More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0810 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 414 aa  853    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  71.67 
 
 		 415 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  68.45 
 
 		 416 aa  600  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  70.34 
 
 		 418 aa  596  1e-169  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  69.83 
 
 		 411 aa  597  1e-169  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  70.76 
 
 		 417 aa  591  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  70 
 
 		 415 aa  589  1e-167  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  70 
 
 		 415 aa  590  1e-167  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  68.78 
 
 		 415 aa  584  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  65.78 
 
 		 412 aa  586  1e-166  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  68.13 
 
 		 412 aa  586  1e-166  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  67.07 
 
 		 413 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  67.16 
 
 		 417 aa  582  1.0000000000000001e-165  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  66.91 
 
 		 415 aa  582  1.0000000000000001e-165  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  69.14 
 
 		 413 aa  578  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  68.38 
 
 		 412 aa  580  1e-164  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  67.8 
 
 		 415 aa  579  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  67.56 
 
 		 415 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  66.26 
 
 		 413 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  64.63 
 
 		 414 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  67.32 
 
 		 413 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  66.1 
 
 		 415 aa  571  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  67.32 
 
 		 413 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  67.24 
 
 		 416 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  67.32 
 
 		 413 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  67.07 
 
 		 413 aa  571  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  67.07 
 
 		 413 aa  571  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  67.32 
 
 		 413 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  65.85 
 
 		 411 aa  573  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  67.08 
 
 		 420 aa  568  1e-161  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  66.83 
 
 		 413 aa  568  1e-161  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  67.16 
 
 		 414 aa  569  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  67.16 
 
 		 414 aa  570  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  67.4 
 
 		 414 aa  571  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  65.61 
 
 		 422 aa  568  1e-161  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  65.38 
 
 		 419 aa  569  1e-161  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  67.97 
 
 		 417 aa  570  1e-161  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  67.07 
 
 		 413 aa  568  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  67.16 
 
 		 412 aa  570  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  67 
 
 		 410 aa  564  1e-160  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  66.26 
 
 		 412 aa  564  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  66.75 
 
 		 410 aa  561  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  66.26 
 
 		 412 aa  564  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  65.11 
 
 		 412 aa  553  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  66.67 
 
 		 427 aa  552  1e-156  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  63.35 
 
 		 412 aa  548  1e-155  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  65.12 
 
 		 415 aa  550  1e-155  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  65.11 
 
 		 413 aa  550  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  66.43 
 
 		 427 aa  550  1e-155  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  65.2 
 
 		 417 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  64.49 
 
 		 424 aa  546  1e-154  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  64.37 
 
 		 417 aa  542  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2075  serine hydroxymethyltransferase  63.73 
 
 		 415 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3196  serine hydroxymethyltransferase  63.73 
 
 		 415 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  62.29 
 
 		 412 aa  543  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1942  serine hydroxymethyltransferase  63.73 
 
 		 415 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3250  serine hydroxymethyltransferase  63.73 
 
 		 415 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  64.13 
 
 		 417 aa  541  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  64.56 
 
 		 413 aa  544  1e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  63.73 
 
 		 415 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0834  serine hydroxymethyltransferase  63.73 
 
 		 415 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  64.13 
 
 		 417 aa  541  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  60.98 
 
 		 414 aa  544  1e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0745  serine hydroxymethyltransferase  62.29 
 
 		 415 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  62.32 
 
 		 423 aa  540  9.999999999999999e-153  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3234  serine hydroxymethyltransferase  63.48 
 
 		 415 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1379  serine hydroxymethyltransferase  63.48 
 
 		 415 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  63.24 
 
 		 415 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  65.01 
 
 		 412 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  64.82 
 
 		 422 aa  538  9.999999999999999e-153  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1155  serine hydroxymethyltransferase  60.56 
 
 		 436 aa  541  9.999999999999999e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0851  glycine hydroxymethyltransferase  61.86 
 
 		 419 aa  536  1e-151  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0407045  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2311  Glycine hydroxymethyltransferase  63.17 
 
 		 466 aa  537  1e-151  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000314902  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0389  serine hydroxymethyltransferase  60.09 
 
 		 436 aa  535  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285606 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0729  serine hydroxymethyltransferase  63.66 
 
 		 415 aa  532  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0678  serine hydroxymethyltransferase  63.9 
 
 		 415 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.478588 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0295  serine hydroxymethyltransferase  60.93 
 
 		 414 aa  531  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2581  serine hydroxymethyltransferase  63.97 
 
 		 415 aa  532  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0775  serine hydroxymethyltransferase  64.22 
 
 		 415 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0739852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  64.52 
 
 		 412 aa  534  1e-150  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0023  serine hydroxymethyltransferase  63.66 
 
 		 436 aa  534  1e-150  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 		 420 aa  533  1e-150  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  63.66 
 
 		 417 aa  533  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0323  serine hydroxymethyltransferase  64.22 
 
 		 415 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2449  serine hydroxymethyltransferase  63.48 
 
 		 415 aa  531  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0471  serine hydroxymethyltransferase  60.93 
 
 		 414 aa  531  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.937307  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6283  glycine hydroxymethyltransferase  63.3 
 
 		 419 aa  532  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0806  serine hydroxymethyltransferase  64.22 
 
 		 415 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2927  serine hydroxymethyltransferase  62.2 
 
 		 415 aa  528  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6203  serine hydroxymethyltransferase  62.32 
 
 		 417 aa  528  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0377267  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0722  serine hydroxymethyltransferase  63.41 
 
 		 436 aa  529  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59476  normal  0.142236 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0790  serine hydroxymethyltransferase  62.2 
 
 		 415 aa  528  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3895  serine hydroxymethyltransferase  63.73 
 
 		 415 aa  528  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0127  Glycine hydroxymethyltransferase  59.77 
 
 		 435 aa  528  1e-149  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0307  serine hydroxymethyltransferase  63.14 
 
 		 414 aa  528  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.209874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1264  serine hydroxymethyltransferase  64.86 
 
 		 426 aa  528  1e-149  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1389  Glycine hydroxymethyltransferase  61.23 
 
 		 427 aa  530  1e-149  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000692081  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0700  serine hydroxymethyltransferase  63.97 
 
 		 431 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0504784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0683  serine hydroxymethyltransferase  63.97 
 
 		 431 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71460  serine hydroxymethyltransferase  62.32 
 
 		 417 aa  528  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0197843  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>