More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2110 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  74.48 
 
 
439 aa  673    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1610  serine hydroxymethyltransferase  72.81 
 
 
429 aa  645    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  74.48 
 
 
438 aa  676    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3104  serine hydroxymethyltransferase  81.84 
 
 
433 aa  704    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.425727  decreased coverage  0.00549191 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  83.56 
 
 
433 aa  750    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  73.35 
 
 
432 aa  646    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  74.25 
 
 
438 aa  674    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  73.82 
 
 
432 aa  650    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2110  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 
434 aa  887    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3004  serine hydroxymethyltransferase  74.31 
 
 
432 aa  660    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21133  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  71.84 
 
 
438 aa  640    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5297  serine hydroxymethyltransferase  81.52 
 
 
433 aa  681    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  77.54 
 
 
434 aa  704    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  77.91 
 
 
434 aa  705    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3956  serine hydroxymethyltransferase  81.04 
 
 
434 aa  717    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  72.55 
 
 
427 aa  637    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2634  serine hydroxymethyltransferase  74.7 
 
 
433 aa  658    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  74.35 
 
 
440 aa  655    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  73.78 
 
 
433 aa  660    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1814  serine hydroxymethyltransferase  73.76 
 
 
434 aa  642    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  72.92 
 
 
437 aa  669    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3404  serine hydroxymethyltransferase  81.52 
 
 
433 aa  681    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  77.91 
 
 
434 aa  705    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  74.94 
 
 
431 aa  660    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4276  glycine hydroxymethyltransferase  74.58 
 
 
451 aa  633  1e-180  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.514948  normal  0.0110039 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1727  serine hydroxymethyltransferase  72.81 
 
 
433 aa  632  1e-180  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.130178 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2240  serine hydroxymethyltransferase  70.17 
 
 
436 aa  629  1e-179  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.435156  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4649  serine hydroxymethyltransferase  72.07 
 
 
434 aa  620  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.863224  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  68.65 
 
 
431 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  68.41 
 
 
431 aa  608  1e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  68.65 
 
 
431 aa  608  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0821  serine hydroxymethyltransferase  67.93 
 
 
431 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3047  serine hydroxymethyltransferase  71.73 
 
 
434 aa  603  1.0000000000000001e-171  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.302237  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1579  serine hydroxymethyltransferase  67.78 
 
 
431 aa  599  1e-170  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0629  serine hydroxymethyltransferase  67.93 
 
 
432 aa  589  1e-167  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2991  serine hydroxymethyltransferase  68.17 
 
 
439 aa  587  1e-166  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.406931  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1827  serine hydroxymethyltransferase  66.59 
 
 
430 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.752619  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2123  serine hydroxymethyltransferase  68.65 
 
 
432 aa  578  1e-164  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.607283  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1537  serine hydroxymethyltransferase  66.59 
 
 
435 aa  577  1.0000000000000001e-163  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0106  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  65.56 
 
 
432 aa  569  1e-161  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1131  serine hydroxymethyltransferase  67.7 
 
 
438 aa  566  1e-160  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.584691  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0055  serine hydroxymethyltransferase  64.93 
 
 
424 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3546  serine hydroxymethyltransferase  64.69 
 
 
424 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2113  serine hydroxymethyltransferase  66.83 
 
 
424 aa  558  1e-158  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332542  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4822  serine hydroxymethyltransferase  64.22 
 
 
424 aa  558  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1585  serine hydroxymethyltransferase  64.13 
 
 
424 aa  560  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592814  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3303  serine hydroxymethyltransferase  63.74 
 
 
424 aa  558  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282627  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0571  serine hydroxymethyltransferase  64.93 
 
 
424 aa  554  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5200  serine hydroxymethyltransferase  64.93 
 
 
424 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4497  serine hydroxymethyltransferase  64.93 
 
 
424 aa  557  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5085  serine hydroxymethyltransferase  64.93 
 
 
424 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.750126 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6867  glycine hydroxymethyltransferase  64.22 
 
 
431 aa  552  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.592385 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8588  serine hydroxymethyltransferase  65.12 
 
 
420 aa  554  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5022  serine hydroxymethyltransferase  64.45 
 
 
424 aa  554  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3283  serine hydroxymethyltransferase  64.93 
 
 
424 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5063  serine hydroxymethyltransferase  63.66 
 
 
424 aa  554  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0644659  normal  0.0156096 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3844  serine hydroxymethyltransferase  64.05 
 
 
431 aa  549  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.988817  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0870  glycine hydroxymethyltransferase  66.34 
 
 
424 aa  551  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0828  serine hydroxymethyltransferase  63.98 
 
 
424 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2106  serine hydroxymethyltransferase  63.98 
 
 
424 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1868  serine hydroxymethyltransferase  63.51 
 
 
424 aa  548  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0740  serine hydroxymethyltransferase  63.98 
 
 
424 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0710  serine hydroxymethyltransferase  63.74 
 
 
424 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1979  serine hydroxymethyltransferase  63.74 
 
 
424 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00954911  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0471  serine hydroxymethyltransferase  63.74 
 
 
424 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1006  serine hydroxymethyltransferase  63.74 
 
 
424 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2283  glycine hydroxymethyltransferase  65.64 
 
 
425 aa  544  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90339 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0169  serine hydroxymethyltransferase  62.5 
 
 
422 aa  543  1e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05971  serine hydroxymethyltransferase  63.33 
 
 
431 aa  536  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000232  serine hydroxymethyltransferase  64.52 
 
 
431 aa  537  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2305  serine hydroxymethyltransferase  64.51 
 
 
434 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0791  serine hydroxymethyltransferase  63.98 
 
 
435 aa  538  1e-151  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0375384  normal  0.0421873 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0952  serine hydroxymethyltransferase  64.29 
 
 
435 aa  530  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1142  serine hydroxymethyltransferase  65.92 
 
 
434 aa  529  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1035  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 
425 aa  528  1e-148  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0692  serine hydroxymethyltransferase  59.22 
 
 
421 aa  521  1e-147  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.414357  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2938  serine hydroxymethyltransferase  62.14 
 
 
421 aa  518  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  62.32 
 
 
415 aa  520  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3135  serine hydroxymethyltransferase  64.75 
 
 
434 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  61.35 
 
 
415 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  58.47 
 
 
412 aa  515  1.0000000000000001e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5759  glycine hydroxymethyltransferase  60.62 
 
 
431 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2927  serine hydroxymethyltransferase  61.59 
 
 
415 aa  512  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  59.66 
 
 
418 aa  513  1e-144  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1617  serine hydroxymethyltransferase  60.73 
 
 
414 aa  509  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  60.87 
 
 
415 aa  510  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0307  serine hydroxymethyltransferase  61.35 
 
 
414 aa  510  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.209874  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  59.42 
 
 
413 aa  509  1e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  60.39 
 
 
413 aa  509  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  60.96 
 
 
419 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1942  serine hydroxymethyltransferase  60.87 
 
 
415 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 
427 aa  504  9.999999999999999e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0834  serine hydroxymethyltransferase  60.87 
 
 
415 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  60.39 
 
 
415 aa  504  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  58.45 
 
 
412 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1379  serine hydroxymethyltransferase  60.63 
 
 
415 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0218  serine hydroxymethyltransferase  57.04 
 
 
419 aa  507  9.999999999999999e-143  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0240245  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3196  serine hydroxymethyltransferase  60.87 
 
 
415 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3234  serine hydroxymethyltransferase  60.87 
 
 
415 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 
427 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>