More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1389 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1389  Glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 427 aa  877    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000692081  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  63.03 
 
 		 412 aa  529  1e-149  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  62.03 
 
 		 411 aa  528  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 415 aa  526  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  60.79 
 
 		 410 aa  525  1e-148  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  57.84 
 
 		 412 aa  521  1e-147  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  60.55 
 
 		 410 aa  521  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  61.22 
 
 		 413 aa  522  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  61.18 
 
 		 412 aa  522  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  60.73 
 
 		 411 aa  523  1e-147  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  60.54 
 
 		 412 aa  520  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  60.54 
 
 		 412 aa  520  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  61.23 
 
 		 414 aa  520  1e-146  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  60.93 
 
 		 417 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  61.43 
 
 		 417 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  62.6 
 
 		 415 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  59.75 
 
 		 412 aa  515  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  59.21 
 
 		 422 aa  514  1.0000000000000001e-145  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  61.77 
 
 		 415 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  61.61 
 
 		 418 aa  518  1.0000000000000001e-145  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  61.83 
 
 		 415 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  62.37 
 
 		 416 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  60.93 
 
 		 417 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  60.73 
 
 		 417 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  59.11 
 
 		 413 aa  514  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  58.87 
 
 		 414 aa  513  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  58.87 
 
 		 414 aa  513  1e-144  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  59.11 
 
 		 414 aa  514  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  61.11 
 
 		 415 aa  513  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  58.87 
 
 		 413 aa  512  1e-144  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  60.44 
 
 		 417 aa  514  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  61.27 
 
 		 415 aa  512  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  58.87 
 
 		 413 aa  513  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  61.58 
 
 		 415 aa  513  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  59.8 
 
 		 412 aa  512  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  59.11 
 
 		 413 aa  513  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  58.87 
 
 		 413 aa  511  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  58.88 
 
 		 413 aa  508  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  58.87 
 
 		 413 aa  511  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  58.62 
 
 		 413 aa  509  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  61.48 
 
 		 417 aa  509  1e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  61.07 
 
 		 413 aa  508  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  58.44 
 
 		 412 aa  506  9.999999999999999e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  58.13 
 
 		 413 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  58.44 
 
 		 420 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  58.54 
 
 		 417 aa  503  1e-141  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  57.11 
 
 		 415 aa  503  1e-141  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0959  Glycine hydroxymethyltransferase  58.56 
 
 		 410 aa  500  1e-140  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.587194  normal  0.162631 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  59.37 
 
 		 416 aa  499  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1649  serine hydroxymethyltransferase  60.4 
 
 		 434 aa  496  1e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  57.99 
 
 		 414 aa  496  1e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0851  glycine hydroxymethyltransferase  58.96 
 
 		 419 aa  494  1e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0407045  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0075  serine hydroxymethyltransferase  56.69 
 
 		 413 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  55.23 
 
 		 414 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  57.11 
 
 		 413 aa  493  9.999999999999999e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  55.88 
 
 		 413 aa  489  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  55.21 
 
 		 415 aa  489  1e-137  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  56.46 
 
 		 429 aa  488  1e-137  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  56.77 
 
 		 431 aa  490  1e-137  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  57.8 
 
 		 415 aa  487  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  59.18 
 
 		 427 aa  486  1e-136  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  59.18 
 
 		 427 aa  487  1e-136  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  58.04 
 
 		 425 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  55.15 
 
 		 412 aa  483  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  57.18 
 
 		 427 aa  484  1e-135  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  58.04 
 
 		 425 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1630  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  58.31 
 
 		 566 aa  482  1e-135  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1264  serine hydroxymethyltransferase  57.52 
 
 		 426 aa  482  1e-135  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  56.86 
 
 		 419 aa  482  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  57.28 
 
 		 439 aa  484  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  56.43 
 
 		 438 aa  479  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2075  serine hydroxymethyltransferase  55.12 
 
 		 415 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3250  serine hydroxymethyltransferase  55.12 
 
 		 415 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3196  serine hydroxymethyltransferase  55.12 
 
 		 415 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1942  serine hydroxymethyltransferase  55.12 
 
 		 415 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0834  serine hydroxymethyltransferase  55.12 
 
 		 415 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  55.12 
 
 		 415 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  56.19 
 
 		 438 aa  477  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  52.87 
 
 		 423 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3234  serine hydroxymethyltransferase  54.88 
 
 		 415 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  56.14 
 
 		 422 aa  477  1e-133  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  56.46 
 
 		 424 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  55.58 
 
 		 427 aa  476  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  55.53 
 
 		 424 aa  477  1e-133  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1537  serine hydroxymethyltransferase  55.37 
 
 		 427 aa  477  1e-133  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.54072 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  59.85 
 
 		 412 aa  474  1e-132  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0700  serine hydroxymethyltransferase  55.61 
 
 		 431 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0504784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4027  glycine hydroxymethyltransferase  55.88 
 
 		 421 aa  472  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17117  normal  0.0123375 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3895  serine hydroxymethyltransferase  55.12 
 
 		 415 aa  471  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2754  serine hydroxymethyltransferase  55.75 
 
 		 415 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  52.98 
 
 		 423 aa  471  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1379  serine hydroxymethyltransferase  54.39 
 
 		 415 aa  474  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2581  serine hydroxymethyltransferase  55.12 
 
 		 415 aa  474  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  54.63 
 
 		 415 aa  473  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0469  serine hydroxymethyltransferase  57.45 
 
 		 474 aa  474  1e-132  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996315  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  55.21 
 
 		 437 aa  472  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0745  serine hydroxymethyltransferase  56.37 
 
 		 415 aa  471  1e-132  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0683  serine hydroxymethyltransferase  55.85 
 
 		 431 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5200  serine hydroxymethyltransferase  55.61 
 
 		 415 aa  472  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0806  serine hydroxymethyltransferase  54.88 
 
 		 415 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>