More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1813 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  74.7 
 
 
412 aa  657    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 
414 aa  860    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  64.56 
 
 
415 aa  579  1e-164  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  64.39 
 
 
415 aa  579  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  64.65 
 
 
414 aa  578  1e-164  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  63.9 
 
 
415 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  64.15 
 
 
415 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  63.35 
 
 
415 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  63.17 
 
 
415 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  63.3 
 
 
416 aa  569  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  62.2 
 
 
413 aa  558  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  62.29 
 
 
412 aa  552  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  63.03 
 
 
410 aa  552  1e-156  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  63.24 
 
 
412 aa  548  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  62.53 
 
 
410 aa  548  1e-155  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  61.46 
 
 
411 aa  545  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  60.19 
 
 
418 aa  541  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  61.76 
 
 
415 aa  541  1e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  60.83 
 
 
412 aa  543  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  63.41 
 
 
413 aa  543  1e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 
424 aa  537  1e-151  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  60.98 
 
 
414 aa  531  1e-150  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  59.56 
 
 
413 aa  531  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  59.81 
 
 
413 aa  534  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  59.56 
 
 
413 aa  531  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 
412 aa  534  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 
420 aa  534  1e-150  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 
420 aa  532  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  60.44 
 
 
412 aa  532  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  58.54 
 
 
412 aa  532  1e-150  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  60.44 
 
 
412 aa  532  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  59.32 
 
 
414 aa  529  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  59.32 
 
 
414 aa  529  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  59.32 
 
 
414 aa  530  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  60.43 
 
 
422 aa  528  1e-149  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  59.56 
 
 
413 aa  530  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  59.56 
 
 
413 aa  531  1e-149  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  59.32 
 
 
413 aa  528  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  59.08 
 
 
413 aa  527  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  58.84 
 
 
413 aa  526  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  60.2 
 
 
413 aa  526  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  59.07 
 
 
415 aa  525  1e-148  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  59.37 
 
 
412 aa  522  1e-147  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 
415 aa  519  1e-146  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  59.8 
 
 
412 aa  518  1e-146  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1617  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 
414 aa  520  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2187  serine hydroxymethyltransferase  61.22 
 
 
417 aa  518  1e-146  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.911574  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  58.51 
 
 
417 aa  518  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0745  serine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 
415 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  59.02 
 
 
422 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  59.51 
 
 
415 aa  517  1.0000000000000001e-145  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  57.04 
 
 
419 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  58.48 
 
 
413 aa  514  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  58.99 
 
 
427 aa  513  1e-144  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  58.99 
 
 
427 aa  513  1e-144  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  60.3 
 
 
412 aa  513  1e-144  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0471  serine hydroxymethyltransferase  57.25 
 
 
414 aa  511  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.937307  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4027  glycine hydroxymethyltransferase  59.56 
 
 
421 aa  508  1e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17117  normal  0.0123375 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  58.44 
 
 
417 aa  510  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  58.82 
 
 
417 aa  511  1e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0295  serine hydroxymethyltransferase  57.25 
 
 
414 aa  511  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  56.34 
 
 
411 aa  509  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2432  serine hydroxymethyltransferase  61.54 
 
 
412 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139104  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  57.14 
 
 
416 aa  507  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  57.7 
 
 
417 aa  507  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  56.62 
 
 
417 aa  502  1e-141  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  57.28 
 
 
427 aa  503  1e-141  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0023  serine hydroxymethyltransferase  60.29 
 
 
436 aa  501  1e-141  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  55.93 
 
 
425 aa  502  1e-141  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  57.56 
 
 
417 aa  502  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  57.8 
 
 
417 aa  504  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  57.8 
 
 
417 aa  504  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  57.07 
 
 
417 aa  498  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0064  serine hydroxymethyltransferase  58.78 
 
 
412 aa  499  1e-140  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0851  glycine hydroxymethyltransferase  57.21 
 
 
419 aa  501  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0407045  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  57.87 
 
 
423 aa  500  1e-140  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  56.51 
 
 
417 aa  501  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  57.56 
 
 
417 aa  499  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  57.84 
 
 
431 aa  499  1e-140  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  56.02 
 
 
417 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  56.31 
 
 
423 aa  498  1e-140  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  56.97 
 
 
417 aa  498  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  56.02 
 
 
417 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  56.8 
 
 
423 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  55.85 
 
 
417 aa  496  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  56.83 
 
 
417 aa  495  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2083  serine hydroxymethyltransferase  54.77 
 
 
418 aa  495  1e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  56.27 
 
 
427 aa  495  1e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  58.5 
 
 
413 aa  497  1e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  56.34 
 
 
417 aa  497  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  57.07 
 
 
417 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  56.72 
 
 
417 aa  497  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4270  serine hydroxymethyltransferase  56.97 
 
 
417 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2762  serine hydroxymethyltransferase  55.12 
 
 
417 aa  492  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  55.75 
 
 
416 aa  494  9.999999999999999e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  56.59 
 
 
417 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4877  serine hydroxymethyltransferase  56.23 
 
 
417 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.402887  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  55.99 
 
 
417 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  57.88 
 
 
423 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0417  serine hydroxymethyltransferase  55.45 
 
 
420 aa  491  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>