More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1189 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3130  Glycine hydroxymethyltransferase  76.29 
 
 
432 aa  665    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27940  serine hydroxymethyltransferase  78.55 
 
 
430 aa  696    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.958283  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3981  Glycine hydroxymethyltransferase  77.12 
 
 
434 aa  637    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.638114 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0694  serine hydroxymethyltransferase  80.56 
 
 
429 aa  711    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1663  Glycine hydroxymethyltransferase  77.46 
 
 
435 aa  693    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2989  Glycine hydroxymethyltransferase  77.46 
 
 
440 aa  641    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11114  serine hydroxymethyltransferase  75.12 
 
 
426 aa  640    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000666035  normal  0.472146 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04680  serine hydroxymethyltransferase  74.94 
 
 
426 aa  667    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0754  Glycine hydroxymethyltransferase  78.83 
 
 
428 aa  673    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128225  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1189  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 
432 aa  883    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000045975 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1115  serine hydroxymethyltransferase  96.19 
 
 
435 aa  813    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234213  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2501  Glycine hydroxymethyltransferase  73.52 
 
 
427 aa  633  1e-180  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0767  serine hydroxymethyltransferase  73.37 
 
 
445 aa  622  1e-177  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0535  Glycine hydroxymethyltransferase  73.56 
 
 
434 aa  616  1e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21370  serine hydroxymethyltransferase  72.04 
 
 
422 aa  614  1e-175  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.100651  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3847  Glycine hydroxymethyltransferase  72.4 
 
 
420 aa  608  1e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3596  Glycine hydroxymethyltransferase  75.62 
 
 
447 aa  610  1e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13350  serine hydroxymethyltransferase  73.54 
 
 
423 aa  609  1e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3705  serine hydroxymethyltransferase  72.39 
 
 
453 aa  608  1e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10070  serine hydroxymethyltransferase  70.5 
 
 
425 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.9411  normal  0.116151 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2353  serine hydroxymethyltransferase  71.43 
 
 
423 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0383526  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2884  Glycine hydroxymethyltransferase  72.49 
 
 
442 aa  601  1.0000000000000001e-171  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595685  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0424  Glycine hydroxymethyltransferase  70.14 
 
 
422 aa  592  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3186  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0657  Glycine hydroxymethyltransferase  72.38 
 
 
452 aa  588  1e-167  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18800  serine hydroxymethyltransferase  70.39 
 
 
412 aa  573  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4629  Glycine hydroxymethyltransferase  67.39 
 
 
430 aa  569  1e-161  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.162942 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5659  Glycine hydroxymethyltransferase  71.81 
 
 
421 aa  551  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0469  serine hydroxymethyltransferase  64.51 
 
 
474 aa  543  1e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996315  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  57.91 
 
 
413 aa  498  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  57.77 
 
 
415 aa  488  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  57.7 
 
 
417 aa  483  1e-135  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  57.46 
 
 
415 aa  483  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  56.63 
 
 
412 aa  478  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  56.63 
 
 
412 aa  478  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  58.11 
 
 
415 aa  480  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  56.55 
 
 
415 aa  481  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  56.8 
 
 
415 aa  480  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1649  serine hydroxymethyltransferase  57.84 
 
 
434 aa  480  1e-134  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  56.07 
 
 
415 aa  476  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  55.99 
 
 
434 aa  476  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  57.28 
 
 
412 aa  477  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  57.35 
 
 
413 aa  475  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  55.56 
 
 
411 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  55.56 
 
 
411 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  55.83 
 
 
415 aa  476  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  55.56 
 
 
413 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  56.83 
 
 
412 aa  477  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  55.83 
 
 
415 aa  477  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  56.48 
 
 
417 aa  478  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  55.31 
 
 
413 aa  475  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  54.5 
 
 
412 aa  478  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  55.31 
 
 
413 aa  474  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  55.34 
 
 
413 aa  473  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  56.68 
 
 
434 aa  474  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  55.34 
 
 
414 aa  473  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  55.93 
 
 
418 aa  473  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  54.46 
 
 
416 aa  472  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  57.62 
 
 
431 aa  471  1e-132  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  53.77 
 
 
412 aa  473  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  54.59 
 
 
414 aa  473  1e-132  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  54.83 
 
 
413 aa  472  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  55.1 
 
 
413 aa  471  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  55.77 
 
 
410 aa  471  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  56.68 
 
 
434 aa  474  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  57.49 
 
 
417 aa  472  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  56.5 
 
 
431 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  55.1 
 
 
414 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  56.31 
 
 
411 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  54.37 
 
 
415 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2312  serine hydroxymethyltransferase  55.83 
 
 
412 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.297378  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  56.5 
 
 
431 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  56.73 
 
 
416 aa  470  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  56.59 
 
 
417 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  56.5 
 
 
431 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1551  serine hydroxymethyltransferase  56.49 
 
 
416 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  55.58 
 
 
413 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  55.53 
 
 
410 aa  468  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0295  serine hydroxymethyltransferase  57.52 
 
 
414 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  54.85 
 
 
414 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  54.74 
 
 
420 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2165  serine hydroxymethyltransferase  56.8 
 
 
414 aa  467  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.675395  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  57.45 
 
 
429 aa  468  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  54.55 
 
 
438 aa  467  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  54.85 
 
 
413 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  56.49 
 
 
424 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  55.31 
 
 
413 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0471  serine hydroxymethyltransferase  57.52 
 
 
414 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.937307  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1579  serine hydroxymethyltransferase  55.3 
 
 
431 aa  467  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  57.18 
 
 
432 aa  467  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  54.37 
 
 
413 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8588  serine hydroxymethyltransferase  55.9 
 
 
420 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  57 
 
 
416 aa  467  9.999999999999999e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  57.25 
 
 
417 aa  464  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  57.11 
 
 
427 aa  464  1e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0004  serine hydroxymethyltransferase  55.29 
 
 
416 aa  462  1e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6867  glycine hydroxymethyltransferase  56.6 
 
 
431 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.592385 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  56.12 
 
 
417 aa  461  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2658  serine hydroxymethyltransferase  55.18 
 
 
414 aa  462  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0261213  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2110  serine hydroxymethyltransferase  56.09 
 
 
434 aa  462  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  54.22 
 
 
423 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>