More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0209 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  73.76 
 
 		 423 aa  662    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  99.77 
 
 		 427 aa  880    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  78.91 
 
 		 422 aa  698    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 427 aa  882    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  78.44 
 
 		 424 aa  702    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  66.59 
 
 		 413 aa  571  1e-161  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  65.47 
 
 		 410 aa  568  1e-161  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  64.68 
 
 		 415 aa  568  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  65 
 
 		 415 aa  569  1e-161  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  65.16 
 
 		 415 aa  565  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  64.83 
 
 		 415 aa  566  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  64.59 
 
 		 415 aa  565  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  64.99 
 
 		 410 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  64.83 
 
 		 415 aa  560  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  66.03 
 
 		 416 aa  560  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  63.64 
 
 		 418 aa  559  1e-158  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  64.58 
 
 		 412 aa  557  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  64.83 
 
 		 411 aa  553  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  66.67 
 
 		 414 aa  553  1e-156  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  62.86 
 
 		 415 aa  553  1e-156  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  63.64 
 
 		 415 aa  551  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  63.96 
 
 		 412 aa  551  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0169  serine hydroxymethyltransferase  62.98 
 
 		 422 aa  553  1e-156  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  64.25 
 
 		 413 aa  551  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  64.35 
 
 		 413 aa  548  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  62.59 
 
 		 412 aa  549  1e-155  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  63.07 
 
 		 417 aa  546  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  65.21 
 
 		 417 aa  547  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  62.11 
 
 		 417 aa  543  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  63.99 
 
 		 417 aa  541  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  64.48 
 
 		 417 aa  541  1e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2240  serine hydroxymethyltransferase  61.3 
 
 		 436 aa  543  1e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.435156  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  61.63 
 
 		 417 aa  541  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  61.87 
 
 		 417 aa  543  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  61.63 
 
 		 417 aa  541  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  65.78 
 
 		 412 aa  543  1e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  63.1 
 
 		 422 aa  542  1e-153  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  61.63 
 
 		 417 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 		 412 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0417  serine hydroxymethyltransferase  62.62 
 
 		 420 aa  538  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  61.56 
 
 		 432 aa  539  9.999999999999999e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  61.63 
 
 		 417 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  61.63 
 
 		 417 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  60.91 
 
 		 417 aa  535  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  60.61 
 
 		 419 aa  535  1e-151  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  62.29 
 
 		 416 aa  535  1e-151  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  60.91 
 
 		 417 aa  536  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  61.39 
 
 		 417 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  63.01 
 
 		 412 aa  536  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  62.14 
 
 		 417 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  61.35 
 
 		 412 aa  535  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0004  serine hydroxymethyltransferase  61.48 
 
 		 416 aa  535  1e-151  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2311  Glycine hydroxymethyltransferase  63.22 
 
 		 466 aa  537  1e-151  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000314902  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  63.01 
 
 		 412 aa  536  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  63.22 
 
 		 417 aa  534  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  61.43 
 
 		 414 aa  531  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  62.02 
 
 		 417 aa  532  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2083  serine hydroxymethyltransferase  61.11 
 
 		 418 aa  533  1e-150  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  62.41 
 
 		 440 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  60.43 
 
 		 417 aa  532  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  64.39 
 
 		 417 aa  532  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  62.35 
 
 		 437 aa  533  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  62.53 
 
 		 420 aa  533  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  61.35 
 
 		 414 aa  533  1e-150  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  61.58 
 
 		 412 aa  531  1e-149  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  61.63 
 
 		 413 aa  530  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  62.29 
 
 		 438 aa  529  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  61.19 
 
 		 414 aa  530  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  61.19 
 
 		 414 aa  530  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  61.34 
 
 		 413 aa  528  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5930  glycine hydroxymethyltransferase  61.5 
 
 		 438 aa  528  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.0770182 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6283  glycine hydroxymethyltransferase  62.86 
 
 		 419 aa  531  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  61.63 
 
 		 427 aa  530  1e-149  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  62.11 
 
 		 413 aa  530  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  61.39 
 
 		 413 aa  528  1e-149  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 		 417 aa  528  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  60.82 
 
 		 417 aa  531  1e-149  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  60.48 
 
 		 417 aa  529  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  58.99 
 
 		 414 aa  528  1e-149  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  62.77 
 
 		 417 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1912  serine hydroxymethyltransferase  62.95 
 
 		 430 aa  530  1e-149  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.637321  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0373  serine hydroxymethyltransferase  62.26 
 
 		 419 aa  528  1e-149  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.238829  normal  0.155765 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1033  serine hydroxymethyltransferase  61.39 
 
 		 417 aa  530  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414818  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  62.77 
 
 		 417 aa  531  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  61.81 
 
 		 439 aa  530  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0671  serine hydroxymethyltransferase  60.96 
 
 		 417 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.557812  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2477  serine hydroxymethyltransferase  60.44 
 
 		 417 aa  525  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4031  serine hydroxymethyltransferase  60.68 
 
 		 417 aa  526  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4632  serine hydroxymethyltransferase  61.69 
 
 		 417 aa  525  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10278  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  61.96 
 
 		 438 aa  526  1e-148  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3094  glycine hydroxymethyltransferase  61.93 
 
 		 417 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2027  glycine hydroxymethyltransferase  63.37 
 
 		 417 aa  528  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3274  serine hydroxymethyltransferase  61.58 
 
 		 412 aa  525  1e-148  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000462006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  61.45 
 
 		 413 aa  526  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 		 417 aa  528  1e-148  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  61.39 
 
 		 413 aa  527  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  60.67 
 
 		 417 aa  526  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4132  serine hydroxymethyltransferase  61.87 
 
 		 417 aa  526  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000588766  normal  0.517769 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  63.41 
 
 		 412 aa  525  1e-148  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  60.68 
 
 		 425 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>