More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5930 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5930  glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 438 aa  890    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.0770182 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0004  serine hydroxymethyltransferase  72.29 
 
 		 416 aa  635    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2165  serine hydroxymethyltransferase  71.5 
 
 		 414 aa  627  1e-178  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.675395  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0603  serine hydroxymethyltransferase  70.84 
 
 		 416 aa  616  1e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3262  serine hydroxymethyltransferase  72.73 
 
 		 454 aa  610  1e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  70.56 
 
 		 415 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2075  serine hydroxymethyltransferase  69.83 
 
 		 415 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  69.83 
 
 		 415 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1551  serine hydroxymethyltransferase  69.4 
 
 		 416 aa  598  1e-170  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3250  serine hydroxymethyltransferase  69.83 
 
 		 415 aa  599  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3196  serine hydroxymethyltransferase  69.83 
 
 		 415 aa  599  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0834  serine hydroxymethyltransferase  69.83 
 
 		 415 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3234  serine hydroxymethyltransferase  69.59 
 
 		 415 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1942  serine hydroxymethyltransferase  69.83 
 
 		 415 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2581  serine hydroxymethyltransferase  70.56 
 
 		 415 aa  594  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0775  serine hydroxymethyltransferase  71.05 
 
 		 415 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0739852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3895  serine hydroxymethyltransferase  71.29 
 
 		 415 aa  596  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0765  serine hydroxymethyltransferase  71.05 
 
 		 415 aa  596  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186767  normal  0.156833 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1379  serine hydroxymethyltransferase  69.34 
 
 		 415 aa  597  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2449  serine hydroxymethyltransferase  70.8 
 
 		 415 aa  597  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0323  serine hydroxymethyltransferase  71.05 
 
 		 415 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0806  serine hydroxymethyltransferase  71.05 
 
 		 415 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0678  serine hydroxymethyltransferase  69.61 
 
 		 415 aa  593  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.478588 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0790  serine hydroxymethyltransferase  69.12 
 
 		 415 aa  592  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2754  serine hydroxymethyltransferase  71.15 
 
 		 415 aa  592  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0700  serine hydroxymethyltransferase  70.8 
 
 		 431 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0504784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0683  serine hydroxymethyltransferase  70.56 
 
 		 431 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2927  serine hydroxymethyltransferase  69.93 
 
 		 415 aa  592  1e-168  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0729  serine hydroxymethyltransferase  68.87 
 
 		 415 aa  588  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0722  serine hydroxymethyltransferase  69.61 
 
 		 436 aa  590  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59476  normal  0.142236 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3363  serine hydroxymethyltransferase  71.15 
 
 		 415 aa  591  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2680  serine hydroxymethyltransferase  69.12 
 
 		 508 aa  588  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5200  serine hydroxymethyltransferase  70.66 
 
 		 415 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1917  serine hydroxymethyltransferase  67.15 
 
 		 430 aa  585  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.584505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  68.11 
 
 		 417 aa  582  1.0000000000000001e-165  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2044  serine hydroxymethyltransferase  67.71 
 
 		 414 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1660  serine hydroxymethyltransferase  67.71 
 
 		 414 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.445565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2874  serine hydroxymethyltransferase  69.14 
 
 		 414 aa  583  1.0000000000000001e-165  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3100  serine hydroxymethyltransferase  69.14 
 
 		 414 aa  578  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.208714  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2658  serine hydroxymethyltransferase  66.91 
 
 		 414 aa  578  1e-164  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0261213  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0615  Glycine hydroxymethyltransferase  69.31 
 
 		 415 aa  578  1e-164  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0373  serine hydroxymethyltransferase  68.59 
 
 		 419 aa  578  1e-164  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.238829  normal  0.155765 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0307  serine hydroxymethyltransferase  66.43 
 
 		 414 aa  577  1.0000000000000001e-163  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.209874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  67.55 
 
 		 416 aa  576  1.0000000000000001e-163  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2992  serine hydroxymethyltransferase  68.81 
 
 		 414 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.802435  normal  0.346056 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  67.55 
 
 		 417 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4955  glycine hydroxymethyltransferase  68.36 
 
 		 415 aa  575  1.0000000000000001e-163  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04405  serine hydroxymethyltransferase  67.39 
 
