More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2091 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  76.68 
 
 
423 aa  686    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  75.92 
 
 
411 aa  664    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02841  serine hydroxymethyltransferase  76.46 
 
 
416 aa  676    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  75.68 
 
 
411 aa  663    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  76.92 
 
 
423 aa  683    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 
429 aa  882    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  90.72 
 
 
431 aa  803    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  76.2 
 
 
423 aa  680    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  78.43 
 
 
427 aa  665    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  76.92 
 
 
423 aa  687    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  83.89 
 
 
424 aa  727    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  72.4 
 
 
425 aa  630  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  72.4 
 
 
425 aa  630  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  70.28 
 
 
425 aa  625  1e-178  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1678  serine hydroxymethyltransferase  75.06 
 
 
426 aa  622  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4802  serine hydroxymethyltransferase  74.51 
 
 
427 aa  618  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  71.08 
 
 
427 aa  615  1e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2076  serine hydroxymethyltransferase  70.74 
 
 
427 aa  599  1e-170  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.745833  hitchhiker  0.000706319 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  64.22 
 
 
411 aa  552  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  63.81 
 
 
412 aa  549  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  63.81 
 
 
412 aa  549  1e-155  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  63.33 
 
 
415 aa  541  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  62.71 
 
 
413 aa  541  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  62.25 
 
 
412 aa  540  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  64.3 
 
 
413 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  62.32 
 
 
417 aa  537  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  62.5 
 
 
412 aa  537  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  61.74 
 
 
415 aa  536  1e-151  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  61.22 
 
 
413 aa  536  1e-151  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  62.93 
 
 
415 aa  536  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2305  serine hydroxymethyltransferase  64.08 
 
 
434 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  62.44 
 
 
412 aa  536  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  62.44 
 
 
420 aa  535  1e-151  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  60.73 
 
 
413 aa  531  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  62.35 
 
 
412 aa  533  1e-150  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  60.98 
 
 
413 aa  534  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  60.98 
 
 
414 aa  533  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  60.98 
 
 
414 aa  534  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  62.1 
 
 
415 aa  533  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  60.98 
 
 
413 aa  533  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  64.25 
 
 
427 aa  534  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  63.08 
 
 
416 aa  531  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  60.73 
 
 
413 aa  531  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0373  serine hydroxymethyltransferase  65.04 
 
 
419 aa  534  1e-150  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.238829  normal  0.155765 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  62.68 
 
 
416 aa  530  1e-149  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  60.73 
 
 
414 aa  529  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  60.73 
 
 
413 aa  529  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  62.5 
 
 
415 aa  529  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  61.22 
 
 
415 aa  528  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  60.29 
 
 
413 aa  528  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  61.52 
 
 
410 aa  529  1e-149  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 
413 aa  526  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2581  serine hydroxymethyltransferase  62.25 
 
 
415 aa  525  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0765  serine hydroxymethyltransferase  62.25 
 
 
415 aa  525  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186767  normal  0.156833 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  61.46 
 
 
422 aa  527  1e-148  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  61.54 
 
 
433 aa  525  1e-148  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  61.27 
 
 
410 aa  525  1e-148  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 
413 aa  527  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0834  serine hydroxymethyltransferase  62.01 
 
 
415 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3234  serine hydroxymethyltransferase  62.01 
 
 
415 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  61.22 
 
 
413 aa  523  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  61.79 
 
 
438 aa  523  1e-147  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2075  serine hydroxymethyltransferase  62.01 
 
 
415 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1942  serine hydroxymethyltransferase  62.01 
 
 
415 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1344  serine hydroxymethyltransferase  62.29 
 
 
417 aa  521  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538197  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3250  serine hydroxymethyltransferase  62.01 
 
 
415 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0775  serine hydroxymethyltransferase  62.5 
 
 
415 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0739852  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  61.46 
 
 
415 aa  523  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1379  serine hydroxymethyltransferase  62.01 
 
 
415 aa  523  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  62.14 
 
 
439 aa  524  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2762  serine hydroxymethyltransferase  60.77 
 
 
417 aa  521  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2113  serine hydroxymethyltransferase  62.8 
 
 
424 aa  522  1e-147  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332542  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  61.46 
 
 
415 aa  522  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  61.86 
 
 
417 aa  521  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0323  serine hydroxymethyltransferase  62.5 
 
 
415 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  61.56 
 
 
438 aa  521  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3196  serine hydroxymethyltransferase  62.01 
 
 
415 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  62.01 
 
 
415 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  62.84 
 
 
417 aa  523  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0806  serine hydroxymethyltransferase  62.5 
 
 
415 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 
434 aa  519  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1871  Glycine hydroxymethyltransferase  62.1 
 
 
417 aa  520  1e-146  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  60.98 
 
 
415 aa  519  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  62.04 
 
 
417 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  61.11 
 
 
431 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  60.38 
 
 
434 aa  519  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2754  serine hydroxymethyltransferase  61.76 
 
 
415 aa  518  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  60.29 
 
 
417 aa  519  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  60.42 
 
 
431 aa  520  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  60.38 
 
 
434 aa  519  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 
415 aa  520  1e-146  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  61.8 
 
 
417 aa  521  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3956  serine hydroxymethyltransferase  60.67 
 
 
434 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3895  serine hydroxymethyltransferase  61.76 
 
 
415 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  60.76 
 
 
432 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  60.85 
 
 
432 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  61.54 
 
 
437 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0683  serine hydroxymethyltransferase  61.27 
 
 
431 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0700  serine hydroxymethyltransferase  61.52 
 
 
431 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0504784  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71460  serine hydroxymethyltransferase  61.98 
 
 
417 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0197843  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>