More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2658 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0700  serine hydroxymethyltransferase  77.29 
 
 		 431 aa  665    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0504784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0678  serine hydroxymethyltransferase  80.24 
 
 		 415 aa  700    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.478588 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4246  glycine hydroxymethyltransferase  86.23 
 
 		 438 aa  754    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.499232  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0729  serine hydroxymethyltransferase  80.68 
 
 		 415 aa  700    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0834  serine hydroxymethyltransferase  77.05 
 
 		 415 aa  674    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2927  serine hydroxymethyltransferase  78.11 
 
 		 415 aa  659    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1942  serine hydroxymethyltransferase  77.05 
 
 		 415 aa  674    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3234  serine hydroxymethyltransferase  77.05 
 
 		 415 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2075  serine hydroxymethyltransferase  77.05 
 
 		 415 aa  674    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0603  serine hydroxymethyltransferase  75.18 
 
 		 416 aa  655    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  77.05 
 
 		 415 aa  674    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0790  serine hydroxymethyltransferase  80 
 
 		 415 aa  710    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2907  serine hydroxymethyltransferase  92.51 
 
 		 414 aa  803    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291862  normal  0.0486853 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2165  serine hydroxymethyltransferase  77.54 
 
 		 414 aa  683    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.675395  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3250  serine hydroxymethyltransferase  77.05 
 
 		 415 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3363  serine hydroxymethyltransferase  76.14 
 
 		 415 aa  660    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3895  serine hydroxymethyltransferase  77.78 
 
 		 415 aa  663    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2754  serine hydroxymethyltransferase  76.63 
 
 		 415 aa  662    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3196  serine hydroxymethyltransferase  77.05 
 
 		 415 aa  674    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2992  serine hydroxymethyltransferase  83.54 
 
 		 414 aa  730    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.802435  normal  0.346056 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1379  serine hydroxymethyltransferase  76.81 
 
 		 415 aa  673    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1660  serine hydroxymethyltransferase  84.02 
 
 		 414 aa  737    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.445565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0279  serine hydroxymethyltransferase  78.5 
 
 		 414 aa  673    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.681758  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2658  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 414 aa  853    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0261213  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2044  serine hydroxymethyltransferase  84.02 
 
 		 414 aa  737    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110649  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2874  serine hydroxymethyltransferase  92.98 
 
 		 414 aa  810    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  77.54 
 
 		 415 aa  677    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4955  glycine hydroxymethyltransferase  79.95 
 
 		 415 aa  693    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2680  serine hydroxymethyltransferase  81.2 
 
 		 508 aa  714    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0323  serine hydroxymethyltransferase  77.78 
 
 		 415 aa  663    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0775  serine hydroxymethyltransferase  77.54 
 
 		 415 aa  662    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0739852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0765  serine hydroxymethyltransferase  77.54 
 
 		 415 aa  665    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186767  normal  0.156833 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2581  serine hydroxymethyltransferase  77.29 
 
 		 415 aa  665    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2938  serine hydroxymethyltransferase  78.31 
 
 		 421 aa  666    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1551  serine hydroxymethyltransferase  76.14 
 
 		 416 aa  657    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0722  serine hydroxymethyltransferase  80.48 
 
 		 436 aa  699    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59476  normal  0.142236 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0683  serine hydroxymethyltransferase  76.81 
 
 		 431 aa  663    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0307  serine hydroxymethyltransferase  79.18 
 
 		 414 aa  696    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.209874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5200  serine hydroxymethyltransferase  76.09 
 
 		 415 aa  658    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2449  serine hydroxymethyltransferase  76.57 
 
 		 415 aa  655    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3100  serine hydroxymethyltransferase  90.8 
 
 		 414 aa  785    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.208714  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0806  serine hydroxymethyltransferase  77.78 
 
 		 415 aa  663    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0615  Glycine hydroxymethyltransferase  75.85 
 
 		 415 aa  664    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1917  serine hydroxymethyltransferase  72.46 
 
 		 430 aa  625  1e-178  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.584505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0004  serine hydroxymethyltransferase  68.06 
 
 		 416 aa  577  1e-164  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5930  glycine hydroxymethyltransferase  66.91 
 
