More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2327 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 413 aa  843    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  68.11 
 
 		 422 aa  575  1.0000000000000001e-163  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  66.59 
 
 		 427 aa  555  1e-157  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  66.59 
 
 		 427 aa  555  1e-157  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  66.02 
 
 		 424 aa  557  1e-157  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0169  serine hydroxymethyltransferase  65.14 
 
 		 422 aa  546  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  66.59 
 
 		 422 aa  548  1e-154  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  62.98 
 
 		 423 aa  541  1e-153  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  63.37 
 
 		 437 aa  541  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  65.05 
 
 		 412 aa  539  9.999999999999999e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  63.35 
 
 		 412 aa  538  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  63.44 
 
 		 412 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  62.17 
 
 		 431 aa  538  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1610  serine hydroxymethyltransferase  62.17 
 
 		 429 aa  536  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2311  Glycine hydroxymethyltransferase  62.93 
 
 		 466 aa  536  1e-151  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000314902  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  63.2 
 
 		 415 aa  533  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  62.95 
 
 		 415 aa  533  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  63.99 
 
 		 418 aa  533  1e-150  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  64.56 
 
 		 414 aa  533  1e-150  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  63.02 
 
 		 415 aa  529  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3262  serine hydroxymethyltransferase  62.5 
 
 		 454 aa  530  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  62.81 
 
 		 416 aa  529  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  63.68 
 
 		 410 aa  529  1e-149  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  63.11 
 
 		 411 aa  528  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  64.65 
 
 		 412 aa  528  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  64.65 
 
 		 412 aa  528  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  61.69 
 
 		 438 aa  525  1e-148  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  61.93 
 
 		 438 aa  526  1e-148  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  60.96 
 
 		 432 aa  528  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  62.53 
 
 		 415 aa  526  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  61.56 
 
 		 432 aa  527  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  64.16 
 
 		 415 aa  526  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  62.04 
 
 		 413 aa  525  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  63.44 
 
 		 410 aa  526  1e-148  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  62.44 
 
 		 417 aa  525  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  62.84 
 
 		 412 aa  526  1e-148  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  62.77 
 
 		 415 aa  524  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  59.42 
 
 		 427 aa  523  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  62.53 
 
 		 415 aa  524  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0004  serine hydroxymethyltransferase  62.96 
 
 		 416 aa  521  1e-147  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2240  serine hydroxymethyltransferase  59.38 
 
 		 436 aa  521  1e-147  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.435156  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2083  serine hydroxymethyltransferase  59.41 
 
 		 418 aa  524  1e-147  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  60.77 
 
 		 413 aa  520  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1660  serine hydroxymethyltransferase  61.18 
 
 		 418 aa  518  1e-146  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0479076  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  61.22 
 
 		 417 aa  518  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1887  Glycine hydroxymethyltransferase  61.48 
 
 		 419 aa  519  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  62.08 
 
 		 438 aa  519  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04405  serine hydroxymethyltransferase  61.06 
 
 		 417 aa  518  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0290  serine hydroxymethyltransferase  60.54 
 
 		 418 aa  518  1e-146  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2938  serine hydroxymethyltransferase  61.56 
 
 		 421 aa  519  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  62.47 
 
 		 413 aa  518  1e-146  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  61.56 
 
 		 411 aa  520  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0256  serine hydroxymethyltransferase  62.31 
 
 		 411 aa  518  1e-146  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.666958 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  61.69 
 
 		 440 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0318  serine hydroxymethyltransferase  60.78 
 
 		 418 aa  518  1e-146  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  60.96 
 
 		 439 aa  520  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  62.22 
 
 		 417 aa  518  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  60.29 
 
 		 413 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  60.29 
 
 		 413 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  60.49 
 
 		 414 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  60.39 
 
 		 434 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  59.85 
 
 		 412 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  60.39 
 
 		 434 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  60.39 
 
 		 434 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  61.71 
 
 		 417 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 413 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  63.33 
 
 		 412 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 413 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0821  serine hydroxymethyltransferase  59.86 
 
 		 431 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  60.98 
 
 		 417 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2634  serine hydroxymethyltransferase  60.72 
 
 		 433 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  61.31 
 
 		 417 aa  516  1.0000000000000001e-145  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  60.73 
 
 		 417 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  60.96 
 
 		 433 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  61.95 
 
 		 420 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1537  serine hydroxymethyltransferase  60.48 
 
 		 435 aa  518  1.0000000000000001e-145  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  62.2 
 
 		 417 aa  515  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 		 414 aa  514  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 		 414 aa  513  1e-144  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2075  serine hydroxymethyltransferase  62.04 
 
 		 415 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  62.59 
 
 		 417 aa  514  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3196  serine hydroxymethyltransferase  62.04 
 
 		 415 aa  511  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  59.32 
 
 		 419 aa  513  1e-144  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3250  serine hydroxymethyltransferase  62.04 
 
 		 415 aa  511  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  61.84 
 
 		 431 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1942  serine hydroxymethyltransferase  62.04 
 
 		 415 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0629  serine hydroxymethyltransferase  61.07 
 
 		 432 aa  513  1e-144  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0834  serine hydroxymethyltransferase  62.04 
 
 		 415 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1142  serine hydroxymethyltransferase  61.96 
 
 		 434 aa  512  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  61.35 
 
 		 431 aa  512  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0417  serine hydroxymethyltransferase  60.64 
 
 		 420 aa  512  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2305  serine hydroxymethyltransferase  60.49 
 
 		 434 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 413 aa  513  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0959  Glycine hydroxymethyltransferase  60.5 
 
 		 410 aa  511  1e-144  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.587194  normal  0.162631 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3956  serine hydroxymethyltransferase  60.39 
 
 		 434 aa  512  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  62.04 
 
 		 415 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 413 aa  512  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5930  glycine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 438 aa  514  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.0770182 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  60.92 
 
 		 415 aa  513  1e-144  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  62.08 
 
 		 431 aa  514  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>