More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_24721 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  75.74 
 
 		 411 aa  666    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02841  serine hydroxymethyltransferase  78.31 
 
 		 416 aa  694    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  83.89 
 
 		 429 aa  727    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  84.38 
 
 		 431 aa  733    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  75.49 
 
 		 423 aa  676    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  78.68 
 
 		 427 aa  671    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  75.37 
 
 		 425 aa  655    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  75 
 
 		 411 aa  667    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  75.73 
 
 		 423 aa  673    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 424 aa  872    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  75.73 
 
 		 423 aa  679    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  75.37 
 
 		 425 aa  655    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  75.97 
 
 		 423 aa  682    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1678  serine hydroxymethyltransferase  77.21 
 
 		 426 aa  632  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  71.32 
 
 		 427 aa  624  1e-178  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4802  serine hydroxymethyltransferase  75.25 
 
 		 427 aa  625  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2076  serine hydroxymethyltransferase  74.26 
 
 		 427 aa  622  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.745833  hitchhiker  0.000706319 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  69.98 
 
 		 425 aa  616  1e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  61.61 
 
 		 415 aa  534  1e-150  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  61.22 
 
 		 412 aa  530  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  61.22 
 
 		 412 aa  530  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  61.89 
 
 		 413 aa  530  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 		 412 aa  523  1e-147  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  61.37 
 
 		 412 aa  521  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  60.92 
 
 		 415 aa  521  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  60.64 
 
 		 411 aa  524  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  61.37 
 
 		 412 aa  522  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  61.03 
 
 		 415 aa  520  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 		 412 aa  518  1e-146  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  60.19 
 
 		 417 aa  519  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  59.8 
 
 		 415 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 		 431 aa  514  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1610  serine hydroxymethyltransferase  60.96 
 
 		 429 aa  515  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2305  serine hydroxymethyltransferase  60.67 
 
 		 434 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  58.92 
 
 		 413 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  60.28 
 
 		 427 aa  514  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  59.61 
 
 		 410 aa  514  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  60.64 
 
 		 415 aa  517  1.0000000000000001e-145  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  61.12 
 
 		 420 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  62.47 
 
 		 416 aa  515  1.0000000000000001e-145  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  60.38 
 
 		 438 aa  513  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 		 416 aa  512  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  60.38 
 
 		 439 aa  513  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  61.54 
 
 		 433 aa  512  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  60.38 
 
 		 438 aa  513  1e-144  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0373  serine hydroxymethyltransferase  61.39 
 
 		 419 aa  512  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.238829  normal  0.155765 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 413 aa  513  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  61.86 
 
 		 413 aa  510  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  59.58 
 
 		 432 aa  508  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8588  serine hydroxymethyltransferase  60.29 
 
 		 420 aa  510  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  58.74 
 
 		 415 aa  509  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  58.33 
 
 		 418 aa  509  1e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  59.86 
 
 		 432 aa  508  1e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  60.72 
 
 		 437 aa  510  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  59.37 
 
 		 410 aa  511  1e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 		 419 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  59.35 
 
 		 432 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  58.09 
 
 		 413 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2113  serine hydroxymethyltransferase  60.98 
 
 		 424 aa  506  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  58.09 
 
 		 413 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  59.62 
 
 		 417 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  57.84 
 
 		 413 aa  504  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  57.84 
 
 		 413 aa  503  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  58.21 
 
 		 415 aa  503  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  58.85 
 
 		 434 aa  504  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  57.84 
 
 		 414 aa  503  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  57.84 
 
 		 414 aa  504  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  57.84 
 
 		 413 aa  504  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  59.61 
 
 		 412 aa  502  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0629  serine hydroxymethyltransferase  59.19 
 
 		 432 aa  503  1e-141  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2312  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 412 aa  502  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.297378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  58.58 
 
 		 422 aa  503  1e-141  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  58.52 
 
 		 412 aa  501  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2240  serine hydroxymethyltransferase  58.94 
 
 		 436 aa  502  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.435156  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2762  serine hydroxymethyltransferase  59.27 
 
 		 417 aa  501  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  57.6 
 
 		 413 aa  501  1e-141  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  58.85 
 
 		 434 aa  500  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  57.6 
 
 		 413 aa  500  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3094  glycine hydroxymethyltransferase  60.64 
 
 		 417 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4632  serine hydroxymethyltransferase  60.8 
 
 		 417 aa  498  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10278  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  57.84 
 
 		 414 aa  501  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  59.38 
 
 		 417 aa  501  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  57.66 
 
 		 422 aa  500  1e-140  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4712  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 417 aa  498  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6283  glycine hydroxymethyltransferase  60.2 
 
 		 419 aa  498  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  58.29 
 
 		 417 aa  500  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4877  serine hydroxymethyltransferase  60.55 
 
 		 417 aa  500  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.402887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  59.17 
 
 		 417 aa  498  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  57.84 
 
 		 413 aa  501  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0535  Glycine hydroxymethyltransferase  60 
 
 		 434 aa  498  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  58.89 
 
 		 417 aa  499  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6867  glycine hydroxymethyltransferase  59.32 
 
 		 431 aa  499  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.592385 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  59.43 
 
 		 433 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  58.29 
 
 		 415 aa  500  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  58.85 
 
 		 434 aa  500  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  58.5 
 
 		 415 aa  500  1e-140  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4270  serine hydroxymethyltransferase  60.8 
 
 		 417 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  57.69 
 
 		 417 aa  498  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2581  serine hydroxymethyltransferase  57.41 
 
 		 415 aa  496  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0703  serine hydroxymethyltransferase  60.55 
 
 		 417 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>