More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0767 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2884  Glycine hydroxymethyltransferase  76.12 
 
 		 442 aa  639    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595685  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3596  Glycine hydroxymethyltransferase  78.19 
 
 		 447 aa  635    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10070  serine hydroxymethyltransferase  74.29 
 
 		 425 aa  640    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.9411  normal  0.116151 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0535  Glycine hydroxymethyltransferase  91.03 
 
 		 434 aa  803    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0767  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 445 aa  903    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13350  serine hydroxymethyltransferase  76.32 
 
 		 423 aa  628  1e-179  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3705  serine hydroxymethyltransferase  75.46 
 
 		 453 aa  623  1e-177  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0657  Glycine hydroxymethyltransferase  72.34 
 
 		 452 aa  618  1e-176  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2353  serine hydroxymethyltransferase  73.46 
 
 		 423 aa  616  1e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0383526  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2501  Glycine hydroxymethyltransferase  71.6 
 
 		 427 aa  617  1e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0424  Glycine hydroxymethyltransferase  72.14 
 
 		 422 aa  605  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3847  Glycine hydroxymethyltransferase  71.39 
 
 		 420 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1189  serine hydroxymethyltransferase  73.37 
 
 		 432 aa  605  9.999999999999999e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000045975 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1663  Glycine hydroxymethyltransferase  68.97 
 
 		 435 aa  598  1e-170  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1115  serine hydroxymethyltransferase  71.67 
 
 		 435 aa  595  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234213  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0754  Glycine hydroxymethyltransferase  70.81 
 
 		 428 aa  593  1e-168  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128225  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3130  Glycine hydroxymethyltransferase  70.07 
 
 		 432 aa  590  1e-167  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0694  serine hydroxymethyltransferase  69.69 
 
 		 429 aa  585  1e-166  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5659  Glycine hydroxymethyltransferase  74 
 
 		 421 aa  585  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27940  serine hydroxymethyltransferase  68.5 
 
 		 430 aa  579  1e-164  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.958283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4629  Glycine hydroxymethyltransferase  69.36 
 
 		 430 aa  576  1.0000000000000001e-163  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.162942 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18800  serine hydroxymethyltransferase  70.39 
 
 		 412 aa  577  1.0000000000000001e-163  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11114  serine hydroxymethyltransferase  68.99 
 
 		 426 aa  574  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000666035  normal  0.472146 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04680  serine hydroxymethyltransferase  68.45 
 
 		 426 aa  576  1.0000000000000001e-163  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2989  Glycine hydroxymethyltransferase  68.4 
 
 		 440 aa  573  1.0000000000000001e-162  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21370  serine hydroxymethyltransferase  69.95 
 
 		 422 aa  565  1e-160  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.100651  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3981  Glycine hydroxymethyltransferase  70.78 
 
 		 434 aa  564  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.638114 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0469  serine hydroxymethyltransferase  64.99 
 
 		 474 aa  538  9.999999999999999e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996315  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  61 
 
 		 431 aa  511  1e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  61.78 
 
 		 415 aa  510  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  57.85 
 
 		 438 aa  505  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  58.16 
 
 		 434 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  59.2 
 
 		 439 aa  506  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  57.85 
 
 		 438 aa  506  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  59.62 
 
 		 416 aa  506  9.999999999999999e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  58.99 
 
 		 418 aa  506  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  60.53 
 
 		 415 aa  502  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  59.8 
 
 		 413 aa  501  1e-141  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  58.13 
 
 		 417 aa  502  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  57.98 
 
 		 434 aa  504  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  57.98 
 
 		 434 aa  504  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  59.81 
 
 		 429 aa  502  1e-141  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  60.38 
 
 		 432 aa  499  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  58.99 
 
 		 417 aa  499  1e-140  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  59.19 
 
 		 417 aa  499  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  59.62 
 
 		 433 aa  500  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  59.57 
 
 		 417 aa  501  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  59.33 
 
 		 417 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  59.33 
 
 		 417 aa  499  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  58.37 
 
 		 417 aa  495  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  58.6 
 
 		 412 aa  497  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2113  serine hydroxymethyltransferase  60.96 
 
 		 424 aa  495  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  59.08 
 
 		 415 aa  495  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  58.85 
 
 		 417 aa  496  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  58.85 
 
 		 417 aa  498  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  58.61 
 
 		 417 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  60.39 
 
 		 413 aa  497  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  59.43 
 
 		 438 aa  498  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  58.61 
 
 		 417 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  58.17 
 
 		 417 aa  496  1e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1579  serine hydroxymethyltransferase  59 
 
 		 431 aa  497  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  58.81 
 
 		 437 aa  498  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  60.64 
 
 		 415 aa  498  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  58.94 
 
 		 415 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8588  serine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 		 420 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  58.37 
 
 		 417 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  56.97 
 
 		 411 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  58 
 
 		 427 aa  492  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  57.89 
 
 		 417 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  56.52 
 
 		 423 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6867  glycine hydroxymethyltransferase  60.29 
 
 		 431 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.592385 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  56.48 
 
 		 411 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1827  serine hydroxymethyltransferase  58.53 
 
 		 430 aa  489  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.752619  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4276  glycine hydroxymethyltransferase  60.61 
 
 		 451 aa  491  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.514948  normal  0.0110039 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  59.1 
 
 		 433 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  58.37 
 
 		 424 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1033  serine hydroxymethyltransferase  58.13 
 
 		 417 aa  490  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414818  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1537  serine hydroxymethyltransferase  58.51 
 
 		 435 aa  490  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  58.7 
 
 		 415 aa  491  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  57.82 
 
 		 431 aa  491  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  58.41 
 
 		 415 aa  488  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  56.13 
 
 		 432 aa  485  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  58.29 
 
 		 431 aa  488  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  58.19 
 
 		 416 aa  485  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  58.23 
 
 		 417 aa  487  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2634  serine hydroxymethyltransferase  58.63 
 
 		 433 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3956  serine hydroxymethyltransferase  57.24 
 
 		 434 aa  487  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  56.13 
 
 		 432 aa  487  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  59.84 
 
 		 423 aa  486  1e-136  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2110  serine hydroxymethyltransferase  58.19 
 
 		 434 aa  486  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  58.06 
 
 		 431 aa  488  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1871  Glycine hydroxymethyltransferase  58.94 
 
 		 417 aa  484  1e-136  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  56.43 
 
 		 431 aa  484  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0703  serine hydroxymethyltransferase  58.33 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0702  serine hydroxymethyltransferase  58.57 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0603318  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  58.64 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4513  serine hydroxymethyltransferase  58.33 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0695784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  57.68 
 
 		 440 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2083  serine hydroxymethyltransferase  57.42 
 
 		 418 aa  483  1e-135  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  55.77 
 
 		 423 aa  481  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>