More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2076 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  73.28 
 
 
423 aa  641    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  74.26 
 
 
411 aa  646    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2076  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 
427 aa  882    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.745833  hitchhiker  0.000706319 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  79.81 
 
 
425 aa  707    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  72.25 
 
 
431 aa  638    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4802  serine hydroxymethyltransferase  84.07 
 
 
427 aa  728    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  73.28 
 
 
423 aa  644    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  79.06 
 
 
427 aa  709    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  74.02 
 
 
423 aa  649    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  75 
 
 
411 aa  648    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  79.81 
 
 
425 aa  707    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  74.26 
 
 
424 aa  643    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  74.26 
 
 
423 aa  651    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  85.25 
 
 
427 aa  769    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1678  serine hydroxymethyltransferase  82.2 
 
 
426 aa  697    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  77.96 
 
 
425 aa  702    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02841  serine hydroxymethyltransferase  71.39 
 
 
416 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  70.74 
 
 
429 aa  619  1e-176  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  62.08 
 
 
415 aa  544  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  61.89 
 
 
412 aa  544  1e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  61.63 
 
 
439 aa  538  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  61.12 
 
 
438 aa  538  9.999999999999999e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  59.66 
 
 
418 aa  538  9.999999999999999e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  61.81 
 
 
437 aa  541  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  60.68 
 
 
415 aa  535  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  60.63 
 
 
417 aa  535  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  61.12 
 
 
438 aa  537  1e-151  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1610  serine hydroxymethyltransferase  60.84 
 
 
429 aa  537  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  61.46 
 
 
412 aa  536  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  61.22 
 
 
419 aa  537  1e-151  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  60.49 
 
 
415 aa  532  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  59.56 
 
 
413 aa  528  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  60.77 
 
 
432 aa  528  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 
411 aa  530  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  59.56 
 
 
412 aa  529  1e-149  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  62.5 
 
 
413 aa  530  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  60.53 
 
 
431 aa  525  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 
412 aa  527  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 
412 aa  527  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  58.84 
 
 
413 aa  524  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  58.98 
 
 
415 aa  525  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  62.25 
 
 
420 aa  526  1e-148  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  61 
 
 
432 aa  527  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 
412 aa  523  1e-147  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0959  Glycine hydroxymethyltransferase  62.53 
 
 
410 aa  522  1e-147  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.587194  normal  0.162631 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  58.6 
 
 
413 aa  521  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  59.8 
 
 
415 aa  522  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 
415 aa  523  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  58.6 
 
 
413 aa  521  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 
412 aa  524  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 
410 aa  523  1e-147  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  58.78 
 
 
424 aa  519  1e-146  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  59.62 
 
 
427 aa  520  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  58.35 
 
 
414 aa  519  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  58.6 
 
 
414 aa  521  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  58.35 
 
 
413 aa  520  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  58.98 
 
 
414 aa  521  1e-146  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  58.35 
 
 
413 aa  519  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 
410 aa  519  1e-146  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  58.05 
 
 
415 aa  518  1e-146  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  58.41 
 
 
422 aa  515  1.0000000000000001e-145  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  58.35 
 
 
414 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  56.7 
 
 
423 aa  515  1.0000000000000001e-145  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  58.81 
 
 
431 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0700  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 
431 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0504784  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  58.35 
 
 
413 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  58.75 
 
 
416 aa  515  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  58.11 
 
 
413 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 
413 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3468  serine hydroxymethyltransferase  64.06 
 
 
418 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624379  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1649  serine hydroxymethyltransferase  60.89 
 
 
434 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  59.56 
 
 
412 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 
434 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  58.39 
 
 
422 aa  512  1e-144  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2312  serine hydroxymethyltransferase  59.31 
 
 
412 aa  514  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.297378  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  58.81 
 
 
431 aa  511  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  58.21 
 
 
416 aa  513  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3895  serine hydroxymethyltransferase  59.8 
 
 
415 aa  512  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  58.6 
 
 
413 aa  514  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2581  serine hydroxymethyltransferase  59.31 
 
 
415 aa  513  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  59.66 
 
 
414 aa  512  1e-144  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0806  serine hydroxymethyltransferase  59.8 
 
 
415 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  59.07 
 
 
415 aa  511  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0775  serine hydroxymethyltransferase  59.8 
 
 
415 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0739852  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  57.28 
 
 
414 aa  512  1e-144  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0323  serine hydroxymethyltransferase  59.8 
 
 
415 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0683  serine hydroxymethyltransferase  59.8 
 
 
431 aa  514  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  58.05 
 
 
417 aa  509  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  57.8 
 
 
415 aa  509  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8588  serine hydroxymethyltransferase  59.37 
 
 
420 aa  508  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6867  glycine hydroxymethyltransferase  58.96 
 
 
431 aa  511  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.592385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  59.47 
 
 
434 aa  510  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2449  serine hydroxymethyltransferase  58.82 
 
 
415 aa  508  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  58.81 
 
 
431 aa  511  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3363  serine hydroxymethyltransferase  59.38 
 
 
415 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1579  serine hydroxymethyltransferase  60.43 
 
 
431 aa  509  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0629  serine hydroxymethyltransferase  58.19 
 
 
432 aa  508  1e-143  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  57.8 
 
 
417 aa  508  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0765  serine hydroxymethyltransferase  59.31 
 
 
415 aa  510  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186767  normal  0.156833 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5200  serine hydroxymethyltransferase  59.13 
 
 
415 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>