More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1177 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0629  serine hydroxymethyltransferase  75.12 
 
 
432 aa  662    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  80.05 
 
 
427 aa  710    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4649  serine hydroxymethyltransferase  74.65 
 
 
434 aa  640    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.863224  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  84.69 
 
 
438 aa  757    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2110  serine hydroxymethyltransferase  73.35 
 
 
434 aa  646    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  72.51 
 
 
431 aa  636    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1727  serine hydroxymethyltransferase  75.23 
 
 
433 aa  649    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.130178 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  73.46 
 
 
431 aa  644    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  74.58 
 
 
434 aa  667    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  74.88 
 
 
434 aa  668    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1610  serine hydroxymethyltransferase  90.89 
 
 
429 aa  813    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3956  serine hydroxymethyltransferase  73.76 
 
 
434 aa  657    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  74.88 
 
 
434 aa  668    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  89.56 
 
 
431 aa  801    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  97.69 
 
 
432 aa  870    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2634  serine hydroxymethyltransferase  75.64 
 
 
433 aa  663    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2240  serine hydroxymethyltransferase  74.05 
 
 
436 aa  651    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.435156  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  75.89 
 
 
440 aa  662    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  74.53 
 
 
433 aa  659    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 
432 aa  889    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  75.7 
 
 
433 aa  667    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1814  serine hydroxymethyltransferase  75.7 
 
 
434 aa  658    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  85.14 
 
 
439 aa  751    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1579  serine hydroxymethyltransferase  72.03 
 
 
431 aa  638    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  84.92 
 
 
438 aa  761    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  82.71 
 
 
437 aa  747    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  73.7 
 
 
431 aa  644    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3004  serine hydroxymethyltransferase  75.06 
 
 
432 aa  651    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21133  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  71.76 
 
 
438 aa  625  1e-178  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0821  serine hydroxymethyltransferase  70.48 
 
 
431 aa  622  1e-177  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3104  serine hydroxymethyltransferase  72.34 
 
 
433 aa  622  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.425727  decreased coverage  0.00549191 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2991  serine hydroxymethyltransferase  71.56 
 
 
439 aa  621  1e-177  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.406931  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4276  glycine hydroxymethyltransferase  74.52 
 
 
451 aa  620  1e-176  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.514948  normal  0.0110039 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3404  serine hydroxymethyltransferase  71.23 
 
 
433 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5297  serine hydroxymethyltransferase  71.23 
 
 
433 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2123  serine hydroxymethyltransferase  70.12 
 
 
432 aa  588  1e-167  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.607283  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1537  serine hydroxymethyltransferase  67.38 
 
 
435 aa  590  1e-167  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0106  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3047  serine hydroxymethyltransferase  69.56 
 
 
434 aa  585  1e-166  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.302237  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8588  serine hydroxymethyltransferase  67.88 
 
 
420 aa  579  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1827  serine hydroxymethyltransferase  67.86 
 
 
430 aa  580  1e-164  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.752619  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2113  serine hydroxymethyltransferase  68.61 
 
 
424 aa  574  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332542  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4822  serine hydroxymethyltransferase  64.24 
 
 
424 aa  565  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1585  serine hydroxymethyltransferase  64.52 
 
 
424 aa  565  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592814  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3546  serine hydroxymethyltransferase  64 
 
 
424 aa  565  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0055  serine hydroxymethyltransferase  64 
 
 
424 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1006  serine hydroxymethyltransferase  63.55 
 
 
424 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0471  serine hydroxymethyltransferase  63.55 
 
 
424 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1979  serine hydroxymethyltransferase  63.55 
 
 
424 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00954911  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  63.32 
 
 
432 aa  559  1e-158  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0710  serine hydroxymethyltransferase  63.32 
 
 
424 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0740  serine hydroxymethyltransferase  63.32 
 
 
424 aa  558  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2283  glycine hydroxymethyltransferase  66.35 
 
