More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1895 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  99.51 
 
 		 410 aa  839    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 410 aa  843    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  70.56 
 
 		 415 aa  595  1e-169  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  70.87 
 
 		 411 aa  594  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  69.51 
 
 		 413 aa  591  1e-168  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  69.68 
 
 		 414 aa  591  1e-168  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  69.51 
 
 		 413 aa  591  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  69.78 
 
 		 415 aa  591  1e-168  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  70 
 
 		 413 aa  592  1e-168  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  69.44 
 
 		 414 aa  590  1e-167  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  69.44 
 
 		 414 aa  590  1e-167  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  69.27 
 
 		 413 aa  590  1e-167  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  69.27 
 
 		 413 aa  590  1e-167  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  69.27 
 
 		 413 aa  591  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  69.29 
 
 		 415 aa  587  1e-166  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  67.81 
 
 		 415 aa  585  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  69.02 
 
 		 413 aa  586  1e-166  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  68.55 
 
 		 415 aa  585  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  68.45 
 
 		 412 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  67.32 
 
 		 415 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  67.8 
 
 		 413 aa  579  1e-164  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  67.32 
 
 		 415 aa  579  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  67.73 
 
 		 416 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  68.87 
 
 		 412 aa  576  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  66.83 
 
 		 412 aa  574  1.0000000000000001e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  68.32 
 
 		 417 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  68.87 
 
 		 412 aa  576  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  68.05 
 
 		 413 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  68.3 
 
 		 413 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  65.94 
 
 		 420 aa  568  1e-161  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  67.65 
 
 		 412 aa  568  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  65.38 
 
 		 418 aa  565  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  64.39 
 
 		 412 aa  563  1.0000000000000001e-159  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  66.91 
 
 		 412 aa  558  1e-158  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  64.27 
 
 		 424 aa  561  1e-158  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  64.3 
 
 		 413 aa  556  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  61.67 
 
 		 414 aa  554  1e-157  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  64.03 
 
 		 422 aa  551  1e-156  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  63.81 
 
 		 412 aa  553  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  66.25 
 
 		 414 aa  553  1e-156  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  63.77 
 
 		 415 aa  553  1e-156  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  65.11 
 
 		 413 aa  548  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  62.53 
 
 		 414 aa  548  1e-155  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0745  serine hydroxymethyltransferase  63.48 
 
 		 415 aa  545  1e-154  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  63.79 
 
 		 427 aa  545  1e-154  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  63.79 
 
 		 427 aa  544  1e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  64.39 
 
 		 420 aa  543  1e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  62.86 
 
 		 411 aa  542  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  63.55 
 
 		 423 aa  538  9.999999999999999e-153  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  62.1 
 
 		 431 aa  536  1e-151  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  62.62 
 
 		 427 aa  537  1e-151  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  62.29 
 
 		 423 aa  534  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  61.95 
 
 		 415 aa  532  1e-150  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  64.88 
 
 		 412 aa  534  1e-150  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1155  serine hydroxymethyltransferase  58.69 
 
 		 436 aa  532  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  64.63 
 
 		 412 aa  528  1e-149  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  61.31 
 
 		 423 aa  531  1e-149  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  64.13 
 
 		 417 aa  529  1e-149  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0389  serine hydroxymethyltransferase  58.92 
 
 		 436 aa  530  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285606 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  61.8 
 
 		 423 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3274  serine hydroxymethyltransferase  64.72 
 
 		 412 aa  531  1e-149  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000462006  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  60.68 
 
 		 416 aa  528  1e-149  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1617  serine hydroxymethyltransferase  62.93 
 
 		 414 aa  528  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  61.56 
 
 		 423 aa  531  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0064  serine hydroxymethyltransferase  64.15 
 
 		 412 aa  525  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02841  serine hydroxymethyltransferase  61.61 
 
 		 416 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  62.99 
 
 		 412 aa  527  1e-148  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  61.27 
 
 		 429 aa  525  1e-148  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  63.44 
 
 		 413 aa  526  1e-148  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2187  serine hydroxymethyltransferase  60.2 
 
 		 417 aa  526  1e-148  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.911574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  60.19 
 
 		 417 aa  521  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  61.46 
 
 		 417 aa  521  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  61.12 
 
 		 417 aa  521  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  61.99 
 
 		 419 aa  524  1e-147  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4027  glycine hydroxymethyltransferase  61.3 
 
 		 421 aa  522  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17117  normal  0.0123375 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2312  serine hydroxymethyltransferase  59.31 
 
 		 412 aa  523  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.297378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  61.43 
 
 		 415 aa  522  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  61.46 
 
 		 417 aa  522  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1630  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  63.57 
 
 		 566 aa  521  1e-147  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0169  serine hydroxymethyltransferase  60.62 
 
 		 422 aa  522  1e-147  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1389  Glycine hydroxymethyltransferase  60.55 
 
 		 427 aa  521  1e-147  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000692081  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  61.07 
 
 		 417 aa  520  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  59.22 
 
 		 427 aa  518  1e-146  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 		 417 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2432  serine hydroxymethyltransferase  64.88 
 
 		 412 aa  519  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139104  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 		 417 aa  518  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  61.31 
 
 		 417 aa  519  1e-146  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  61.07 
 
 		 417 aa  519  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  61.07 
 
 		 417 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  60.58 
 
 		 417 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  60.58 
 
 		 417 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1035  Glycine hydroxymethyltransferase  59.56 
 
 		 418 aa  516  1.0000000000000001e-145  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314303 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4712  serine hydroxymethyltransferase  59.37 
 
 		 417 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  60.49 
 
 		 417 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0023  serine hydroxymethyltransferase  63.35 
 
 		 436 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 		 417 aa  514  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  60.44 
 
 		 417 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  60.29 
 
 		 425 aa  517  1.0000000000000001e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21550  serine hydroxymethyltransferase  60.87 
 
 		 418 aa  516  1.0000000000000001e-145  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.968894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0256  serine hydroxymethyltransferase  62.72 
 
 		 411 aa  516  1.0000000000000001e-145  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.666958 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>