More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4712 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0322  serine hydroxymethyltransferase  93.05 
 
 		 417 aa  812    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457346  decreased coverage  0.0000286459 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0671  serine hydroxymethyltransferase  78.85 
 
 		 417 aa  681    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.557812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6203  serine hydroxymethyltransferase  87.77 
 
 		 417 aa  768    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0377267  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2477  serine hydroxymethyltransferase  76.02 
 
 		 417 aa  676    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4031  serine hydroxymethyltransferase  75.78 
 
 		 417 aa  673    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0461  serine hydroxymethyltransferase  97.84 
 
 		 417 aa  848    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4632  serine hydroxymethyltransferase  79.09 
 
 		 417 aa  684    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10278  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6283  glycine hydroxymethyltransferase  76.02 
 
 		 419 aa  661    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4270  serine hydroxymethyltransferase  79.33 
 
 		 417 aa  686    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4712  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 417 aa  861    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0702  serine hydroxymethyltransferase  78.85 
 
 		 417 aa  681    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0603318  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  73.08 
 
 		 417 aa  635    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4877  serine hydroxymethyltransferase  79.33 
 
 		 417 aa  686    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.402887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5208  serine hydroxymethyltransferase  93.29 
 
 		 417 aa  816    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0287253 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1344  serine hydroxymethyltransferase  85.58 
 
 		 417 aa  741    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3094  glycine hydroxymethyltransferase  86.54 
 
 		 417 aa  736    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0703  serine hydroxymethyltransferase  78.85 
 
 		 417 aa  680    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  78.85 
 
 		 417 aa  683    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  80.05 
 
 		 417 aa  690    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1402  glycine hydroxymethyltransferase  74.47 
 
 		 423 aa  641    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.523534  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1871  Glycine hydroxymethyltransferase  74.04 
 
 		 417 aa  651    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4885  serine hydroxymethyltransferase  92.09 
 
 		 417 aa  805    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.994809  normal  0.551008 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2617  serine hydroxymethyltransferase  77.2 
 
 		 420 aa  639    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.573262  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  81.73 
 
 		 417 aa  706    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0345  serine hydroxymethyltransferase  93.05 
 
 		 417 aa  812    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.911009 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  73.32 
 
 		 416 aa  642    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0344  serine hydroxymethyltransferase  93.05 
 
 		 417 aa  812    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.963128 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  72.9 
 
 		 417 aa  634    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0373  serine hydroxymethyltransferase  74.34 
 
 		 419 aa  640    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.238829  normal  0.155765 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2807  serine hydroxymethyltransferase  85.1 
 
 		 418 aa  729    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0316342  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4132  serine hydroxymethyltransferase  87.29 
 
 		 417 aa  766    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000588766  normal  0.517769 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33010  serine hydroxymethyltransferase  85.1 
 
 		 418 aa  728    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.821039  hitchhiker  0.000096337 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  81.49 
 
 		 417 aa  702    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71460  serine hydroxymethyltransferase  88.01 
 
 		 417 aa  771    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0197843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4513  serine hydroxymethyltransferase  79.33 
 
 		 417 aa  684    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0695784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  82.21 
 
 		 417 aa  707    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1660  serine hydroxymethyltransferase  73.32 
 
 		 418 aa  632  1e-180  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0479076  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1438  glycine hydroxymethyltransferase  73.1 
 
 		 421 aa  631  1e-180  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0417  serine hydroxymethyltransferase  70.71 
 
 		 420 aa  630  1e-179  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0290  serine hydroxymethyltransferase  70.91 
 
 		 418 aa  624  1e-178  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  72.9 
 
 		 417 aa  627  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  72.66 
 
 		 417 aa  626  1e-178  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0318  serine hydroxymethyltransferase  71.39 
 
 		 418 aa  624  1e-178  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  72.66 
 
 		 417 aa  625  1e-178  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  72.9 
 
 		 417 aa  627  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  71.7 
 
 		 417 aa  621  1e-177  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  72.18 
 
 		 417 aa  622  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1271  serine hydroxymethyltransferase  74.58 
 
 		 418 aa  622  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0190768  hitchhiker  0.0000000260567 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2083  serine hydroxymethyltransferase  71.46 
 
 		 418 aa  623  1e-177  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1887  Glycine hydroxymethyltransferase  71.88 
 
 		 419 aa  624  1e-177  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  71.94 
 
 		 417 aa  621  1e-177  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  72.66 
 
