More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2082 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 419 aa  860    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  65.38 
 
 		 414 aa  558  1e-158  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  64.48 
 
 		 427 aa  560  1e-158  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  65.52 
 
 		 415 aa  555  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  64.95 
 
 		 416 aa  556  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  66.09 
 
 		 415 aa  555  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  65.84 
 
 		 415 aa  555  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  63.13 
 
 		 413 aa  552  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  64.72 
 
 		 413 aa  548  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  65.59 
 
 		 415 aa  549  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  66.91 
 
 		 412 aa  550  1e-155  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  64.48 
 
 		 415 aa  545  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  66.91 
 
 		 412 aa  547  1e-154  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  64.95 
 
 		 415 aa  545  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  64.46 
 
 		 415 aa  546  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  65.2 
 
 		 418 aa  542  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  65.21 
 
 		 417 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  63.97 
 
 		 411 aa  539  9.999999999999999e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  62.56 
 
 		 422 aa  541  9.999999999999999e-153  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1617  serine hydroxymethyltransferase  64.96 
 
 		 414 aa  535  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  59.85 
 
 		 412 aa  536  1e-151  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  62.38 
 
 		 411 aa  537  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  63.17 
 
 		 417 aa  535  1e-151  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  62.71 
 
 		 412 aa  536  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  61.46 
 
 		 424 aa  536  1e-151  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  62.2 
 
 		 425 aa  537  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  62.74 
 
 		 417 aa  532  1e-150  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2432  serine hydroxymethyltransferase  66.42 
 
 		 412 aa  534  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139104  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  61.65 
 
 		 412 aa  533  1e-150  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  61.48 
 
 		 422 aa  533  1e-150  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  61.37 
 
 		 412 aa  531  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  61.26 
 
 		 412 aa  531  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  64.25 
 
 		 417 aa  529  1e-149  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  61.74 
 
 		 413 aa  529  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  61.35 
 
 		 414 aa  529  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  61.35 
 
 		 414 aa  529  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  61.59 
 
 		 414 aa  530  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  62.26 
 
 		 417 aa  529  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  62.77 
 
 		 420 aa  529  1e-149  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  63.41 
 
 		 420 aa  530  1e-149  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  61.26 
 
 		 412 aa  531  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  61.74 
 
 		 413 aa  531  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  63.01 
 
 		 438 aa  530  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  62.47 
 
 		 410 aa  529  1e-149  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  61.8 
 
 		 413 aa  527  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  61.31 
 
 		 425 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  61.31 
 
 		 425 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  62.53 
 
 		 431 aa  525  1e-148  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  61.5 
 
 		 413 aa  528  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  62.02 
 
 		 417 aa  527  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  61.56 
 
 		 413 aa  526  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  61.5 
 
 		 413 aa  527  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  62.75 
 
 		 413 aa  524  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4031  serine hydroxymethyltransferase  62.14 
 
 		 417 aa  522  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  62.59 
 
 		 415 aa  521  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  61.99 
 
 		 410 aa  524  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  58.64 
 
 		 414 aa  521  1e-147  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  60.92 
 
 		 412 aa  520  1e-146  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2477  serine hydroxymethyltransferase  61.65 
 
 		 417 aa  519  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  60.83 
 
 		 413 aa  520  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  60.61 
 
 		 427 aa  520  1e-146  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  60.61 
 
 		 427 aa  521  1e-146  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2076  serine hydroxymethyltransferase  61.22 
 
 		 427 aa  518  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.745833  hitchhiker  0.000706319 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  60.77 
 
 		 413 aa  521  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  62.5 
 
 		 413 aa  521  1e-146  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  58.84 
 
 		 423 aa  519  1e-146  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  60.19 
 
 		 412 aa  519  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  58.84 
 
 		 423 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  59.22 
 
 		 412 aa  520  1e-146  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2312  serine hydroxymethyltransferase  61.27 
 
 		 412 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.297378  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  59.02 
 
 		 427 aa  517  1.0000000000000001e-145  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  62.84 
 
 		 417 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  59.47 
 
 		 416 aa  514  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  60.58 
 
 		 417 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  57.04 
 
 		 414 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0064  serine hydroxymethyltransferase  64.23 
 
 		 412 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 		 437 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2311  Glycine hydroxymethyltransferase  59.27 
 
 		 466 aa  513  1e-144  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000314902  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0389  serine hydroxymethyltransferase  60.14 
 
 		 436 aa  511  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285606 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  62.1 
 
 		 416 aa  514  1e-144  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  60.63 
 
 		 434 aa  513  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  58.17 
 
 		 423 aa  511  1e-144  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  60.72 
 
 		 434 aa  513  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  59.32 
 
 		 413 aa  513  1e-144  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  58.94 
 
 		 423 aa  514  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  60.72 
 
 		 434 aa  513  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0417  serine hydroxymethyltransferase  60.88 
 
 		 420 aa  514  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6283  glycine hydroxymethyltransferase  62.77 
 
 		 419 aa  511  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3956  serine hydroxymethyltransferase  61.35 
 
 		 434 aa  511  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0373  serine hydroxymethyltransferase  63.17 
 
 		 419 aa  511  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.238829  normal  0.155765 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  60.68 
 
 		 415 aa  514  1e-144  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1155  serine hydroxymethyltransferase  59.35 
 
 		 436 aa  514  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0671  serine hydroxymethyltransferase  62.1 
 
 		 417 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.557812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2762  serine hydroxymethyltransferase  60.73 
 
 		 417 aa  509  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  59.52 
 
 		 439 aa  508  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0702  serine hydroxymethyltransferase  62.1 
 
 		 417 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0603318  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2083  serine hydroxymethyltransferase  61.2 
 
 		 418 aa  510  1e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  61.86 
 
 		 417 aa  509  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1610  serine hydroxymethyltransferase  59.04 
 
 		 429 aa  508  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  57.38 
 
 		 423 aa  511  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>