More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_03361 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  73.76 
 
 
425 aa  636    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  76.34 
 
 
423 aa  655    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  98.05 
 
 
411 aa  839    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02841  serine hydroxymethyltransferase  74.75 
 
 
416 aa  641    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  73.76 
 
 
425 aa  636    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  75.68 
 
 
429 aa  663    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  75.31 
 
 
431 aa  672    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  75 
 
 
424 aa  667    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  77.34 
 
 
423 aa  657    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  75.99 
 
 
427 aa  656    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  77.09 
 
 
423 aa  651    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  76.6 
 
 
423 aa  653    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 
411 aa  850    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2076  serine hydroxymethyltransferase  75 
 
 
427 aa  627  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.745833  hitchhiker  0.000706319 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  71.11 
 
 
427 aa  624  1e-178  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4802  serine hydroxymethyltransferase  75.5 
 
 
427 aa  624  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  71.04 
 
 
425 aa  614  1e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1678  serine hydroxymethyltransferase  75.62 
 
 
426 aa  613  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  61.39 
 
 
411 aa  527  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  62.81 
 
 
415 aa  521  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  61.67 
 
 
412 aa  522  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  61.67 
 
 
412 aa  522  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  59.31 
 
 
415 aa  518  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  59.56 
 
 
412 aa  518  1e-146  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  60.93 
 
 
413 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  61.08 
 
 
412 aa  517  1.0000000000000001e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  58.33 
 
 
413 aa  512  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  59.36 
 
 
412 aa  511  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  58.87 
 
 
412 aa  512  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  59.85 
 
 
420 aa  509  1e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  59.36 
 
 
412 aa  510  1e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  57.64 
 
 
418 aa  511  1e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2113  serine hydroxymethyltransferase  57.73 
 
 
424 aa  508  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332542  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  59.17 
 
 
415 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  57.35 
 
 
413 aa  504  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  57.35 
 
 
414 aa  504  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  58.09 
 
 
415 aa  504  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  58.58 
 
 
416 aa  504  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3004  serine hydroxymethyltransferase  59.56 
 
 
432 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21133  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  59.22 
 
 
433 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  59.51 
 
 
413 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  58.94 
 
 
437 aa  505  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  58.91 
 
 
417 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 
412 aa  501  1e-141  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1035  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 
425 aa  504  1e-141  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  57.35 
 
 
414 aa  504  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  57.35 
 
 
414 aa  504  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  57.8 
 
 
438 aa  501  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  58.88 
 
 
438 aa  503  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  57.64 
 
 
413 aa  503  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  57.64 
 
 
413 aa  503  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  57.35 
 
 
413 aa  504  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  57.35 
 
 
413 aa  504  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2634  serine hydroxymethyltransferase  58.74 
 
 
433 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8588  serine hydroxymethyltransferase  57.18 
 
 
420 aa  503  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  59.37 
 
 
427 aa  503  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  60.4 
 
 
410 aa  503  1e-141  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  57.14 
 
 
413 aa  498  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3196  serine hydroxymethyltransferase  59.75 
 
 
415 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  57.11 
 
 
415 aa  500  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  58.41 
 
 
427 aa  498  1e-140  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0959  Glycine hydroxymethyltransferase  60.55 
 
 
410 aa  499  1e-140  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.587194  normal  0.162631 
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  58.64 
 
 
438 aa  498  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0461  serine hydroxymethyltransferase  58.27 
 
 
417 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2075  serine hydroxymethyltransferase  59.75 
 
 
415 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4712  serine hydroxymethyltransferase  58.27 
 
 
417 aa  500  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0834  serine hydroxymethyltransferase  59.75 
 
 
415 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  58.64 
 
 
439 aa  501  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3250  serine hydroxymethyltransferase  59.75 
 
 
415 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  57.11 
 
 
413 aa  501  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3234  serine hydroxymethyltransferase  59.75 
 
 
415 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  58.01 
 
 
432 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2083  serine hydroxymethyltransferase  57.25 
 
 
418 aa  499  1e-140  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  58.72 
 
 
417 aa  500  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1942  serine hydroxymethyltransferase  59.75 
 
 
415 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 
410 aa  499  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  59.75 
 
 
415 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  57.6 
 
 
415 aa  499  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  56.9 
 
 
415 aa  498  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  58.72 
 
 
417 aa  501  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0765  serine hydroxymethyltransferase  59.26 
 
 
415 aa  495  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186767  normal  0.156833 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0791  serine hydroxymethyltransferase  62.56 
 
 
417 aa  496  1e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0762  serine hydroxymethyltransferase  62.56 
 
 
417 aa  495  1e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  56.66 
 
 
434 aa  494  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  58.07 
 
 
433 aa  496  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5208  serine hydroxymethyltransferase  59.01 
 
 
417 aa  497  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0287253 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3094  glycine hydroxymethyltransferase  58.02 
 
 
417 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  57.95 
 
 
416 aa  497  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1379  serine hydroxymethyltransferase  59.75 
 
 
415 aa  496  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  58.5 
 
 
431 aa  497  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2449  serine hydroxymethyltransferase  59.51 
 
 
415 aa  497  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  57.77 
 
 
432 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  58.41 
 
 
427 aa  498  1e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0323  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 
415 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  56.79 
 
 
415 aa  494  1e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0775  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 
415 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0739852  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0683  serine hydroxymethyltransferase  59.51 
 
 
431 aa  494  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5200  serine hydroxymethyltransferase  59.61 
 
 
415 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2927  serine hydroxymethyltransferase  58.42 
 
 
415 aa  494  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0256  serine hydroxymethyltransferase  59.5 
 
 
411 aa  495  1e-139  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.666958 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>