More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1442 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  79.61 
 
 		 415 aa  684    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 416 aa  860    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  78.43 
 
 		 415 aa  674    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  77.18 
 
 		 415 aa  672    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  76.41 
 
 		 415 aa  666    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  76.66 
 
 		 415 aa  665    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  79.12 
 
 		 415 aa  677    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  77.23 
 
 		 413 aa  661    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  71.81 
 
 		 412 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  71.57 
 
 		 412 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  67.97 
 
 		 410 aa  579  1e-164  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0064  serine hydroxymethyltransferase  69.36 
 
 		 412 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  67.73 
 
 		 410 aa  576  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  66.75 
 
 		 412 aa  575  1.0000000000000001e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  67.49 
 
 		 415 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  67.07 
 
 		 413 aa  571  1.0000000000000001e-162  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  66.5 
 
 		 420 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  66.91 
 
 		 412 aa  569  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  66.91 
 
 		 412 aa  569  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  63.3 
 
 		 414 aa  569  1e-161  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  65.02 
 
 		 412 aa  565  1e-160  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1617  serine hydroxymethyltransferase  67.32 
 
 		 414 aa  565  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  64.37 
 
 		 412 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  65.69 
 
 		 413 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  65.05 
 
 		 418 aa  562  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  66.18 
 
 		 417 aa  561  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  67.24 
 
 		 414 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  65.94 
 
 		 417 aa  560  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  65.69 
 
 		 417 aa  559  1e-158  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  65.85 
 
 		 411 aa  558  1e-158  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  63.81 
 
 		 412 aa  559  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  62.81 
 
 		 414 aa  560  1e-158  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  64.01 
 
 		 414 aa  555  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  65.61 
 
 		 417 aa  557  1e-157  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  63.97 
 
 		 420 aa  557  1e-157  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2432  serine hydroxymethyltransferase  68.3 
 
 		 412 aa  557  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139104  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  64.95 
 
 		 419 aa  556  1e-157  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  63.16 
 
 		 424 aa  555  1e-157  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  64.39 
 
 		 413 aa  554  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  63.77 
 
 		 414 aa  554  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  63.77 
 
 		 414 aa  554  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  64.39 
 
 		 413 aa  554  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  64.15 
 
 		 413 aa  553  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  64.55 
 
 		 413 aa  553  1e-156  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  64.25 
 
 		 417 aa  553  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  64.15 
 
 		 413 aa  553  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  64.39 
 
 		 413 aa  552  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  65.43 
 
 		 412 aa  553  1e-156  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  64.3 
 
 		 411 aa  552  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  64.15 
 
 		 413 aa  553  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  64.59 
 
 		 422 aa  548  1e-155  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  63.33 
 
 		 412 aa  550  1e-155  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  64.39 
 
 		 413 aa  550  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  65.36 
 
 		 412 aa  550  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  63.3 
 
 		 417 aa  545  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0851  glycine hydroxymethyltransferase  62.68 
 
 		 419 aa  545  1e-154  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0407045  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  63.66 
 
 		 413 aa  548  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  62.2 
 
 		 416 aa  546  1e-154  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  63.41 
 
 		 417 aa  544  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  63.29 
 
 		 417 aa  545  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  66.03 
 
 		 427 aa  544  1e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  66.03 
 
 		 427 aa  544  1e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  63.11 
 
 		 416 aa  541  1e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  62.8 
 
 		 417 aa  542  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  64.29 
 
 		 417 aa  542  1e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  62.56 
 
 		 415 aa  543  1e-153  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  63.39 
 
 		 417 aa  541  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  63.64 
 
 		 417 aa  543  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  63.64 
 
 		 417 aa  543  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  63.39 
 
 		 417 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  63.64 
 
 		 417 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  63.14 
 
 		 417 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  63.39 
 
 		 417 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  63.33 
 
 		 431 aa  538  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  63.64 
 
 		 417 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  63.39 
 
 		 417 aa  538  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  61.54 
 
 		 422 aa  537  1e-151  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4513  serine hydroxymethyltransferase  61.41 
 
 		 417 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0695784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  63.26 
 
 		 427 aa  536  1e-151  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  63.21 
 
 		 417 aa  536  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  62.2 
 
 		 417 aa  535  1e-151  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  62.9 
 
 		 417 aa  536  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  63.28 
 
 		 415 aa  537  1e-151  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  63.08 
 
 		 415 aa  535  1e-151  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  61.65 
 
 		 417 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0471  serine hydroxymethyltransferase  61.03 
 
 		 414 aa  531  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.937307  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3094  glycine hydroxymethyltransferase  62.14 
 
 		 417 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  61.23 
 
 		 423 aa  532  1e-150  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  63.08 
 
 		 429 aa  531  1e-150  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0295  serine hydroxymethyltransferase  61.03 
 
 		 414 aa  531  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1033  serine hydroxymethyltransferase  63.05 
 
 		 417 aa  531  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414818  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0671  serine hydroxymethyltransferase  60.92 
 
 		 417 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.557812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0703  serine hydroxymethyltransferase  61.17 
 
 		 417 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0702  serine hydroxymethyltransferase  60.92 
 
 		 417 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0603318  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04405  serine hydroxymethyltransferase  63.3 
 
 		 417 aa  530  1e-149  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1851  serine hydroxymethyltransferase  63.55 
 
 		 417 aa  531  1e-149  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  62.99 
 
 		 415 aa  530  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1344  serine hydroxymethyltransferase  62.07 
 
 		 417 aa  528  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  61.41 
 
 		 417 aa  531  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0169  serine hydroxymethyltransferase  62.71 
 
 		 422 aa  529  1e-149  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>