More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1644 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1644  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 420 aa  853    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172303 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2509  serine hydroxymethyltransferase  74.22 
 
 		 420 aa  649    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0624  serine hydroxymethyltransferase  73.1 
 
 		 420 aa  628  1e-179  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.260999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1537  serine hydroxymethyltransferase  71.5 
 
 		 427 aa  609  1e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.54072 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2242  glycine hydroxymethyltransferase  70.83 
 
 		 420 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0554627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0231  Glycine hydroxymethyltransferase  71.36 
 
 		 423 aa  599  1e-170  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.681161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6691  Glycine hydroxymethyltransferase  70.33 
 
 		 418 aa  600  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.476522  normal  0.212987 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3769  Glycine hydroxymethyltransferase  67.49 
 
 		 417 aa  567  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.452166  normal  0.168004 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  57.78 
 
 		 415 aa  474  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  58.19 
 
 		 413 aa  477  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  57.46 
 
 		 416 aa  474  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  56.68 
 
 		 415 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  56.9 
 
 		 427 aa  461  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  55.69 
 
 		 415 aa  462  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  56.19 
 
 		 415 aa  464  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  54.66 
 
 		 414 aa  464  1e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  56.68 
 
 		 415 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  55.64 
 
 		 417 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  55.39 
 
 		 415 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  55.2 
 
 		 415 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  56.23 
 
 		 427 aa  459  9.999999999999999e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0851  glycine hydroxymethyltransferase  56.1 
 
 		 419 aa  459  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0407045  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  53.53 
 
 		 412 aa  456  1e-127  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  53.77 
 
 		 412 aa  456  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  55.75 
 
 		 424 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  54.01 
 
 		 412 aa  451  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1389  Glycine hydroxymethyltransferase  54.41 
 
 		 427 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000692081  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  54.28 
 
 		 417 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  55.39 
 
 		 413 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  54.66 
 
 		 417 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  54.9 
 
 		 411 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  58.16 
 
 		 437 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  54.17 
 
 		 410 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  54.48 
 
 		 425 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  54.41 
 
 		 412 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  54.48 
 
 		 425 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  54.03 
 
 		 417 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  55.88 
 
 		 415 aa  449  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  57.96 
 
 		 431 aa  448  1e-125  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2305  serine hydroxymethyltransferase  54.74 
 
 		 434 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  53.92 
 
 		 410 aa  449  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  53.53 
 
 		 420 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  53.33 
 
 		 411 aa  445  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  55.5 
 
 		 429 aa  446  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  54.63 
 
 		 427 aa  447  1.0000000000000001e-124  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  54.17 
 
 		 411 aa  446  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2634  serine hydroxymethyltransferase  55.93 
 
 		 433 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  55.21 
 
 		 440 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  53.33 
 
 		 411 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  53.79 
 
 		 412 aa  443  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  54.96 
 
 		 433 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  55.21 
 
 		 439 aa  443  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  53.79 
 
 		 412 aa  443  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3004  serine hydroxymethyltransferase  55.69 
 
 		 432 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21133  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  54.96 
 
 		 438 aa  440  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  53.32 
 
 		 412 aa  441  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  52.68 
 
 		 412 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2187  Glycine hydroxymethyltransferase  52.53 
 
 		 418 aa  441  9.999999999999999e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  53.62 
 
 		 420 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  53.68 
 
 		 413 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  51.46 
 
 		 423 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1617  serine hydroxymethyltransferase  54.5 
 
 		 414 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  54.96 
 
 		 438 aa  441  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  57.11 
 
 		 417 aa  440  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0629  serine hydroxymethyltransferase  54.39 
 
 		 432 aa  436  1e-121  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  53.25 
 
 		 438 aa  437  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  55.16 
 
 		 432 aa  438  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  55.31 
 
 		 432 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3468  serine hydroxymethyltransferase  55.34 
 
 		 418 aa  435  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  54.03 
 
 		 423 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  51.21 
 
 		 423 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  54.66 
 
 		 416 aa  437  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  54.68 
 
 		 431 aa  435  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2240  serine hydroxymethyltransferase  53.51 
 
 		 436 aa  436  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.435156  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  53.25 
 
 		 423 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1610  serine hydroxymethyltransferase  54.83 
 
 		 429 aa  436  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  54.83 
 
 		 434 aa  436  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  54.11 
 
 		 412 aa  434  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  54.59 
 
 		 434 aa  432  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  52.48 
 
 		 415 aa  431  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  54.59 
 
 		 434 aa  432  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  53.19 
 
 		 413 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  53.41 
 
 		 418 aa  429  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1833  serine hydroxymethyltransferase  51.2 
 
 		 423 aa  429  1e-119  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.785323  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  53.62 
 
 		 433 aa  430  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  53.38 
 
 		 412 aa  431  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2076  serine hydroxymethyltransferase  54.88 
 
 		 427 aa  429  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.745833  hitchhiker  0.000706319 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  53.16 
 
 		 419 aa  429  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  52.97 
 
 		 432 aa  430  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4276  glycine hydroxymethyltransferase  55.69 
 
 		 451 aa  430  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.514948  normal  0.0110039 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  54.59 
 
 		 414 aa  429  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  50.25 
 
 		 414 aa  431  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1264  serine hydroxymethyltransferase  53.92 
 
 		 426 aa  429  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0959  Glycine hydroxymethyltransferase  53.27 
 
 		 410 aa  429  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.587194  normal  0.162631 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0469  serine hydroxymethyltransferase  53.88 
 
 		 474 aa  429  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996315  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  52.84 
 
 		 425 aa  429  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4802  serine hydroxymethyltransferase  57.33 
 
 		 427 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2110  serine hydroxymethyltransferase  53.86 
 
 		 434 aa  431  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1142  serine hydroxymethyltransferase  54.41 
 
 		 434 aa  427  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02841  serine hydroxymethyltransferase  51.59 
 
 		 416 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>