More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3313 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  84.63 
 
 		 413 aa  729    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 411 aa  845    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  84.63 
 
 		 413 aa  728    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  84.15 
 
 		 414 aa  727    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  84.15 
 
 		 414 aa  726    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  84.39 
 
 		 414 aa  728    Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  84.39 
 
 		 413 aa  727    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  88.81 
 
 		 412 aa  760    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  84.15 
 
 		 413 aa  725    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  84.39 
 
 		 413 aa  728    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  85.12 
 
 		 413 aa  732    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  83.41 
 
 		 413 aa  719    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  83.66 
 
 		 413 aa  721    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  73.3 
 
 		 412 aa  624  1e-178  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  73.3 
 
 		 412 aa  624  1e-178  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  73.96 
 
 		 418 aa  619  1e-176  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  73.98 
 
 		 417 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  71.78 
 
 		 412 aa  610  1e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  71.29 
 
 		 412 aa  607  9.999999999999999e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  71.95 
 
 		 415 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  72.1 
 
 		 413 aa  593  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  70.87 
 
 		 410 aa  593  1e-168  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  70.87 
 
 		 410 aa  594  1e-168  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  69.83 
 
 		 414 aa  590  1e-167  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  69.78 
 
 		 420 aa  587  1e-166  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  67.4 
 
 		 412 aa  582  1.0000000000000001e-165  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  69.27 
 
 		 415 aa  580  1e-164  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  69.02 
 
 		 415 aa  578  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  68.81 
 
 		 416 aa  578  1e-164  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  68.54 
 
 		 415 aa  579  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  69.27 
 
 		 415 aa  580  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  68.05 
 
 		 415 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  67.8 
 
 		 415 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  66.42 
 
 		 415 aa  571  1.0000000000000001e-162  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  67.4 
 
 		 415 aa  566  1e-160  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  68.38 
 
 		 412 aa  566  1e-160  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  69.04 
 
 		 413 aa  567  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  68.49 
 
 		 412 aa  566  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  64.63 
 
 		 422 aa  561  1.0000000000000001e-159  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  66.58 
 
 		 413 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  65.85 
 
 		 416 aa  558  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  67.07 
 
 		 413 aa  560  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  65.2 
 
 		 431 aa  556  1e-157  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  64.22 
 
 		 429 aa  552  1e-156  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  64.63 
 
 		 420 aa  551  1e-156  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  62.2 
 
 		 414 aa  548  1e-155  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  64.72 
 
 		 427 aa  550  1e-155  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  65.12 
 
 		 424 aa  548  1e-155  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1617  serine hydroxymethyltransferase  66.59 
 
 		 414 aa  548  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  65.3 
 
 		 422 aa  547  1e-154  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  63.73 
 
 		 417 aa  546  1e-154  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  61.46 
 
 		 414 aa  545  1e-154  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  66.67 
 
 		 417 aa  545  1e-154  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  64.23 
 
 		 438 aa  542  1e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  63.75 
 
 		 439 aa  543  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3274  serine hydroxymethyltransferase  67.41 
 
 		 412 aa  542  1e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000462006  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  64.23 
 
 		 438 aa  544  1e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  64.39 
 
 		 411 aa  540  9.999999999999999e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  61.8 
 
 		 423 aa  538  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  62.04 
 
 		 423 aa  537  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  62.38 
 
 		 419 aa  537  1e-151  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  62.65 
 
 		 437 aa  535  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  64.83 
 
 		 427 aa  535  1e-151  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  64.83 
 
 		 427 aa  535  1e-151  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  59.61 
 
 		 412 aa  533  1e-150  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  64.39 
 
 		 412 aa  532  1e-150  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  61.31 
 
 		 423 aa  532  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  62.65 
 
 		 415 aa  532  1e-150  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0127  Glycine hydroxymethyltransferase  62.33 
 
 		 435 aa  531  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  64.39 
 
 		 412 aa  533  1e-150  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  62.41 
 
 		 431 aa  531  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2305  serine hydroxymethyltransferase  63.66 
 
 		 434 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  62.2 
 
 		 425 aa  534  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  62.87 
 
 		 415 aa  528  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1942  serine hydroxymethyltransferase  62.87 
 
 		 415 aa  528  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1389  Glycine hydroxymethyltransferase  62.03 
 
 		 427 aa  528  1e-149  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000692081  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  61.31 
 
 		 425 aa  529  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0834  serine hydroxymethyltransferase  62.87 
 
 		 415 aa  528  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2075  serine hydroxymethyltransferase  62.87 
 
 		 415 aa  528  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3250  serine hydroxymethyltransferase  62.87 
 
 		 415 aa  528  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  60.83 
 
 		 423 aa  529  1e-149  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1155  serine hydroxymethyltransferase  60.09 
 
 		 436 aa  528  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1379  serine hydroxymethyltransferase  63.12 
 
 		 415 aa  528  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  64.48 
 
 		 440 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  62.32 
 
 		 423 aa  530  1e-149  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3196  serine hydroxymethyltransferase  62.87 
 
 		 415 aa  528  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1649  serine hydroxymethyltransferase  64.52 
 
 		 434 aa  529  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  61.31 
 
 		 425 aa  529  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  63.11 
 
 		 413 aa  528  1e-149  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0851  glycine hydroxymethyltransferase  63.75 
 
 		 419 aa  526  1e-148  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0407045  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0915  Glycine hydroxymethyltransferase  62.62 
 
 		 413 aa  526  1e-148  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  63.48 
 
 		 417 aa  525  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2083  serine hydroxymethyltransferase  61.39 
 
 		 418 aa  525  1e-148  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  61.63 
 
 		 411 aa  527  1e-148  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1727  serine hydroxymethyltransferase  62.89 
 
 		 433 aa  525  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130178 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1035  Glycine hydroxymethyltransferase  62.04 
 
 		 418 aa  526  1e-148  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314303 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  62.13 
 
 		 415 aa  526  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1678  serine hydroxymethyltransferase  63.75 
 
 		 426 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2581  serine hydroxymethyltransferase  63.61 
 
 		 415 aa  524  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3234  serine hydroxymethyltransferase  62.62 
 
 		 415 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>