More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0851 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0851  glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 419 aa  863    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0407045  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  62.68 
 
 		 416 aa  545  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  64.3 
 
 		 412 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  63.11 
 
 		 415 aa  533  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  63.11 
 
 		 415 aa  534  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  60.64 
 
 		 415 aa  525  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  61.71 
 
 		 412 aa  527  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  63.75 
 
 		 411 aa  526  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  61.71 
 
 		 412 aa  527  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 415 aa  525  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  60.44 
 
 		 413 aa  526  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  61.86 
 
 		 414 aa  523  1e-147  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  61.03 
 
 		 412 aa  523  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  60.64 
 
 		 415 aa  522  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  61.99 
 
 		 417 aa  523  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  60.64 
 
 		 415 aa  522  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  60.64 
 
 		 413 aa  520  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  61.33 
 
 		 417 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  61.34 
 
 		 418 aa  518  1e-146  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  58.68 
 
 		 414 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  61.98 
 
 		 420 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  62.07 
 
 		 417 aa  515  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3468  serine hydroxymethyltransferase  63.5 
 
 		 418 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  60.53 
 
 		 415 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  61.12 
 
 		 413 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  61.33 
 
 		 417 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  61.33 
 
 		 417 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  60.64 
 
 		 413 aa  511  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  60.88 
 
 		 420 aa  513  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 		 410 aa  512  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 		 410 aa  514  1e-144  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 		 412 aa  508  1e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  60.64 
 
 		 413 aa  511  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 		 413 aa  508  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 		 414 aa  509  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 		 414 aa  510  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  62.44 
 
 		 417 aa  508  1e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  58.25 
 
 		 412 aa  508  1e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  60.39 
 
 		 413 aa  508  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 		 413 aa  508  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 		 412 aa  508  1e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  59.47 
 
 		 412 aa  508  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  60.39 
 
 		 413 aa  510  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 		 414 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 413 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 413 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  60.59 
 
 		 413 aa  502  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  58.35 
 
 		 425 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  59.17 
 
 		 411 aa  502  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0389  serine hydroxymethyltransferase  58.24 
 
 		 436 aa  502  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285606 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2187  serine hydroxymethyltransferase  59.17 
 
 		 417 aa  501  1e-141  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.911574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  58.35 
 
 		 425 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1155  serine hydroxymethyltransferase  58.47 
 
 		 436 aa  501  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0436  serine hydroxymethyltransferase  56.55 
 
 		 415 aa  499  1e-140  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.083606  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0413  serine hydroxymethyltransferase  56.8 
 
 		 415 aa  499  1e-140  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.774669  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  58.23 
 
 		 417 aa  498  1e-140  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0745  serine hydroxymethyltransferase  58.54 
 
 		 415 aa  499  1e-140  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 412 aa  500  1e-140  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_378  serine hydroxymethyltransferase  56.31 
 
 		 415 aa  499  1e-140  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  57.21 
 
 		 414 aa  501  1e-140  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  57.63 
 
 		 423 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  58.05 
 
 		 422 aa  501  1e-140  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  57.32 
 
 		 415 aa  499  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  58.01 
 
 		 412 aa  496  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2312  serine hydroxymethyltransferase  58.37 
 
 		 412 aa  497  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.297378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2432  serine hydroxymethyltransferase  61.12 
 
 		 412 aa  494  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139104  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  57.38 
 
 		 423 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1389  Glycine hydroxymethyltransferase  58.96 
 
 		 427 aa  494  1e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000692081  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  57.95 
 
 		 427 aa  495  1e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  59.51 
 
 		 415 aa  491  9.999999999999999e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  56.34 
 
 		 412 aa  491  9.999999999999999e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  56.66 
 
 		 423 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 		 427 aa  491  9.999999999999999e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0004  serine hydroxymethyltransferase  58.01 
 
 		 416 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1264  serine hydroxymethyltransferase  59.61 
 
 		 426 aa  494  9.999999999999999e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  57.14 
 
 		 423 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  58.39 
 
 		 419 aa  491  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1833  serine hydroxymethyltransferase  58.19 
 
 		 423 aa  490  1e-137  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.785323  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0064  serine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 		 412 aa  489  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0023  serine hydroxymethyltransferase  58.44 
 
 		 436 aa  489  1e-137  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  58.42 
 
 		 415 aa  488  1e-137  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5930  glycine hydroxymethyltransferase  58.98 
 
 		 438 aa  485  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.0770182 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  58.05 
 
 		 413 aa  485  1e-136  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  58.19 
 
 		 416 aa  486  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  58.06 
 
 		 438 aa  486  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1649  serine hydroxymethyltransferase  62.17 
 
 		 434 aa  486  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  57.95 
 
 		 425 aa  485  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2123  serine hydroxymethyltransferase  61.99 
 
 		 432 aa  486  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.607283  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  58.84 
 
 		 432 aa  482  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0295  serine hydroxymethyltransferase  57.92 
 
 		 414 aa  484  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0471  serine hydroxymethyltransferase  57.92 
 
 		 414 aa  484  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.937307  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1035  Glycine hydroxymethyltransferase  57.21 
 
 		 418 aa  481  1e-135  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314303 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  56.83 
 
 		 422 aa  484  1e-135  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  57.99 
 
 		 431 aa  483  1e-135  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  58.87 
 
 		 417 aa  482  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0169  serine hydroxymethyltransferase  59.08 
 
 		 422 aa  484  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2305  serine hydroxymethyltransferase  58.88 
 
 		 434 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1617  serine hydroxymethyltransferase  58.92 
 
 		 414 aa  478  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3196  serine hydroxymethyltransferase  58.21 
 
 		 415 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  57.07 
 
 		 427 aa  481  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>