More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0535 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0535  Glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 
434 aa  881    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0767  serine hydroxymethyltransferase  92.29 
 
 
445 aa  801    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3596  Glycine hydroxymethyltransferase  77.23 
 
 
447 aa  629  1e-179  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10070  serine hydroxymethyltransferase  73.57 
 
 
425 aa  626  1e-178  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.9411  normal  0.116151 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3705  serine hydroxymethyltransferase  76.28 
 
 
453 aa  625  1e-178  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13350  serine hydroxymethyltransferase  75.84 
 
 
423 aa  618  1e-176  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2884  Glycine hydroxymethyltransferase  74.29 
 
 
442 aa  615  1e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595685  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2501  Glycine hydroxymethyltransferase  72.08 
 
 
427 aa  614  9.999999999999999e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2353  serine hydroxymethyltransferase  73.57 
 
 
423 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0383526  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0424  Glycine hydroxymethyltransferase  72.73 
 
 
422 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3186  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1189  serine hydroxymethyltransferase  73.56 
 
 
432 aa  600  1e-170  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000045975 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3847  Glycine hydroxymethyltransferase  71.02 
 
 
420 aa  596  1e-169  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1663  Glycine hydroxymethyltransferase  69.07 
 
 
435 aa  596  1e-169  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0657  Glycine hydroxymethyltransferase  72.24 
 
 
452 aa  597  1e-169  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04680  serine hydroxymethyltransferase  69.83 
 
 
426 aa  594  1e-168  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0694  serine hydroxymethyltransferase  71.6 
 
 
429 aa  588  1e-167  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1115  serine hydroxymethyltransferase  71.63 
 
 
435 aa  589  1e-167  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234213  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0754  Glycine hydroxymethyltransferase  70.55 
 
 
428 aa  583  1.0000000000000001e-165  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128225  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27940  serine hydroxymethyltransferase  69.69 
 
 
430 aa  580  1e-164  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.958283  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18800  serine hydroxymethyltransferase  71.36 
 
 
412 aa  578  1e-164  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5659  Glycine hydroxymethyltransferase  73.87 
 
 
421 aa  576  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3130  Glycine hydroxymethyltransferase  70.33 
 
 
432 aa  577  1.0000000000000001e-163  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11114  serine hydroxymethyltransferase  69.21 
 
 
426 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000666035  normal  0.472146 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2989  Glycine hydroxymethyltransferase  69.34 
 
 
440 aa  567  1e-160  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4629  Glycine hydroxymethyltransferase  68.4 
 
 
430 aa  563  1.0000000000000001e-159  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.162942 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3981  Glycine hydroxymethyltransferase  72.51 
 
 
434 aa  563  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.638114 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21370  serine hydroxymethyltransferase  69.06 
 
 
422 aa  557  1e-157  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.100651  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0469  serine hydroxymethyltransferase  64.51 
 
 
474 aa  524  1e-147  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996315  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  61.23 
 
 
431 aa  508  1e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  60.14 
 
 
438 aa  506  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  59.67 
 
 
439 aa  506  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  59.91 
 
 
438 aa  503  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  59.43 
 
 
417 aa  500  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  60.76 
 
 
429 aa  499  1e-140  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 
424 aa  498  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 
415 aa  495  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  61.02 
 
 
415 aa  495  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2113  serine hydroxymethyltransferase  61.06 
 
 
424 aa  497  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332542  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  60.39 
 
 
413 aa  497  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 
416 aa  496  1e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 
415 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  59.37 
 
 
417 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  59.57 
 
 
432 aa  493  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1579  serine hydroxymethyltransferase  59.24 
 
 
431 aa  491  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  59.32 
 
 
415 aa  489  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 
413 aa  489  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  58.98 
 
 
418 aa  491  1e-137  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  58.39 
 
 
417 aa  489  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  57.45 
 
 
423 aa  491  1e-137  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  57.07 
 
 
417 aa  488  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  58.63 
 
 
437 aa  490  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  59.32 
 
 
415 aa  489  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  59.81 
 
 
415 aa  491  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  58.43 
 
 
433 aa  490  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02841  serine hydroxymethyltransferase  56.35 
 
 
416 aa  485  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  56.97 
 
 
411 aa  485  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  58.06 
 
 
427 aa  486  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  57.35 
 
 
417 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  56.84 
 
 
432 aa  487  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  57.58 
 
 
417 aa  486  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  57.35 
 
 
417 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  57.01 
 
 
434 aa  487  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  59.1 
 
 
433 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8588  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 
420 aa  485  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  57.82 
 
 
417 aa  487  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  57.58 
 
 
417 aa  486  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  56.97 
 
 
411 aa  485  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  58.55 
 
 
417 aa  487  1e-136  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  57.11 
 
 
417 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  57.11 
 
 
417 aa  482  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  56.37 
 
 
425 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  57.11 
 
 
417 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  57.92 
 
 
434 aa  484  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  58.84 
 
 
415 aa  483  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  57.62 
 
 
416 aa  481  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  57.08 
 
 
432 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2634  serine hydroxymethyltransferase  58.63 
 
 
433 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  56.37 
 
 
425 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  57.92 
 
 
434 aa  484  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  56.49 
 
 
423 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1033  serine hydroxymethyltransferase  58.01 
 
 
417 aa  482  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414818  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  56.64 
 
 
417 aa  481  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  56.67 
 
 
431 aa  479  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  59.85 
 
 
417 aa  481  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  56.01 
 
 
423 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0004  serine hydroxymethyltransferase  57.59 
 
 
416 aa  479  1e-134  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1814  serine hydroxymethyltransferase  59.57 
 
 
434 aa  481  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1438  glycine hydroxymethyltransferase  57.65 
 
 
421 aa  480  1e-134  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  56.04 
 
 
423 aa  478  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1537  serine hydroxymethyltransferase  57.24 
 
 
435 aa  479  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0106  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  57.72 
 
 
438 aa  476  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  57.51 
 
 
431 aa  478  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  57.69 
 
 
413 aa  475  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  58.06 
 
 
431 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  57.62 
 
 
427 aa  476  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  57.63 
 
 
412 aa  476  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4276  glycine hydroxymethyltransferase  58.64 
 
 
451 aa  476  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.514948  normal  0.0110039 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  57.68 
 
 
440 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  58 
 
 
417 aa  475  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0702  serine hydroxymethyltransferase  58.37 
 
 
417 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0603318  normal  0.0336909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>