More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3130 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1663  Glycine hydroxymethyltransferase  88.63 
 
 		 435 aa  797    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1189  serine hydroxymethyltransferase  76.78 
 
 		 432 aa  662    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000045975 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04680  serine hydroxymethyltransferase  74.88 
 
 		 426 aa  653    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0754  Glycine hydroxymethyltransferase  76.43 
 
 		 428 aa  666    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128225  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27940  serine hydroxymethyltransferase  73.54 
 
 		 430 aa  655    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.958283  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3130  Glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 432 aa  875    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11114  serine hydroxymethyltransferase  78.12 
 
 		 426 aa  677    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000666035  normal  0.472146 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0694  serine hydroxymethyltransferase  77.07 
 
 		 429 aa  667    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1115  serine hydroxymethyltransferase  77.46 
 
 		 435 aa  662    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234213  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2501  Glycine hydroxymethyltransferase  73.6 
 
 		 427 aa  633  1e-180  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3981  Glycine hydroxymethyltransferase  77.03 
 
 		 434 aa  628  1e-179  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.638114 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2989  Glycine hydroxymethyltransferase  75 
 
 		 440 aa  620  1e-176  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13350  serine hydroxymethyltransferase  75.12 
 
 		 423 aa  619  1e-176  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3847  Glycine hydroxymethyltransferase  75.42 
 
 		 420 aa  617  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2353  serine hydroxymethyltransferase  73.05 
 
 		 423 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0383526  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0767  serine hydroxymethyltransferase  70.07 
 
 		 445 aa  606  9.999999999999999e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21370  serine hydroxymethyltransferase  72.73 
 
 		 422 aa  600  1e-170  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.100651  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2884  Glycine hydroxymethyltransferase  71.53 
 
 		 442 aa  594  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595685  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0535  Glycine hydroxymethyltransferase  70.33 
 
 		 434 aa  594  1e-168  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0424  Glycine hydroxymethyltransferase  71.63 
 
 		 422 aa  588  1e-167  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3705  serine hydroxymethyltransferase  69.61 
 
 		 453 aa  587  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3596  Glycine hydroxymethyltransferase  72.06 
 
 		 447 aa  587  1e-166  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10070  serine hydroxymethyltransferase  69.3 
 
 		 425 aa  578  1e-164  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.9411  normal  0.116151 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18800  serine hydroxymethyltransferase  72.22 
 
 		 412 aa  572  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0657  Glycine hydroxymethyltransferase  70.62 
 
 		 452 aa  568  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4629  Glycine hydroxymethyltransferase  66.2 
 
 		 430 aa  566  1e-160  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.162942 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5659  Glycine hydroxymethyltransferase  72.77 
 
 		 421 aa  553  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0469  serine hydroxymethyltransferase  65.94 
 
 		 474 aa  543  1e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996315  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  60.68 
 
 		 411 aa  497  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 		 412 aa  495  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  57.72 
 
 		 420 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  57.49 
 
 		 413 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  56.14 
 
 		 412 aa  488  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  59.66 
 
 		 415 aa  490  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  59.62 
 
 		 431 aa  486  1e-136  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  58.5 
 
 		 415 aa  485  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  58.64 
 
 		 417 aa  488  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  57.48 
 
 		 416 aa  485  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  58.5 
 
 		 415 aa  485  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  57.52 
 
 		 417 aa  487  1e-136  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  56.01 
 
 		 412 aa  485  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  58.01 
 
 		 415 aa  486  1e-136  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  58.01 
 
 		 415 aa  482  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  57.35 
 
 		 413 aa  483  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  57.59 
 
 		 413 aa  484  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  57.59 
 
 		 413 aa  484  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  57.35 
 
 		 414 aa  483  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  57.04 
 
 		 415 aa  482  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  57.59 
 
 		 414 aa  484  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  57.79 
 
 		 413 aa  484  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  58.25 
 
 		 415 aa  483  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  55.93 
 
 		 413 aa  482  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  58.23 
 
 		 418 aa  484  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  57.11 
 
 		 413 aa  479  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  57.11 
 
 		 414 aa  479  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  57.77 
 
 		 415 aa  481  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  57.11 
 
 		 413 aa  481  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  57.11 
 
 		 413 aa  480  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  56.87 
 
 		 434 aa  478  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3004  serine hydroxymethyltransferase  57.88 
 
 		 432 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21133  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  56.71 
 
 		 434 aa  478  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  56.87 
 
 		 413 aa  478  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2113  serine hydroxymethyltransferase  58.25 
 
 		 424 aa  476  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  55.64 
 
 		 423 aa  475  1e-133  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  57.41 
 
 		 440 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  56.71 
 
 		 434 aa  478  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  58.12 
 
 		 433 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  58.44 
 
 		 415 aa  476  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02841  serine hydroxymethyltransferase  54.61 
 
 		 416 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  58.31 
 
 		 417 aa  474  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  54.99 
 
 		 411 aa  471  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  57.51 
 
 		 429 aa  473  1e-132  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2634  serine hydroxymethyltransferase  57.41 
 
 		 433 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  56.8 
 
 		 413 aa  472  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1649  serine hydroxymethyltransferase  58.09 
 
 		 434 aa  471  1e-132  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  55.53 
 
 		 410 aa  473  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  55.35 
 
 		 431 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  55.87 
 
 		 433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4649  serine hydroxymethyltransferase  58.64 
 
 		 434 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.863224  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  54.26 
 
 		 411 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3404  serine hydroxymethyltransferase  61.38 
 
 		 433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5297  serine hydroxymethyltransferase  61.38 
 
 		 433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  59.17 
 
 		 414 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  55.29 
 
 		 410 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  56.17 
 
 		 412 aa  468  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  55.79 
 
 		 439 aa  466  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1871  Glycine hydroxymethyltransferase  56.94 
 
 		 417 aa  466  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  56.26 
 
 		 438 aa  468  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3104  serine hydroxymethyltransferase  57.75 
 
 		 433 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.425727  decreased coverage  0.00549191 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  56.26 
 
 		 438 aa  467  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  54.57 
 
 		 423 aa  467  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  56.17 
 
 		 412 aa  468  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2305  serine hydroxymethyltransferase  57.18 
 
 		 434 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1814  serine hydroxymethyltransferase  57.65 
 
 		 434 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2110  serine hydroxymethyltransferase  55.94 
 
 		 434 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  54.81 
 
 		 423 aa  464  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3956  serine hydroxymethyltransferase  56.34 
 
 		 434 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  55.45 
 
 		 424 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  55.56 
 
 		 427 aa  462  1e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1438  glycine hydroxymethyltransferase  55.85 
 
 		 421 aa  461  1e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>