein  41.67 
 
 
268 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  41.13 
 
 
271 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0381792  normal  0.291732 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0283  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  41.13 
 
 
271 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188868  normal  0.293421 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0272  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  41.13 
 
 
271 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.922304  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0286  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  41.13 
 
 
271 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00047573  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5426  YaeC family lipoprotein  41.67 
 
 
268 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263894  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  41.91 
 
 
270 aa  169  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  39.83 
 
 
262 aa  168  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2369  NLPA lipoprotein  50.3 
 
 
246 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0617625  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  42.98 
 
 
262 aa  167  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1020  YaeC family lipoprotein  41.39 
 
 
264 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7906  NlpA lipoprotein  40.07 
 
 
278 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  43.55 
 
 
271 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0582  lipoprotein YaeC  41.39 
 
 
264 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5436  lipoprotein YaeC  41.25 
 
 
268 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0937  YaeC family lipoprotein  40.82 
 
 
264 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  43.55 
 
 
271 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1061  YaeC family lipoprotein  41.39 
 
 
264 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  40 
 
 
264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1515  lipoprotein, YaeC family  40.84 
 
 
266 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2539  YaeC family lipoprotein  40.77 
 
 
281 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124943  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2342  YaeC family lipoprotein  40.84 
 
 
266 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216371  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3343  YaeC family lipoprotein  41.25 
 
 
268 aa  166  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00298632 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3223  lipoprotein YaeC  40.15 
 
 
257 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0997  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  41.22 
 
 
265 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.903774  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1396  YaeC family lipoprotein  37.96 
 
 
278 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760284  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1247  nlpa lipoprotein  40 
 
 
259 aa  165  8e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3792  YaeC family lipoprotein  37.07 
 
 
265 aa  165  9e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.293535  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0863  lipoprotein, YaeC family  39.53 
 
 
266 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136461  normal  0.522332 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  41.85 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3462  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  39.31 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000417542  normal  0.876119 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4767  YaeC family lipoprotein  40.83 
 
 
268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1094  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  40.46 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>