More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2311 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_2311  Glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 466 aa  957    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000314902  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  61.71 
 
 		 412 aa  539  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  62.93 
 
 		 413 aa  538  1e-151  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  64.01 
 
 		 415 aa  535  1e-151  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  63.17 
 
 		 414 aa  532  1e-150  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  61.93 
 
 		 422 aa  533  1e-150  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  62.1 
 
 		 415 aa  529  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  61.86 
 
 		 415 aa  527  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  63.22 
 
 		 427 aa  527  1e-148  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  63.22 
 
 		 427 aa  527  1e-148  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 		 423 aa  526  1e-148  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  61.07 
 
 		 415 aa  523  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  61.82 
 
 		 412 aa  523  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 		 437 aa  522  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  62.44 
 
 		 413 aa  522  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  62.44 
 
 		 411 aa  523  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  61.23 
 
 		 412 aa  518  1e-146  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  61.86 
 
 		 413 aa  518  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  62.1 
 
 		 414 aa  518  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  62.1 
 
 		 414 aa  520  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  61.86 
 
 		 414 aa  518  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  61.71 
 
 		 412 aa  518  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  62.1 
 
 		 413 aa  521  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  59.13 
 
 		 424 aa  521  1e-146  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  61.86 
 
 		 413 aa  518  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  62.1 
 
 		 413 aa  521  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  62.1 
 
 		 413 aa  518  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  62.32 
 
 		 412 aa  520  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  62.32 
 
 		 412 aa  520  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  62.1 
 
 		 413 aa  520  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  61.61 
 
 		 413 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 418 aa  515  1.0000000000000001e-145  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  60.64 
 
 		 415 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  61.37 
 
 		 413 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  59.27 
 
 		 419 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  59.52 
 
 		 415 aa  517  1.0000000000000001e-145  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1610  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 		 429 aa  513  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  61 
 
 		 438 aa  513  1e-144  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 		 416 aa  513  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1887  Glycine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 		 419 aa  511  1e-144  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  61.86 
 
 		 410 aa  514  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  61 
 
 		 439 aa  514  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  59.12 
 
 		 415 aa  508  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0127  Glycine hydroxymethyltransferase  56.84 
 
 		 435 aa  510  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  59.13 
 
 		 417 aa  508  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  60.77 
 
 		 438 aa  511  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  60.38 
 
 		 432 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  59.66 
 
 		 415 aa  509  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  61.61 
 
 		 410 aa  511  1e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0821  serine hydroxymethyltransferase  58.8 
 
 		 431 aa  511  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  60.14 
 
 		 432 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  59.41 
 
 		 413 aa  505  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  61.2 
 
 		 417 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  59.28 
 
 		 431 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  59.28 
 
 		 431 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  59.85 
 
 		 412 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  59.28 
 
 		 431 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1579  serine hydroxymethyltransferase  59.2 
 
 		 431 aa  507  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  59.13 
 
 		 417 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  58.89 
 
 		 417 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3956  serine hydroxymethyltransferase  58.65 
 
 		 434 aa  504  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 		 438 aa  504  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  57.93 
 
 		 427 aa  503  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  59.19 
 
 		 431 aa  504  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  59.8 
 
 		 416 aa  502  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4276  glycine hydroxymethyltransferase  62.5 
 
 		 451 aa  504  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.514948  normal  0.0110039 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 		 422 aa  503  1e-141  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  57.55 
 
 		 432 aa  503  1e-141  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2240  serine hydroxymethyltransferase  58.8 
 
 		 436 aa  502  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.435156  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6867  glycine hydroxymethyltransferase  58.57 
 
 		 431 aa  504  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.592385 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  59.42 
 
 		 417 aa  501  1e-141  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  56.97 
 
 		 414 aa  503  1e-141  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0322  serine hydroxymethyltransferase  58.97 
 
 		 417 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457346  decreased coverage  0.0000286459 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  57.93 
 
 		 417 aa  501  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0345  serine hydroxymethyltransferase  58.97 
 
 		 417 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.911009 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0344  serine hydroxymethyltransferase  58.97 
 
 		 417 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.963128 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4712  serine hydroxymethyltransferase  58.48 
 
 		 417 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5208  serine hydroxymethyltransferase  58.72 
 
 		 417 aa  498  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0287253 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1827  serine hydroxymethyltransferase  58.15 
 
 		 430 aa  500  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.752619  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2634  serine hydroxymethyltransferase  57.93 
 
 		 433 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2991  serine hydroxymethyltransferase  59.04 
 
 		 439 aa  499  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.406931  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  60.58 
 
 		 440 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04405  serine hydroxymethyltransferase  58.27 
 
 		 417 aa  500  1e-140  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  58.21 
 
 		 417 aa  499  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  59.39 
 
 		 433 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  58.15 
 
 		 412 aa  499  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  58.19 
 
 		 411 aa  499  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  59.04 
 
 		 434 aa  499  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  59.62 
 
 		 417 aa  501  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1660  serine hydroxymethyltransferase  58.37 
 
 		 418 aa  495  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0479076  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2477  serine hydroxymethyltransferase  58.72 
 
 		 417 aa  497  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4031  serine hydroxymethyltransferase  58.97 
 
 		 417 aa  497  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  58.8 
 
 		 434 aa  496  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4877  serine hydroxymethyltransferase  58.37 
 
 		 417 aa  495  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.402887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  58.8 
 
 		 434 aa  496  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3004  serine hydroxymethyltransferase  58.69 
 
 		 432 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21133  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 		 417 aa  497  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1537  serine hydroxymethyltransferase  59.28 
 
 		 435 aa  497  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  57.49 
 
 		 417 aa  497  1e-139  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  58.92 
 
 		 413 aa  495  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>