More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0852 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0852  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  100 
 
 		 279 aa  566  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00818473  hitchhiker  0.0030003 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4537  NLPA lipoprotein  95.7 
 
 		 279 aa  548  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.163083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3391  NLPA lipoprotein  82.59 
 
 		 283 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4929  NLPA lipoprotein  88.07 
 
 		 279 aa  447  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.7748  normal  0.886888 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5218  NLPA lipoprotein  88.07 
 
 		 286 aa  448  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.431973 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4689  NLPA lipoprotein  88.07 
 
 		 286 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53578  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5339  NLPA lipoprotein  88.07 
 
 		 279 aa  447  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1441  putative D-methionine-binding lipoprotein metQ  85.02 
 
 		 279 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.404367  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0446  methionine ABC transporter periiplasmic amino-acid binding protein  85.02 
 
 		 279 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0309  NLPA lipoprotein  86.01 
 
 		 276 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0856  putative D-methionine-binding lipoprotein metQ  85.02 
 
 		 279 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.672009  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2172  putative D-methionine-binding lipoprotein metQ  85.02 
 
 		 279 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.410212  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1864  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  85.02 
 
 		 248 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00940719  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0544  methionine ABC transporter periiplasmic amino-acid binding protein  85.02 
 
 		 279 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3027  NLPA lipoprotein  88.69 
 
 		 257 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.15305  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4991  NLPA lipoprotein  59.62 
 
 		 266 aa  315  7e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0237  NLPA lipoprotein  58.3 
 
 		 269 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31510  NLPA lipoprotein  59.36 
 
 		 273 aa  311  5.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0866594  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0245  NLPA lipoprotein  60 
 
 		 266 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.590029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2364  NLPA lipoprotein  63.03 
 
 		 264 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0111009  hitchhiker  0.00286659 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34280  hypothetical protein  55.3 
 
 		 264 aa  297  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.595717  decreased coverage  0.00469522 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2913  hypothetical protein  55.3 
 
 		 264 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.828858  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0221  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  60.38 
 
 		 266 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.542967  hitchhiker  0.00586587 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0236  NLPA lipoprotein  59.62 
 
 		 266 aa  292  4e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.643505 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0351  NLPA lipoprotein  58.02 
 
 		 262 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5187  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  58.44 
 
 		 262 aa  289  4e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4224  NLPA lipoprotein  51.95 
 
 		 266 aa  265  5e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00732544 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1783  NLPA lipoprotein  51.04 
 
 		 264 aa  245  4.9999999999999997e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2455  NLPA lipoprotein  50.2 
 
 		 273 aa  237  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7233  outer membrane lipoprotein  52.46 
 
 		 266 aa  234  8e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1782  NLPA lipoprotein  49.38 
 
 		 268 aa  234  8e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2682  NLPA lipoprotein  48.67 
 
 		 271 aa  224  8e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1614  NLPA lipoprotein  46.06 
 
 		 261 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.141443  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0562  NLPA lipoprotein  45.49 
 
 		 263 aa  215  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1777  NLPA lipoprotein  45 
 
 		 274 aa  213  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3221  NLPA lipoprotein  46.37 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4845  putative D-methionine-binding lipoprotein precursor  43.37 
 
 		 268 aa  196  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.768272  normal  0.268623 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0197  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  44.35 
 
 		 267 aa  189  4e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2666  NLPA lipoprotein  42.32 
 
 		 264 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1999  methionine-binding protein  44.35 
 
 		 267 aa  189  4e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.344493  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1127  NLPA lipoprotein  43.98 
 
 		 281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3174  YaeC family lipoprotein  40.49 
 
 		 269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0987485  hitchhiker  0.00336429 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  39.39 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1612  lipoprotein, YaeC family  43.85 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0736  lipoprotein YaeC  39.61 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0786  NLPA lipoprotein  39.69 
 
 		 264 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0272  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  40.15 
 
 		 271 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.922304  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0960  YaeC family lipoprotein  38.31 
 
 		 278 aa  179  4e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0286  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  40.15 
 
 		 271 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00047573  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0283  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  40.15 
 
 		 271 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188868  normal  0.293421 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  40.15 
 
 		 271 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.217766  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  40.15 
 
 		 271 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0381792  normal  0.291732 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2243  YaeC family lipoprotein  42.08 
 
 		 265 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4843  YaeC family lipoprotein  45.68 
 
 		 268 aa  178  8e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2551  lipoprotein YaeC  39.3 
 
 		 265 aa  178  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5426  YaeC family lipoprotein  45.68 
 
 		 268 aa  178  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263894  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3755  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  41.11 
 
 		 271 aa  177  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000728433  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5436  lipoprotein YaeC  45.27 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3405  lipoprotein, YaeC family  38.75 
 
 		 271 aa  176  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434725  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3462  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.75 
 
 		 271 aa  176  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000417542  normal  0.876119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0209  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.75 
 
 		 271 aa  176  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.127497  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00196  DL-methionine transporter subunit  39.42 
 
 		 271 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00228683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0208  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  39.42 
 
 		 271 aa  176  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0183748  normal  0.50615 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00195  hypothetical protein  39.42 
 
 		 271 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00217092  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0204  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  39.42 
 
 		 271 aa  176  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000208912  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0201  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  39.42 
 
 		 271 aa  176  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0191  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  39.42 
 
 		 271 aa  176  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0075131  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3285  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  39.38 
 
 		 258 aa  175  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2086  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  76.52 
 
 		 190 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.557351  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  37.92 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3343  YaeC family lipoprotein  45.27 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298632 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2369  NLPA lipoprotein  41.43 
 
 		 246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0617625  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1396  YaeC family lipoprotein  37.93 
 
 		 278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760284  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  41.67 
 
 		 278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  43.15 
 
 		 265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  41.67 
 
 		 264 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3223  lipoprotein YaeC  40.98 
 
 		 257 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001625  methionine ABC transporter substrate-binding protein  40.23 
 
 		 267 aa  171  9e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3344  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  39.26 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  41.73 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0735  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.32 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.005469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3501  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  39.26 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000464416  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0565  lipoprotein YaeC  39.44 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  41.73 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  39.83 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1094  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  40.81 
 
 		 271 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174386  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1041  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  39.7 
 
 		 271 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0791  NLPA lipoprotein  45.19 
 
 		 262 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.37545  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5310  YaeC family lipoprotein  43.21 
 
 		 268 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  38.65 
 
 		 259 aa  169  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  41.73 
 
 		 271 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4767  YaeC family lipoprotein  43.21 
 
 		 268 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1102  D-methionine ABC transporter, periplasmic methionine-binding protein  35.02 
 
 		 272 aa  169  4e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  41.34 
 
 		 271 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  41.34 
 
 		 271 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  41.73 
 
 		 271 aa  169  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  41.34 
 
 		 271 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3789  lipoprotein, YaeC family  39.83 
 
 		 274 aa  169  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3407  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  39.33 
 
 		 271 aa  169  7e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3593  lipoprotein, YaeC family  41 
 
 		 268 aa  168  7e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000081124  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>