More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1025 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 422 aa  875    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  70.17 
 
 		 417 aa  594  1e-168  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  65.53 
 
 		 412 aa  570  1e-161  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  66.67 
 
 		 415 aa  568  1e-161  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  66.02 
 
 		 418 aa  561  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  64.63 
 
 		 411 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  65.21 
 
 		 412 aa  558  1e-158  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  65.61 
 
 		 414 aa  560  1e-158  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  62.56 
 
 		 414 aa  555  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  62.56 
 
 		 414 aa  555  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  64.63 
 
 		 416 aa  554  1e-157  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  65.55 
 
 		 422 aa  557  1e-157  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  62.47 
 
 		 413 aa  553  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  62.32 
 
 		 414 aa  552  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  62.47 
 
 		 413 aa  552  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  62.47 
 
 		 413 aa  551  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5930  glycine hydroxymethyltransferase  63.16 
 
 		 438 aa  551  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.0770182 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  62.23 
 
 		 413 aa  550  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  64.08 
 
 		 415 aa  550  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  62.23 
 
 		 413 aa  551  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  62.23 
 
 		 413 aa  551  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  64.08 
 
 		 415 aa  550  1e-155  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  64.23 
 
 		 413 aa  550  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  63.75 
 
 		 412 aa  544  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  63.86 
 
 		 431 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0004  serine hydroxymethyltransferase  63.57 
 
 		 416 aa  545  1e-154  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  66.59 
 
 		 413 aa  548  1e-154  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  61.99 
 
 		 413 aa  548  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  64.1 
 
 		 431 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2680  serine hydroxymethyltransferase  66.09 
 
 		 508 aa  546  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  63.75 
 
 		 412 aa  544  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  63.4 
 
 		 424 aa  545  1e-154  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  63.41 
 
 		 412 aa  544  1e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  61.26 
 
 		 413 aa  541  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  62.2 
 
 		 412 aa  543  1e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  63.64 
 
 		 415 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0729  serine hydroxymethyltransferase  65.36 
 
 		 415 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  62.38 
 
 		 415 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  65.85 
 
 		 417 aa  540  9.999999999999999e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2075  serine hydroxymethyltransferase  65.11 
 
 		 415 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3196  serine hydroxymethyltransferase  65.11 
 
 		 415 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3234  serine hydroxymethyltransferase  65.11 
 
 		 415 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0790  serine hydroxymethyltransferase  64.86 
 
 		 415 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0678  serine hydroxymethyltransferase  65.11 
 
 		 415 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.478588 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3250  serine hydroxymethyltransferase  65.11 
 
 		 415 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2312  serine hydroxymethyltransferase  62.65 
 
 		 412 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.297378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  61.47 
 
 		 423 aa  538  9.999999999999999e-153  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1942  serine hydroxymethyltransferase  65.11 
 
 		 415 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  63.39 
 
 		 415 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1379  serine hydroxymethyltransferase  64.86 
 
 		 415 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  65.11 
 
 		 415 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  64.62 
 
 		 415 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  62.56 
 
 		 419 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0834  serine hydroxymethyltransferase  65.11 
 
 		 415 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  64.44 
 
 		 417 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  63.37 
 
 		 431 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  63.14 
 
 		 413 aa  535  1e-151  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  62.35 
 
 		 415 aa  536  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  61.54 
 
 		 416 aa  537  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  63.21 
 
 		 416 aa  537  1e-151  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2581  serine hydroxymethyltransferase  65.85 
 
 		 415 aa  536  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0683  serine hydroxymethyltransferase  66.34 
 
 		 431 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04405  serine hydroxymethyltransferase  64.88 
 
 		 417 aa  532  1e-150  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  62.8 
 
 		 427 aa  531  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0775  serine hydroxymethyltransferase  65.11 
 
 		 415 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0739852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0722  serine hydroxymethyltransferase  64.13 
 
 		 436 aa  532  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59476  normal  0.142236 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  59.08 
 
 		 414 aa  532  1e-150  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0700  serine hydroxymethyltransferase  66.09 
 
 		 431 aa  534  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0504784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0806  serine hydroxymethyltransferase  65.11 
 
 		 415 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1887  Glycine hydroxymethyltransferase  65.19 
 
 		 419 aa  533  1e-150  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1917  serine hydroxymethyltransferase  63.48 
 
 		 430 aa  532  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.584505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  62.84 
 
 		 417 aa  532  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0323  serine hydroxymethyltransferase  65.11 
 
 		 415 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  61.52 
 
 		 412 aa  531  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  62.04 
 
 		 413 aa  531  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5200  serine hydroxymethyltransferase  66.34 
 
 		 415 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0307  serine hydroxymethyltransferase  63.08 
 
 		 414 aa  529  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.209874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0615  Glycine hydroxymethyltransferase  63.14 
 
 		 415 aa  529  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  60.68 
 
 		 423 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  63.1 
 
 		 427 aa  528  1e-149  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2165  serine hydroxymethyltransferase  62.65 
 
 		 414 aa  528  1e-149  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.675395  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  63.1 
 
 		 427 aa  528  1e-149  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  61.37 
 
 		 415 aa  531  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3895  serine hydroxymethyltransferase  65.11 
 
 		 415 aa  530  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  62.65 
 
 		 439 aa  528  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  62.84 
 
 		 417 aa  528  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3363  serine hydroxymethyltransferase  65.85 
 
 		 415 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2449  serine hydroxymethyltransferase  65.11 
 
 		 415 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6283  glycine hydroxymethyltransferase  62.1 
 
 		 419 aa  526  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  62.41 
 
 		 438 aa  527  1e-148  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2083  serine hydroxymethyltransferase  62.75 
 
 		 418 aa  527  1e-148  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0821  serine hydroxymethyltransferase  61.54 
 
 		 431 aa  525  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2754  serine hydroxymethyltransferase  65.11 
 
 		 415 aa  528  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  61.46 
 
 		 429 aa  527  1e-148  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  61.46 
 
 		 431 aa  527  1e-148  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  60.44 
 
 		 423 aa  527  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  61.41 
 
 		 427 aa  526  1e-148  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1912  serine hydroxymethyltransferase  64.29 
 
 		 430 aa  525  1e-148  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.637321  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0765  serine hydroxymethyltransferase  64.62 
 
 		 415 aa  527  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186767  normal  0.156833 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  60.58 
 
 		 425 aa  526  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>