More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1468 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  72.75 
 
 		 422 aa  665    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  73.52 
 
 		 427 aa  639    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  73.76 
 
 		 427 aa  641    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  73.92 
 
 		 424 aa  670    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 423 aa  873    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  62.17 
 
 		 415 aa  543  1e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  62.98 
 
 		 413 aa  541  1e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  62.26 
 
 		 415 aa  541  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  62.62 
 
 		 413 aa  543  1e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  62.26 
 
 		 415 aa  541  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  63.79 
 
 		 410 aa  542  1e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  61.47 
 
 		 422 aa  538  9.999999999999999e-153  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  62.53 
 
 		 415 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  63.55 
 
 		 410 aa  538  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  63.13 
 
 		 415 aa  536  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  61.06 
 
 		 412 aa  536  1e-151  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  61.43 
 
 		 413 aa  533  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  61.23 
 
 		 416 aa  532  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0169  serine hydroxymethyltransferase  59.81 
 
 		 422 aa  531  1e-150  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  60.81 
 
 		 414 aa  528  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  62.32 
 
 		 411 aa  530  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  62.32 
 
 		 414 aa  529  1e-149  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  62.05 
 
 		 415 aa  531  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  61.05 
 
 		 439 aa  528  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  59.52 
 
 		 437 aa  528  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  60.33 
 
 		 418 aa  529  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  60.71 
 
 		 413 aa  526  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  61.67 
 
 		 438 aa  528  1e-148  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  60.57 
 
 		 414 aa  527  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  60.57 
 
 		 414 aa  527  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  60.48 
 
 		 413 aa  525  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  60.48 
 
 		 413 aa  526  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  60.48 
 
 		 413 aa  524  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  61.45 
 
 		 415 aa  526  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  61.2 
 
 		 417 aa  525  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  61.31 
 
 		 417 aa  525  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  60.44 
 
 		 417 aa  525  1e-148  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  62.41 
 
 		 413 aa  527  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  59.33 
 
 		 417 aa  525  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 		 417 aa  521  1e-147  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 		 413 aa  523  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  60.82 
 
 		 412 aa  523  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2240  serine hydroxymethyltransferase  58.23 
 
 		 436 aa  522  1e-147  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.435156  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 		 417 aa  522  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 		 417 aa  524  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 		 417 aa  522  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  60.43 
 
 		 417 aa  524  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  61.43 
 
 		 438 aa  524  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2311  Glycine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 		 466 aa  524  1e-147  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000314902  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  59.57 
 
 		 417 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  60.67 
 
 		 413 aa  521  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  59.76 
 
 		 413 aa  518  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 		 417 aa  520  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 		 417 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 		 417 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 		 417 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2762  serine hydroxymethyltransferase  58.85 
 
 		 417 aa  520  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0373  serine hydroxymethyltransferase  59.04 
 
 		 419 aa  519  1e-146  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.238829  normal  0.155765 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  59.23 
 
 		 417 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  59.76 
 
 		 412 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  58.19 
 
 		 427 aa  516  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  59.86 
 
 		 432 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  58.13 
 
 		 417 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  59.14 
 
 		 415 aa  516  1.0000000000000001e-145  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  59.23 
 
 		 417 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  58.61 
 
 		 425 aa  516  1.0000000000000001e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  60.38 
 
 		 417 aa  514  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4513  serine hydroxymethyltransferase  59.56 
 
 		 417 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0695784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  58.89 
 
 		 417 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0671  serine hydroxymethyltransferase  59.81 
 
 		 417 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.557812  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  59.52 
 
 		 412 aa  512  1e-144  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 		 412 aa  513  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  59.28 
 
 		 412 aa  513  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1871  Glycine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 		 417 aa  514  1e-144  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  58.99 
 
 		 417 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0702  serine hydroxymethyltransferase  59.81 
 
 		 417 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0603318  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2027  glycine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 		 417 aa  511  1e-144  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  59.47 
 
 		 432 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0004  serine hydroxymethyltransferase  58.51 
 
 		 416 aa  511  1e-144  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3044  serine hydroxymethyltransferase  57.66 
 
 		 417 aa  511  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.196975  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0703  serine hydroxymethyltransferase  59.81 
 
 		 417 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 		 412 aa  513  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  57.14 
 
 		 417 aa  514  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  57.14 
 
 		 417 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5930  glycine hydroxymethyltransferase  58.99 
 
 		 438 aa  513  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.0770182 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  58.17 
 
 		 419 aa  511  1e-144  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  57.38 
 
 		 417 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  58.75 
 
 		 417 aa  512  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1231  serine hydroxymethyltransferase  57.66 
 
 		 417 aa  511  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4632  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 417 aa  509  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10278  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4877  serine hydroxymethyltransferase  59.61 
 
 		 417 aa  510  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.402887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  56.59 
 
 		 414 aa  509  1e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  57.91 
 
 		 416 aa  509  1e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  56.9 
 
 		 427 aa  509  1e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  56.37 
 
 		 423 aa  508  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  58.67 
 
 		 431 aa  511  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  58.13 
 
 		 417 aa  510  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1033  serine hydroxymethyltransferase  58.75 
 
 		 417 aa  511  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414818  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3262  serine hydroxymethyltransferase  59.42 
 
 		 454 aa  511  1e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3638  serine hydroxymethyltransferase  57.66 
 
 		 417 aa  510  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>