More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6691 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2242  glycine hydroxymethyltransferase  84.38 
 
 		 420 aa  723    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0554627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6691  Glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 418 aa  853    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.476522  normal  0.212987 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1537  serine hydroxymethyltransferase  76.37 
 
 		 427 aa  665    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.54072 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2509  serine hydroxymethyltransferase  74.82 
 
 		 420 aa  648    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0624  serine hydroxymethyltransferase  73.73 
 
 		 420 aa  627  1e-179  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.260999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0231  Glycine hydroxymethyltransferase  73.38 
 
 		 423 aa  614  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.681161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1644  serine hydroxymethyltransferase  70.33 
 
 		 420 aa  600  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172303 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3769  Glycine hydroxymethyltransferase  67.87 
 
 		 417 aa  588  1e-167  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.452166  normal  0.168004 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  56.2 
 
 		 417 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  56.69 
 
 		 417 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  56.2 
 
 		 417 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  55.8 
 
 		 415 aa  461  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  56.45 
 
 		 417 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2634  serine hydroxymethyltransferase  56.76 
 
 		 433 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  56.28 
 
 		 440 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  56.76 
 
 		 433 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  55.8 
 
 		 415 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  58.35 
 
 		 427 aa  459  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  56.28 
 
 		 415 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  56.28 
 
 		 415 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  54.35 
 
 		 415 aa  456  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  56.94 
 
 		 439 aa  456  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  56.17 
 
 		 420 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  56.7 
 
 		 438 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3004  serine hydroxymethyltransferase  56.04 
 
 		 432 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21133  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  56.7 
 
 		 438 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  51.45 
 
 		 412 aa  449  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  55.21 
 
 		 431 aa  448  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1389  Glycine hydroxymethyltransferase  54.48 
 
 		 427 aa  450  1e-125  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000692081  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  53.79 
 
 		 412 aa  450  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  56.9 
 
 		 437 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  54.11 
 
 		 413 aa  450  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  54.59 
 
 		 415 aa  449  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  53.14 
 
 		 412 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  53.38 
 
 		 411 aa  446  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1727  serine hydroxymethyltransferase  56.9 
 
 		 433 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130178 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  54.96 
 
 		 431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  53.16 
 
 		 416 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  54.35 
 
 		 414 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2240  serine hydroxymethyltransferase  55.34 
 
 		 436 aa  445  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.435156  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  54.96 
 
 		 431 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  53.38 
 
 		 432 aa  444  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0629  serine hydroxymethyltransferase  54.35 
 
 		 432 aa  442  1e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  53.86 
 
 		 412 aa  444  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  54.5 
 
 		 429 aa  443  1e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  54.24 
 
 		 431 aa  443  1e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1814  serine hydroxymethyltransferase  55.56 
 
 		 434 aa  442  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4276  glycine hydroxymethyltransferase  57.28 
 
 		 451 aa  444  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.514948  normal  0.0110039 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  55.77 
 
 		 417 aa  438  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000232  serine hydroxymethyltransferase  54.72 
 
 		 431 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  53.4 
 
 		 425 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  53.4 
 
 		 425 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2110  serine hydroxymethyltransferase  54.13 
 
 		 434 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0851  glycine hydroxymethyltransferase  53.48 
 
 		 419 aa  441  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0407045  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  56.28 
 
 		 432 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  54.83 
 
 		 411 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  52.42 
 
 		 412 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  54.09 
 
 		 412 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2187  Glycine hydroxymethyltransferase  50.96 
 
 		 418 aa  439  9.999999999999999e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  56.12 
 
 		 432 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  51.69 
 
 		 414 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  54.14 
 
 		 415 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05971  serine hydroxymethyltransferase  54.24 
 
 		 431 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  55.87 
 
 		 414 aa  436  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4649  serine hydroxymethyltransferase  54.83 
 
 		 434 aa  435  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.863224  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3956  serine hydroxymethyltransferase  54.65 
 
 		 434 aa  436  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  55.64 
 
 		 431 aa  435  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  55.84 
 
 		 410 aa  437  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1610  serine hydroxymethyltransferase  55.69 
 
 		 429 aa  432  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  52.05 
 
 		 412 aa  433  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  53.4 
 
 		 427 aa  431  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  53.81 
 
 		 423 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0745  serine hydroxymethyltransferase  53.86 
 
 		 415 aa  432  1e-120  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5022  serine hydroxymethyltransferase  53.77 
 
 		 424 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3094  glycine hydroxymethyltransferase  54.59 
 
 		 417 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  54.01 
 
 		 427 aa  433  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0389  serine hydroxymethyltransferase  51.72 
 
 		 436 aa  432  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285606 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  53.86 
 
 		 412 aa  432  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  54.83 
 
 		 416 aa  434  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  52.05 
 
 		 412 aa  433  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4027  glycine hydroxymethyltransferase  53.72 
 
 		 421 aa  434  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17117  normal  0.0123375 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  52.53 
 
 		 438 aa  434  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  52.78 
 
 		 424 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1155  serine hydroxymethyltransferase  52.07 
 
 		 436 aa  434  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  53.62 
 
 		 434 aa  433  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  55.32 
 
 		 410 aa  433  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  53.86 
 
 		 420 aa  432  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1833  serine hydroxymethyltransferase  53.22 
 
 		 423 aa  430  1e-119  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.785323  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3844  serine hydroxymethyltransferase  54.18 
 
 		 431 aa  429  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.988817  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  52.67 
 
 		 413 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0692  serine hydroxymethyltransferase  50.61 
 
 		 421 aa  431  1e-119  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.414357  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  52 
 
 		 423 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1827  serine hydroxymethyltransferase  51.68 
 
 		 430 aa  431  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.752619  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3717  serine hydroxymethyltransferase  56.62 
 
 		 418 aa  428  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.982412  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0218  serine hydroxymethyltransferase  50.73 
 
 		 419 aa  429  1e-119  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0240245  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  53.16 
 
 		 434 aa  431  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  53.14 
 
 		 433 aa  429  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  53.02 
 
 		 423 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1537  serine hydroxymethyltransferase  52.43 
 
 		 435 aa  429  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4497  serine hydroxymethyltransferase  53.28 
 
 		 424 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>