 		 417 aa  624  1e-177  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  71.7 
 
 		 417 aa  621  1e-177  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1380  serine hydroxymethyltransferase  73.86 
 
 		 418 aa  620  1e-176  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.105108  hitchhiker  0.000029211 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  71.7 
 
 		 417 aa  620  1e-176  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  71.7 
 
 		 417 aa  620  1e-176  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  71.46 
 
 		 417 aa  618  1e-176  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2762  serine hydroxymethyltransferase  71.22 
 
 		 417 aa  614  1e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1160  serine hydroxymethyltransferase  73.38 
 
 		 418 aa  615  1e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000110651  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1033  serine hydroxymethyltransferase  71.22 
 
 		 417 aa  614  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414818  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2027  glycine hydroxymethyltransferase  70.67 
 
 		 417 aa  611  9.999999999999999e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  70.98 
 
 		 417 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3044  serine hydroxymethyltransferase  70.98 
 
 		 417 aa  612  9.999999999999999e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.196975  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1231  serine hydroxymethyltransferase  70.5 
 
 		 417 aa  609  1e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1912  serine hydroxymethyltransferase  70.33 
 
 		 430 aa  609  1e-173  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.637321  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04405  serine hydroxymethyltransferase  69.78 
 
 		 417 aa  606  9.999999999999999e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02443  serine hydroxymethyltransferase  72.18 
 
 		 417 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1117  Glycine hydroxymethyltransferase  72.18 
 
 		 417 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.796866  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02987  serine hydroxymethyltransferase  71.77 
 
 		 418 aa  601  1.0000000000000001e-171  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00150285  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2836  serine hydroxymethyltransferase  72.18 
 
 		 417 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0791  serine hydroxymethyltransferase  69.47 
 
 		 417 aa  602  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0762  serine hydroxymethyltransferase  69.95 
 
 		 417 aa  603  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02407  hypothetical protein  72.18 
 
 		 417 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3784  serine hydroxymethyltransferase  72.18 
 
 		 417 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2704  serine hydroxymethyltransferase  72.18 
 
 		 417 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1126  serine hydroxymethyltransferase  72.18 
 
 		 417 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1851  serine hydroxymethyltransferase  69.62 
 
 		 417 aa  602  1.0000000000000001e-171  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0445  serine hydroxymethyltransferase  70.02 
 
 		 417 aa  601  1.0000000000000001e-171  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000471586  hitchhiker  0.0000012571 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3638  serine hydroxymethyltransferase  70.02 
 
 		 417 aa  601  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1265  serine hydroxymethyltransferase  70.02 
 
 		 417 aa  601  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000077829  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1158  serine hydroxymethyltransferase  70.02 
 
 		 417 aa  601  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000444868  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2916  serine hydroxymethyltransferase  72.18 
 
 		 417 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2704  serine hydroxymethyltransferase  72.18 
 
 		 417 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1299  serine hydroxymethyltransferase  73.14 
 
 		 418 aa  600  1e-170  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0505032  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2755  serine hydroxymethyltransferase  71.46 
 
 		 417 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.418331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2710  serine hydroxymethyltransferase  71.46 
 
 		 417 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2796  serine hydroxymethyltransferase  71.46 
 
 		 417 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2930  serine hydroxymethyltransferase  71.46 
 
 		 417 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2817  serine hydroxymethyltransferase  71.46 
 
 		 417 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3036  serine hydroxymethyltransferase  70.98 
 
 		 417 aa  592  1e-168  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.603855  normal  0.847682 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1627  serine hydroxymethyltransferase  69.93 
 
 		 419 aa  587  1e-166  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0864  serine hydroxymethyltransferase  69.47 
 
 		 416 aa  582  1.0000000000000001e-165  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004230  serine hydroxymethyltransferase  69.23 
 
 		 416 aa  579  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000024605  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01208  serine hydroxymethyltransferase  69.47 
 
 		 416 aa  578  1e-164  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0465  serine hydroxymethyltransferase  69.23 
 
 		 435 aa  578  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.804501  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3838  serine hydroxymethyltransferase  66.9 
 
 		 423 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0004  serine hydroxymethyltransferase  64.99 
 
 		 417 aa  575  1.0000000000000001e-163  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.461407  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3707  serine hydroxymethyltransferase  65.72 
 
 		 424 aa  570  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.990227  normal  0.0196042 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0577  serine hydroxymethyltransferase  64.75 
 
 		 419 aa  566  1e-160  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1580  serine hydroxymethyltransferase  64.51 
 
 		 419 aa  563  1.0000000000000001e-159  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>