More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0282 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  77.45 
 
 		 423 aa  671    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02841  serine hydroxymethyltransferase  73.08 
 
 		 416 aa  649    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  75.99 
 
 		 411 aa  656    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  75.74 
 
 		 411 aa  655    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  76 
 
 		 425 aa  674    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2076  serine hydroxymethyltransferase  79.06 
 
 		 427 aa  688    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.745833  hitchhiker  0.000706319 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  78.43 
 
 		 429 aa  665    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  79.24 
 
 		 431 aa  689    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  76.72 
 
 		 423 aa  667    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 427 aa  878    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  78.68 
 
 		 424 aa  671    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  76 
 
 		 425 aa  674    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4802  serine hydroxymethyltransferase  79.81 
 
 		 427 aa  688    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  76.96 
 
 		 423 aa  668    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  75.74 
 
 		 423 aa  657    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1678  serine hydroxymethyltransferase  81.67 
 
 		 426 aa  681    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  76.83 
 
 		 425 aa  692    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  75.53 
 
 		 427 aa  685    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  64.48 
 
 		 419 aa  560  1e-158  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  66.42 
 
 		 413 aa  553  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  65.21 
 
 		 415 aa  551  1e-156  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  64.72 
 
 		 411 aa  550  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  64.15 
 
 		 412 aa  546  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  63.48 
 
 		 412 aa  547  1e-154  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  64.15 
 
 		 412 aa  546  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1610  serine hydroxymethyltransferase  63.4 
 
 		 429 aa  542  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  62.8 
 
 		 413 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  64.29 
 
 		 415 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  62.21 
 
 		 437 aa  538  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  62.86 
 
 		 410 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  64.04 
 
 		 415 aa  537  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  61.99 
 
 		 417 aa  535  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  64.1 
 
 		 420 aa  535  1e-151  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  63.26 
 
 		 416 aa  536  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  62.08 
 
 		 413 aa  535  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  61.84 
 
 		 413 aa  535  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  62.14 
 
 		 412 aa  536  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  62.62 
 
 		 410 aa  537  1e-151  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  61.84 
 
 		 413 aa  533  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  64.06 
 
 		 416 aa  534  1e-150  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  62.53 
 
 		 427 aa  532  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  61.99 
 
 		 414 aa  532  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  61.72 
 
 		 431 aa  533  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  61.59 
 
 		 413 aa  531  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  63.5 
 
 		 412 aa  534  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  61.35 
 
 		 413 aa  530  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  61.27 
 
 		 432 aa  530  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  62.44 
 
 		 412 aa  531  1e-149  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  61.74 
 
 		 414 aa  531  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  63.04 
 
 		 434 aa  529  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  60.91 
 
 		 422 aa  529  1e-149  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  63.61 
 
 		 415 aa  530  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  61.03 
 
 		 432 aa  528  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  63.12 
 
 		 415 aa  531  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  62.62 
 
 		 415 aa  529  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  62.8 
 
 		 434 aa  526  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  61.5 
 
 		 414 aa  527  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0791  serine hydroxymethyltransferase  65.93 
 
 		 417 aa  527  1e-148  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0762  serine hydroxymethyltransferase  65.43 
 
 		 417 aa  525  1e-148  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  60.72 
 
 		 413 aa  525  1e-148  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  62.8 
 
 		 434 aa  526  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  61.35 
 
 		 413 aa  526  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  60.77 
 
 		 418 aa  527  1e-148  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  61.41 
 
 		 422 aa  526  1e-148  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  61.22 
 
 		 415 aa  526  1e-148  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1887  Glycine hydroxymethyltransferase  62.47 
 
 		 419 aa  522  1e-147  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  60.91 
 
 		 431 aa  521  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  61.86 
 
 		 412 aa  523  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  62.04 
 
 		 413 aa  521  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  62.56 
 
 		 433 aa  523  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  60.77 
 
 		 439 aa  521  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  61.39 
 
 		 431 aa  521  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  60.83 
 
 		 415 aa  521  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1827  serine hydroxymethyltransferase  62.02 
 
 		 430 aa  524  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.752619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  61.11 
 
 		 413 aa  524  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  62.68 
 
 		 417 aa  524  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  61.39 
 
 		 431 aa  521  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  61.8 
 
 		 417 aa  521  1e-147  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1579  serine hydroxymethyltransferase  62.59 
 
 		 431 aa  523  1e-147  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  59.66 
 
 		 414 aa  521  1e-146  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  61.02 
 
 		 438 aa  519  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2762  serine hydroxymethyltransferase  60.98 
 
 		 417 aa  520  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  61.31 
 
 		 438 aa  521  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  60.98 
 
 		 417 aa  521  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  59.23 
 
 		 424 aa  520  1e-146  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0629  serine hydroxymethyltransferase  61.15 
 
 		 432 aa  519  1e-146  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0700  serine hydroxymethyltransferase  61.27 
 
 		 431 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0504784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8588  serine hydroxymethyltransferase  62.68 
 
 		 420 aa  518  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0821  serine hydroxymethyltransferase  63.31 
 
 		 431 aa  518  1e-146  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2634  serine hydroxymethyltransferase  62.8 
 
 		 433 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3094  glycine hydroxymethyltransferase  62.2 
 
 		 417 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  62.32 
 
 		 440 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  60.78 
 
 		 415 aa  520  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  61.12 
 
 		 417 aa  518  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0765  serine hydroxymethyltransferase  61.03 
 
 		 415 aa  519  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186767  normal  0.156833 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1871  Glycine hydroxymethyltransferase  61.86 
 
 		 417 aa  520  1e-146  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2581  serine hydroxymethyltransferase  61.27 
 
 		 415 aa  519  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0683  serine hydroxymethyltransferase  61.03 
 
 		 431 aa  518  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  61.06 
 
 		 438 aa  520  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3004  serine hydroxymethyltransferase  62.8 
 
 		 432 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>