 
425 aa  556  1e-157  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90339 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2106  serine hydroxymethyltransferase  63.32 
 
 
424 aa  558  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0870  glycine hydroxymethyltransferase  67.63 
 
 
424 aa  556  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0571  serine hydroxymethyltransferase  63.76 
 
 
424 aa  557  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5063  serine hydroxymethyltransferase  63.81 
 
 
424 aa  557  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0644659  normal  0.0156096 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4497  serine hydroxymethyltransferase  63.53 
 
 
424 aa  555  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0828  serine hydroxymethyltransferase  63.32 
 
 
424 aa  558  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5022  serine hydroxymethyltransferase  63.29 
 
 
424 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3303  serine hydroxymethyltransferase  62.62 
 
 
424 aa  552  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282627  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1131  serine hydroxymethyltransferase  64.72 
 
 
438 aa  552  1e-156  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.584691  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1868  serine hydroxymethyltransferase  62.62 
 
 
424 aa  552  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5200  serine hydroxymethyltransferase  63.29 
 
 
424 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3283  serine hydroxymethyltransferase  63.29 
 
 
424 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0169  serine hydroxymethyltransferase  64.34 
 
 
422 aa  552  1e-156  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5085  serine hydroxymethyltransferase  63.29 
 
 
424 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.750126 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0692  serine hydroxymethyltransferase  62.35 
 
 
421 aa  543  1e-153  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.414357  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000232  serine hydroxymethyltransferase  64.55 
 
 
431 aa  540  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0307  serine hydroxymethyltransferase  62.88 
 
 
414 aa  535  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.209874  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  63.12 
 
 
415 aa  536  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6867  glycine hydroxymethyltransferase  62.09 
 
 
431 aa  535  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.592385 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0791  serine hydroxymethyltransferase  63.81 
 
 
435 aa  537  1e-151  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0375384  normal  0.0421873 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05971  serine hydroxymethyltransferase  63.15 
 
 
431 aa  533  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0834  serine hydroxymethyltransferase  63.12 
 
 
415 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3196  serine hydroxymethyltransferase  63.12 
 
 
415 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  63.16 
 
 
417 aa  533  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  63.12 
 
 
415 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2075  serine hydroxymethyltransferase  63.12 
 
 
415 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1942  serine hydroxymethyltransferase  63.12 
 
 
415 aa  532  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3250  serine hydroxymethyltransferase  63.12 
 
 
415 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2927  serine hydroxymethyltransferase  63.88 
 
 
415 aa  533  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1887  Glycine hydroxymethyltransferase  60.95 
 
 
419 aa  533  1e-150  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409267  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1379  serine hydroxymethyltransferase  62.88 
 
 
415 aa  531  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2680  serine hydroxymethyltransferase  62.76 
 
 
508 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  62.68 
 
 
417 aa  533  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  61.67 
 
 
417 aa  531  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3234  serine hydroxymethyltransferase  63.12 
 
 
415 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1035  serine hydroxymethyltransferase  60.58 
 
 
425 aa  528  1e-149  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  61.43 
 
 
417 aa  529  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0952  serine hydroxymethyltransferase  63.7 
 
 
435 aa  530  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  61.67 
 
 
417 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0790  serine hydroxymethyltransferase  62.88 
 
 
415 aa  528  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  61.27 
 
 
427 aa  530  1e-149  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  61.67 
 
 
417 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0323  serine hydroxymethyltransferase  63.59 
 
 
415 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  61.43 
 
 
417 aa  529  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1033  serine hydroxymethyltransferase  61.96 
 
 
417 aa  531  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414818  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0678  serine hydroxymethyltransferase  63.36 
 
 
415 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.478588 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0806  serine hydroxymethyltransferase  63.59 
 
 
415 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2658  serine hydroxymethyltransferase  62.17 
 
 
414 aa  526  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0261213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>