More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4027 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4027  glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 421 aa  871    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17117  normal  0.0123375 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  64.65 
 
 		 415 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  63.99 
 
 		 420 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  63.68 
 
 		 415 aa  537  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  62.02 
 
 		 413 aa  531  1e-150  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  62.71 
 
 		 415 aa  532  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0295  serine hydroxymethyltransferase  61.76 
 
 		 414 aa  531  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  62.11 
 
 		 415 aa  532  1e-150  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0471  serine hydroxymethyltransferase  61.76 
 
 		 414 aa  531  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.937307  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  62.53 
 
 		 415 aa  530  1e-149  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  61.39 
 
 		 412 aa  530  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  62.14 
 
 		 412 aa  529  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  62.95 
 
 		 415 aa  529  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  62.77 
 
 		 418 aa  530  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1630  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  61.9 
 
 		 566 aa  527  1e-148  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  62.05 
 
 		 412 aa  526  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  66.23 
 
 		 413 aa  527  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  62.71 
 
 		 415 aa  527  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  61.78 
 
 		 410 aa  526  1e-148  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  61.74 
 
 		 415 aa  524  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  62.98 
 
 		 411 aa  524  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  61.3 
 
 		 410 aa  522  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  61.99 
 
 		 413 aa  523  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2762  serine hydroxymethyltransferase  60.98 
 
 		 417 aa  518  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  61.74 
 
 		 416 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  61.26 
 
 		 417 aa  516  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  61.56 
 
 		 413 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  60.98 
 
 		 412 aa  514  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  61.71 
 
 		 417 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  61.71 
 
 		 417 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  60.63 
 
 		 412 aa  515  1.0000000000000001e-145  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  60.98 
 
 		 412 aa  514  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  61.71 
 
 		 417 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  62.44 
 
 		 417 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  60.49 
 
 		 417 aa  512  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  59.56 
 
 		 412 aa  514  1e-144  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  61.31 
 
 		 413 aa  513  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  61.31 
 
 		 413 aa  514  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  61.31 
 
 		 414 aa  513  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  61.31 
 
 		 414 aa  513  1e-144  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  61.31 
 
 		 414 aa  514  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  61.31 
 
 		 413 aa  513  1e-144  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  61.31 
 
 		 413 aa  513  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  61.31 
 
 		 417 aa  513  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1033  serine hydroxymethyltransferase  61.35 
 
 		 417 aa  513  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414818  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  61.31 
 
 		 413 aa  513  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  60.98 
 
 		 417 aa  508  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 413 aa  510  1e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  62.31 
 
 		 414 aa  508  1e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  60.58 
 
 		 413 aa  510  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  60.98 
 
 		 417 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  60.98 
 
 		 417 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1917  serine hydroxymethyltransferase  60.39 
 
 		 430 aa  510  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.584505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  61.22 
 
 		 417 aa  509  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  61.22 
 
 		 417 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  59.56 
 
 		 414 aa  508  1e-143  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  61.22 
 
 		 417 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3044  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 		 417 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.196975  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0671  serine hydroxymethyltransferase  60.39 
 
 		 417 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.557812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0702  serine hydroxymethyltransferase  60.39 
 
 		 417 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0603318  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1158  serine hydroxymethyltransferase  59.27 
 
 		 417 aa  505  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000444868  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1265  serine hydroxymethyltransferase  59.27 
 
 		 417 aa  505  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000077829  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4877  serine hydroxymethyltransferase  60.64 
 
 		 417 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.402887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 417 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0445  serine hydroxymethyltransferase  59.27 
 
 		 417 aa  505  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000471586  hitchhiker  0.0000012571 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 437 aa  505  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3638  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 		 417 aa  506  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0703  serine hydroxymethyltransferase  60.39 
 
 		 417 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1231  serine hydroxymethyltransferase  59.76 
 
 		 417 aa  503  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4632  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 417 aa  504  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10278  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4270  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 417 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  59.81 
 
 		 417 aa  502  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  59.48 
 
 		 438 aa  503  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4513  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 417 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0695784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  62.1 
 
 		 427 aa  503  1e-141  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 		 412 aa  503  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 417 aa  502  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0417  serine hydroxymethyltransferase  59.32 
 
 		 420 aa  504  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 417 aa  504  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  58.11 
 
 		 414 aa  502  1e-141  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  58.77 
 
 		 439 aa  498  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  59.24 
 
 		 438 aa  498  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2083  serine hydroxymethyltransferase  59.09 
 
 		 418 aa  500  1e-140  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  61.43 
 
 		 417 aa  499  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  58.99 
 
 		 422 aa  499  1e-140  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  58.85 
 
 		 425 aa  499  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 416 aa  499  1e-140  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0678  serine hydroxymethyltransferase  57.63 
 
 		 415 aa  497  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.478588 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  59.8 
 
 		 425 aa  495  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  58.27 
 
 		 417 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  58.1 
 
 		 416 aa  495  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  59.05 
 
 		 417 aa  497  1e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  57.69 
 
 		 427 aa  497  1e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  58.65 
 
 		 432 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1155  serine hydroxymethyltransferase  58.53 
 
 		 436 aa  497  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  58.89 
 
 		 432 aa  497  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  58.51 
 
 		 417 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  60.98 
 
 		 417 aa  498  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  58.84 
 
 		 411 aa  496  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  59.8 
 
 		 425 aa  495  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>