More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1463 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 415 aa  862    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  64.55 
 
 		 415 aa  574  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  63.81 
 
 		 415 aa  566  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  63.81 
 
 		 415 aa  564  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  64.3 
 
 		 415 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  63.5 
 
 		 415 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  62.59 
 
 		 415 aa  552  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  61.8 
 
 		 413 aa  551  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  63.17 
 
 		 412 aa  549  1e-155  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  62.65 
 
 		 415 aa  548  1e-155  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  62.56 
 
 		 416 aa  543  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  62.44 
 
 		 412 aa  539  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  62.86 
 
 		 427 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  63.39 
 
 		 417 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  61.59 
 
 		 414 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  62.44 
 
 		 412 aa  539  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  62.86 
 
 		 427 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  61.86 
 
 		 412 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  61.8 
 
 		 413 aa  537  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  61.35 
 
 		 414 aa  535  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  61.35 
 
 		 414 aa  538  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  61.17 
 
 		 413 aa  535  1e-151  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  61.41 
 
 		 413 aa  536  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  61.17 
 
 		 420 aa  536  1e-151  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  61.99 
 
 		 412 aa  536  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  62.44 
 
 		 410 aa  537  1e-151  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  61.41 
 
 		 413 aa  537  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  60.53 
 
 		 424 aa  531  1e-150  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  61.31 
 
 		 413 aa  533  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4027  glycine hydroxymethyltransferase  62.11 
 
 		 421 aa  532  1e-150  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17117  normal  0.0123375 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  61.41 
 
 		 413 aa  534  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  61.56 
 
 		 413 aa  534  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  62.65 
 
 		 411 aa  532  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  61.95 
 
 		 410 aa  532  1e-150  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  61.31 
 
 		 413 aa  533  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  62.68 
 
 		 413 aa  533  1e-150  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  60.73 
 
 		 417 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  61.61 
 
 		 417 aa  528  1e-149  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  60.49 
 
 		 417 aa  531  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 		 417 aa  529  1e-149  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  59.51 
 
 		 411 aa  526  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  61.86 
 
 		 412 aa  527  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  61.07 
 
 		 417 aa  523  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  63.28 
 
 		 412 aa  523  1e-147  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 412 aa  518  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  60.54 
 
 		 420 aa  521  1e-146  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  59.02 
 
 		 412 aa  520  1e-146  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 		 414 aa  519  1e-146  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  60.62 
 
 		 422 aa  520  1e-146  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  58.8 
 
 		 418 aa  520  1e-146  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  62.78 
 
 		 412 aa  520  1e-146  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  59.43 
 
 		 437 aa  521  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 417 aa  519  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 417 aa  519  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  61.18 
 
 		 415 aa  518  1e-146  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 417 aa  519  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  59.61 
 
 		 417 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0064  serine hydroxymethyltransferase  62.16 
 
 		 412 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  60.73 
 
 		 417 aa  517  1.0000000000000001e-145  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 417 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 417 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 417 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  59.14 
 
 		 423 aa  516  1.0000000000000001e-145  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  57.28 
 
 		 414 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  59.85 
 
 		 417 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  59.85 
 
 		 417 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  59.85 
 
 		 417 aa  514  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1265  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 417 aa  514  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000077829  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 		 417 aa  512  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  60.2 
 
 		 413 aa  512  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  59.37 
 
 		 417 aa  513  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  60.58 
 
 		 414 aa  514  1e-144  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0004  serine hydroxymethyltransferase  57.8 
 
 		 416 aa  513  1e-144  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  60.92 
 
 		 413 aa  513  1e-144  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1158  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 417 aa  514  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000444868  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1917  serine hydroxymethyltransferase  59.8 
 
 		 430 aa  513  1e-144  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.584505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0445  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 417 aa  514  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000471586  hitchhiker  0.0000012571 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1610  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 429 aa  511  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  59.47 
 
 		 438 aa  509  1e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 422 aa  511  1e-143  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1617  serine hydroxymethyltransferase  61.08 
 
 		 414 aa  510  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3638  serine hydroxymethyltransferase  59.85 
 
 		 417 aa  509  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  59.23 
 
 		 439 aa  508  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  59.12 
 
 		 417 aa  509  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0307  serine hydroxymethyltransferase  59.17 
 
 		 414 aa  506  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.209874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  57.86 
 
 		 427 aa  505  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  59.47 
 
 		 438 aa  507  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  59.02 
 
 		 412 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3044  serine hydroxymethyltransferase  58.88 
 
 		 417 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.196975  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  59.13 
 
 		 431 aa  507  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2432  serine hydroxymethyltransferase  61.54 
 
 		 412 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139104  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3956  serine hydroxymethyltransferase  60.39 
 
 		 434 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5930  glycine hydroxymethyltransferase  58.35 
 
 		 438 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.0770182 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0629  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 432 aa  506  9.999999999999999e-143  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0323  serine hydroxymethyltransferase  60.39 
 
 		 415 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  58.64 
 
 		 425 aa  504  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1033  serine hydroxymethyltransferase  58.88 
 
 		 417 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414818  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0775  serine hydroxymethyltransferase  60.39 
 
 		 415 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0739852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0806  serine hydroxymethyltransferase  60.39 
 
 		 415 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  58.68 
 
 		 415 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>