 		 417 aa  572  1.0000000000000001e-162  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2907  serine hydroxymethyltransferase  66.67 
 
 		 414 aa  574  1.0000000000000001e-162  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291862  normal  0.0486853 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1660  serine hydroxymethyltransferase  67.79 
 
 		 418 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0479076  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  66.59 
 
 		 417 aa  574  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6283  glycine hydroxymethyltransferase  68.35 
 
 		 419 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  67.31 
 
 		 417 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2477  serine hydroxymethyltransferase  65.47 
 
 		 417 aa  568  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4031  serine hydroxymethyltransferase  65.71 
 
 		 417 aa  568  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  66.83 
 
 		 417 aa  570  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  64.75 
 
 		 417 aa  569  1e-161  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0417  serine hydroxymethyltransferase  63.81 
 
 		 420 aa  568  1e-161  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0279  serine hydroxymethyltransferase  67.63 
 
 		 414 aa  566  1e-160  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.681758  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4246  glycine hydroxymethyltransferase  69.31 
 
 		 438 aa  566  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.499232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2027  glycine hydroxymethyltransferase  65.87 
 
 		 417 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2312  serine hydroxymethyltransferase  64.95 
 
 		 412 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.297378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2938  serine hydroxymethyltransferase  66.5 
 
 		 421 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2762  serine hydroxymethyltransferase  65.47 
 
 		 417 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1871  Glycine hydroxymethyltransferase  66.11 
 
 		 417 aa  562  1.0000000000000001e-159  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1912  serine hydroxymethyltransferase  65.07 
 
 		 430 aa  559  1e-158  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.637321  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4270  serine hydroxymethyltransferase  65.14 
 
 		 417 aa  560  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  66.35 
 
 		 417 aa  560  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4513  serine hydroxymethyltransferase  65.38 
 
 		 417 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0695784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  64.51 
 
 		 417 aa  558  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  64.75 
 
 		 417 aa  558  1e-158  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  64.51 
 
 		 417 aa  558  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  63.79 
 
 		 417 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0671  serine hydroxymethyltransferase  64.9 
 
 		 417 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.557812  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  64.51 
 
 		 417 aa  557  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4632  serine hydroxymethyltransferase  64.9 
 
 		 417 aa  556  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10278  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4132  serine hydroxymethyltransferase  65.95 
 
 		 417 aa  556  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000588766  normal  0.517769 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0702  serine hydroxymethyltransferase  64.9 
 
 		 417 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0603318  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  64.03 
 
 		 417 aa  557  1e-157  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4877  serine hydroxymethyltransferase  64.66 
 
 		 417 aa  557  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.402887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  64.51 
 
 		 417 aa  557  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  63.79 
 
 		 417 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1851  serine hydroxymethyltransferase  65.07 
 
 		 417 aa  557  1e-157  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6203  serine hydroxymethyltransferase  66.43 
 
 		 417 aa  555  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0377267  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  64.27 
 
 		 417 aa  557  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0703  serine hydroxymethyltransferase  64.66 
 
 		 417 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71460  serine hydroxymethyltransferase  66.19 
 
 		 417 aa  555  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0197843  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0322  serine hydroxymethyltransferase  65.71 
 
 		 417 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457346  decreased coverage  0.0000286459 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2083  serine hydroxymethyltransferase  65.43 
 
 		 418 aa  553  1e-156  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3044  serine hydroxymethyltransferase  64.03 
 
 		 417 aa  551  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.196975  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1344  serine hydroxymethyltransferase  66.27 
 
 		 417 aa  552  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0345  serine hydroxymethyltransferase  65.71 
 
 		 417 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.911009 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3094  glycine hydroxymethyltransferase  66.11 
 
 		 417 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02987  serine hydroxymethyltransferase  64.83 
 
 		 418 aa  551  1e-156  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00150285  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  63.55 
 
 		 417 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  63.16 
 
 		 422 aa  551  1e-156  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0344  serine hydroxymethyltransferase  65.71 
 
 		 417 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.963128 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4885  serine hydroxymethyltransferase  65.47 
 
 		 417 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.994809  normal  0.551008 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1033  serine hydroxymethyltransferase  63.55 
 
 		 417 aa  551  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414818  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  63.79 
 
 		 417 aa  554  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>