 		 438 aa  578  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.0770182 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  65.23 
 
 		 417 aa  575  1.0000000000000001e-163  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04405  serine hydroxymethyltransferase  64.75 
 
 		 417 aa  572  1.0000000000000001e-162  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  64.18 
 
 		 417 aa  565  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1912  serine hydroxymethyltransferase  63.46 
 
 		 430 aa  560  1e-158  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.637321  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3262  serine hydroxymethyltransferase  66.02 
 
 		 454 aa  560  1e-158  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  62.83 
 
 		 417 aa  556  1e-157  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  63.07 
 
 		 417 aa  555  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  62.98 
 
 		 416 aa  555  1e-157  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  63.07 
 
 		 417 aa  556  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  63.46 
 
 		 417 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  62.59 
 
 		 417 aa  554  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  63.07 
 
 		 417 aa  555  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  63.07 
 
 		 417 aa  555  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  63.07 
 
 		 417 aa  555  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  63.46 
 
 		 417 aa  557  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  62.59 
 
 		 417 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  62.59 
 
 		 417 aa  554  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1851  serine hydroxymethyltransferase  62.98 
 
 		 417 aa  554  1e-156  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0703  serine hydroxymethyltransferase  62.5 
 
 		 417 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  62.35 
 
 		 417 aa  552  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1033  serine hydroxymethyltransferase  62.35 
 
 		 417 aa  551  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414818  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0671  serine hydroxymethyltransferase  62.26 
 
 		 417 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.557812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  63.94 
 
 		 417 aa  551  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4632  serine hydroxymethyltransferase  62.26 
 
 		 417 aa  548  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10278  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4270  serine hydroxymethyltransferase  62.74 
 
 		 417 aa  549  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4877  serine hydroxymethyltransferase  62.5 
 
 		 417 aa  550  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.402887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4513  serine hydroxymethyltransferase  62.02 
 
 		 417 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0695784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1871  Glycine hydroxymethyltransferase  63.46 
 
 		 417 aa  549  1e-155  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0702  serine hydroxymethyltransferase  62.26 
 
 		 417 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0603318  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1887  Glycine hydroxymethyltransferase  63.7 
 
 		 419 aa  548  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  62.02 
 
 		 417 aa  542  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  61.3 
 
 		 417 aa  544  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  62.35 
 
 		 417 aa  544  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1231  serine hydroxymethyltransferase  61.54 
 
 		 417 aa  538  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3044  serine hydroxymethyltransferase  61.54 
 
 		 417 aa  538  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.196975  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  63.07 
 
 		 417 aa  539  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1344  serine hydroxymethyltransferase  62.65 
 
 		 417 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  61.54 
 
 		 417 aa  539  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1660  serine hydroxymethyltransferase  62.98 
 
 		 418 aa  536  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0479076  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0471  serine hydroxymethyltransferase  61.93 
 
 		 414 aa  535  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.937307  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0295  serine hydroxymethyltransferase  61.93 
 
 		 414 aa  535  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3638  serine hydroxymethyltransferase  60.82 
 
 		 417 aa  537  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2762  serine hydroxymethyltransferase  60.82 
 
 		 417 aa  535  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1158  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 417 aa  531  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000444868  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0445  serine hydroxymethyltransferase  59.86 
 
 		 417 aa  531  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000471586  hitchhiker  0.0000012571 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1265  serine hydroxymethyltransferase  59.86 
 
 		 417 aa  531  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000077829  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4132  serine hydroxymethyltransferase  62.35 
 
 		 417 aa  529  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000588766  normal  0.517769 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  62.26 
 
 		 432 aa  531  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2312  serine hydroxymethyltransferase  61.67 
 
 		 412 aa  528  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.297378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1438  glycine hydroxymethyltransferase  61.76 
 
 		 421 aa  530  1e-149  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3094  glycine hydroxymethyltransferase  61.3 
 
 		 417 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0373  serine hydroxymethyltransferase  61.78 
 
 		 419 aa  530  1e-149  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.238829  normal  0.155765 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6283  glycine hydroxymethyltransferase  61.06 
 
 		 419 aa  526  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2796  serine hydroxymethyltransferase  61.54 
 
 		 417 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>