More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2501 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0754  Glycine hydroxymethyltransferase  78.59 
 
 		 428 aa  668    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128225  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21370  serine hydroxymethyltransferase  77.59 
 
 		 422 aa  644    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.100651  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2501  Glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 427 aa  865    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27940  serine hydroxymethyltransferase  76.24 
 
 		 430 aa  660    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.958283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1663  Glycine hydroxymethyltransferase  73.47 
 
 		 435 aa  639    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0694  serine hydroxymethyltransferase  76.71 
 
 		 429 aa  659    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2989  Glycine hydroxymethyltransferase  76.83 
 
 		 440 aa  628  1e-179  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11114  serine hydroxymethyltransferase  74.4 
 
 		 426 aa  618  1e-176  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000666035  normal  0.472146 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1189  serine hydroxymethyltransferase  73.52 
 
 		 432 aa  617  1e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000045975 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3130  Glycine hydroxymethyltransferase  73.6 
 
 		 432 aa  616  1e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0767  serine hydroxymethyltransferase  71.6 
 
 		 445 aa  616  1e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0535  Glycine hydroxymethyltransferase  72.08 
 
 		 434 aa  614  9.999999999999999e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04680  serine hydroxymethyltransferase  71.46 
 
 		 426 aa  613  9.999999999999999e-175  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1115  serine hydroxymethyltransferase  73.21 
 
 		 435 aa  610  1e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234213  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2884  Glycine hydroxymethyltransferase  72.71 
 
 		 442 aa  605  9.999999999999999e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595685  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13350  serine hydroxymethyltransferase  73.51 
 
 		 423 aa  600  1e-170  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10070  serine hydroxymethyltransferase  70.45 
 
 		 425 aa  599  1e-170  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.9411  normal  0.116151 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3981  Glycine hydroxymethyltransferase  76.01 
 
 		 434 aa  594  1e-169  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.638114 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0424  Glycine hydroxymethyltransferase  72.34 
 
 		 422 aa  593  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3847  Glycine hydroxymethyltransferase  70.64 
 
 		 420 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2353  serine hydroxymethyltransferase  71.36 
 
 		 423 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0383526  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0657  Glycine hydroxymethyltransferase  70.45 
 
 		 452 aa  578  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3596  Glycine hydroxymethyltransferase  71.71 
 
 		 447 aa  577  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5659  Glycine hydroxymethyltransferase  73.49 
 
 		 421 aa  568  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3705  serine hydroxymethyltransferase  69.21 
 
 		 453 aa  571  1e-161  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18800  serine hydroxymethyltransferase  70.12 
 
 		 412 aa  554  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0469  serine hydroxymethyltransferase  67.8 
 
 		 474 aa  548  1e-155  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996315  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4629  Glycine hydroxymethyltransferase  65.8 
 
 		 430 aa  546  1e-154  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.162942 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  59.86 
 
 		 418 aa  500  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  56.74 
 
 		 424 aa  497  1e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  59.39 
 
 		 434 aa  495  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  59.39 
 
 		 434 aa  495  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  58.08 
 
 		 433 aa  493  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  58.19 
 
 		 427 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2305  serine hydroxymethyltransferase  59.76 
 
 		 434 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  60.39 
 
 		 415 aa  491  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  57.85 
 
 		 439 aa  492  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  58.19 
 
 		 427 aa  491  1e-137  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  58.45 
 
 		 434 aa  490  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  60.14 
 
 		 432 aa  490  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  57.71 
 
 		 438 aa  488  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  56.53 
 
 		 422 aa  487  1e-136  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  57.71 
 
 		 438 aa  487  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  56.15 
 
 		 437 aa  485  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  58.35 
 
 		 413 aa  487  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  57.14 
 
 		 415 aa  483  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  58.25 
 
 		 431 aa  484  1e-135  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  58.35 
 
 		 415 aa  483  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2110  serine hydroxymethyltransferase  58.41 
 
 		 434 aa  483  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  57.98 
 
 		 440 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1579  serine hydroxymethyltransferase  57.98 
 
 		 431 aa  483  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1537  serine hydroxymethyltransferase  57.65 
 
 		 435 aa  481  1e-135  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  55.61 
 
 		 432 aa  482  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  57.87 
 
 		 415 aa  479  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  57.49 
 
 		 415 aa  480  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3004  serine hydroxymethyltransferase  58.69 
 
 		 432 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21133  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  56.73 
 
 		 417 aa  478  1e-134  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  57.35 
 
 		 429 aa  481  1e-134  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1142  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 		 434 aa  479  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  57.14 
 
 		 415 aa  479  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2634  serine hydroxymethyltransferase  58.45 
 
 		 433 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  58.45 
 
 		 433 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3956  serine hydroxymethyltransferase  58.41 
 
 		 434 aa  479  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  56.94 
 
 		 417 aa  480  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  56.7 
 
 		 417 aa  478  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1610  serine hydroxymethyltransferase  54.99 
 
 		 429 aa  478  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  56.7 
 
 		 417 aa  478  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  56.67 
 
 		 424 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  56.46 
 
 		 417 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  55.94 
 
 		 431 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  56.46 
 
 		 417 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  58.41 
 
 		 427 aa  478  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1827  serine hydroxymethyltransferase  56.81 
 
 		 430 aa  475  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.752619  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  56.46 
 
 		 417 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6867  glycine hydroxymethyltransferase  56.88 
 
 		 431 aa  475  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.592385 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  57.07 
 
 		 416 aa  475  1e-133  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  57.21 
 
 		 417 aa  478  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  56.66 
 
 		 410 aa  475  1e-133  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  57.07 
 
 		 417 aa  475  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  56.94 
 
 		 415 aa  477  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  56.12 
 
 		 417 aa  478  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  55.56 
 
 		 427 aa  475  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  55.14 
 
 		 432 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  58.35 
 
 		 411 aa  475  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0169  serine hydroxymethyltransferase  56.9 
 
 		 422 aa  476  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0055  serine hydroxymethyltransferase  56.34 
 
 		 424 aa  471  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  58.6 
 
 		 412 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1438  glycine hydroxymethyltransferase  56.5 
 
 		 421 aa  474  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  56.22 
 
 		 417 aa  474  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  55.34 
 
 		 412 aa  474  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3404  serine hydroxymethyltransferase  58.88 
 
 		 433 aa  472  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  55.14 
 
 		 431 aa  473  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  55.24 
 
 		 416 aa  474  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  56.22 
 
 		 417 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2874  serine hydroxymethyltransferase  57.38 
 
 		 414 aa  471  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  55.85 
 
 		 417 aa  471  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  55.74 
 
 		 417 aa  471  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  56.42 
 
 		 410 aa  473  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  53.07 
 
 		 423 aa  472  1e-132  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5297  serine hydroxymethyltransferase  58.88 
 
 		 433 aa  472  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>