More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0499 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 417 aa  863    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  70.17 
 
 		 422 aa  594  1e-168  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  67.41 
 
 		 414 aa  571  1e-161  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  64.63 
 
 		 413 aa  570  1e-161  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  64.72 
 
 		 418 aa  555  1e-157  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  64.56 
 
 		 415 aa  551  1e-156  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  64.02 
 
 		 412 aa  550  1e-155  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  62.93 
 
 		 413 aa  545  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  63.73 
 
 		 411 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  62.68 
 
 		 413 aa  541  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  62.68 
 
 		 413 aa  542  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  64.06 
 
 		 412 aa  541  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  62.68 
 
 		 413 aa  543  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  62.68 
 
 		 414 aa  542  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  62.68 
 
 		 414 aa  541  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  62.68 
 
 		 414 aa  542  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  62.68 
 
 		 413 aa  541  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  62.68 
 
 		 413 aa  542  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  62.5 
 
 		 412 aa  535  1e-151  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  63.17 
 
 		 419 aa  535  1e-151  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  62.2 
 
 		 416 aa  535  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  62.2 
 
 		 413 aa  536  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  61.95 
 
 		 413 aa  535  1e-151  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  62.81 
 
 		 416 aa  536  1e-151  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  63.05 
 
 		 412 aa  532  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5930  glycine hydroxymethyltransferase  60.63 
 
 		 438 aa  533  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.0770182 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  63.05 
 
 		 412 aa  532  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  63.73 
 
 		 413 aa  533  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  61.2 
 
 		 424 aa  534  1e-150  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  61.12 
 
 		 412 aa  532  1e-150  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  62.81 
 
 		 417 aa  528  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  63.7 
 
 		 420 aa  530  1e-149  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1264  serine hydroxymethyltransferase  63.26 
 
 		 426 aa  529  1e-149  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  60.72 
 
 		 422 aa  529  1e-149  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  62.53 
 
 		 417 aa  528  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  62.75 
 
 		 415 aa  530  1e-149  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2312  serine hydroxymethyltransferase  61.12 
 
 		 412 aa  526  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.297378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  62.5 
 
 		 415 aa  527  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  61.67 
 
 		 415 aa  526  1e-148  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  62.29 
 
 		 417 aa  524  1e-147  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  62.32 
 
 		 417 aa  521  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  61.76 
 
 		 415 aa  523  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0004  serine hydroxymethyltransferase  61.03 
 
 		 416 aa  523  1e-147  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 		 423 aa  521  1e-147  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  61.52 
 
 		 415 aa  520  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2083  serine hydroxymethyltransferase  62.1 
 
 		 418 aa  520  1e-146  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2477  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 417 aa  518  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4031  serine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 		 417 aa  519  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  61.58 
 
 		 412 aa  520  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  60.69 
 
 		 412 aa  520  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  60.83 
 
 		 417 aa  518  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  60.98 
 
 		 415 aa  520  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1887  Glycine hydroxymethyltransferase  61.8 
 
 		 419 aa  518  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0373  serine hydroxymethyltransferase  60.77 
 
 		 419 aa  518  1e-146  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.238829  normal  0.155765 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2762  serine hydroxymethyltransferase  61.82 
 
 		 417 aa  518  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  61.03 
 
 		 415 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  62.22 
 
 		 417 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3044  serine hydroxymethyltransferase  61.82 
 
 		 417 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.196975  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  62.07 
 
 		 417 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  60.82 
 
 		 427 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2187  Glycine hydroxymethyltransferase  60.78 
 
 		 418 aa  516  1.0000000000000001e-145  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  60.82 
 
 		 427 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3262  serine hydroxymethyltransferase  61.79 
 
 		 454 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  62.07 
 
 		 417 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  62.56 
 
 		 417 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  62.56 
 
 		 417 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  60.83 
 
 		 416 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  60.73 
 
 		 415 aa  517  1.0000000000000001e-145  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  61.58 
 
 		 417 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  61.82 
 
 		 417 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  61.31 
 
 		 413 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  61.82 
 
 		 417 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  61.58 
 
 		 417 aa  513  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  60.78 
 
 		 415 aa  513  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  60.2 
 
 		 413 aa  512  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  62.32 
 
 		 417 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  62.56 
 
 		 417 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  62.07 
 
 		 417 aa  513  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1231  serine hydroxymethyltransferase  61.33 
 
 		 417 aa  512  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  62.47 
 
 		 415 aa  512  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  62.84 
 
 		 417 aa  513  1e-144  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  60.83 
 
 		 417 aa  514  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  58.15 
 
 		 414 aa  513  1e-144  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2075  serine hydroxymethyltransferase  61.48 
 
 		 415 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3234  serine hydroxymethyltransferase  61.48 
 
 		 415 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 		 417 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0834  serine hydroxymethyltransferase  61.48 
 
 		 415 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1942  serine hydroxymethyltransferase  61.48 
 
 		 415 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3250  serine hydroxymethyltransferase  61.48 
 
 		 415 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 		 429 aa  510  1e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  59.47 
 
 		 427 aa  508  1e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1379  serine hydroxymethyltransferase  61.73 
 
 		 415 aa  511  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0417  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 420 aa  510  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  61.48 
 
 		 415 aa  509  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3274  serine hydroxymethyltransferase  60.29 
 
 		 412 aa  508  1e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000462006  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3196  serine hydroxymethyltransferase  61.48 
 
 		 415 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1579  serine hydroxymethyltransferase  59.47 
 
 		 431 aa  509  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  60.59 
 
 		 410 aa  511  1e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1871  Glycine hydroxymethyltransferase  61.48 
 
 		 417 aa  508  1e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0790  serine hydroxymethyltransferase  62.03 
 
 		 415 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>