More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0959 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0959  Glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 410 aa  845    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.587194  normal  0.162631 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2910  glycine hydroxymethyltransferase  72.02 
 
 		 410 aa  600  1e-170  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0221  serine hydroxymethyltransferase  70.32 
 
 		 412 aa  573  1.0000000000000001e-162  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  62.13 
 
 		 417 aa  520  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  62.53 
 
 		 427 aa  515  1.0000000000000001e-145  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  61.63 
 
 		 410 aa  517  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  63.61 
 
 		 415 aa  514  1e-144  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  61.5 
 
 		 411 aa  512  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  60.5 
 
 		 413 aa  511  1e-144  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  61.39 
 
 		 410 aa  514  1e-144  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  61.54 
 
 		 425 aa  513  1e-144  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  61.29 
 
 		 427 aa  513  1e-144  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  60.77 
 
 		 412 aa  511  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  61.6 
 
 		 412 aa  510  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  61.37 
 
 		 427 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  61.43 
 
 		 412 aa  505  9.999999999999999e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  61.37 
 
 		 427 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 423 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0256  serine hydroxymethyltransferase  61.1 
 
 		 411 aa  507  9.999999999999999e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.666958 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  60.99 
 
 		 412 aa  504  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  59.56 
 
 		 423 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  59.81 
 
 		 423 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  61.46 
 
 		 431 aa  503  1e-141  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  59.56 
 
 		 423 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  60.99 
 
 		 412 aa  504  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4802  serine hydroxymethyltransferase  62.65 
 
 		 427 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0455  serine hydroxymethyltransferase  61.48 
 
 		 411 aa  503  1e-141  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  60.3 
 
 		 411 aa  498  1e-140  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2076  serine hydroxymethyltransferase  62.53 
 
 		 427 aa  499  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.745833  hitchhiker  0.000706319 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  61.99 
 
 		 429 aa  500  1e-140  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  60.55 
 
 		 425 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1389  Glycine hydroxymethyltransferase  58.56 
 
 		 427 aa  500  1e-140  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000692081  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  61.94 
 
 		 437 aa  498  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  60.55 
 
 		 411 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  60.55 
 
 		 425 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  58.6 
 
 		 412 aa  498  1e-140  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  61.48 
 
 		 411 aa  498  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  60.4 
 
 		 413 aa  497  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 		 414 aa  496  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 		 414 aa  496  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  60.4 
 
 		 414 aa  498  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  57.95 
 
 		 423 aa  494  1e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  60.4 
 
 		 413 aa  496  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 		 413 aa  496  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 		 413 aa  496  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  60.87 
 
 		 418 aa  494  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 		 413 aa  496  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 		 413 aa  496  1e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  60.55 
 
 		 424 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 413 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  59.27 
 
 		 413 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  61.79 
 
 		 414 aa  494  9.999999999999999e-139  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  59.75 
 
 		 417 aa  488  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  59.41 
 
 		 417 aa  490  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1887  Glycine hydroxymethyltransferase  60.4 
 
 		 419 aa  488  1e-137  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1537  serine hydroxymethyltransferase  59.31 
 
 		 435 aa  491  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  59.65 
 
 		 413 aa  491  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 		 417 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 415 aa  486  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 417 aa  485  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  57.73 
 
 		 439 aa  485  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  60.64 
 
 		 417 aa  486  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0727  serine hydroxymethyltransferase  55.74 
 
 		 438 aa  487  1e-136  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  59.66 
 
 		 420 aa  488  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  60.89 
 
 		 427 aa  486  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  60.31 
 
 		 417 aa  485  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  57.7 
 
 		 424 aa  487  1e-136  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  60.31 
 
 		 417 aa  487  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 417 aa  486  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  60.31 
 
 		 417 aa  487  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  58.68 
 
 		 422 aa  485  1e-136  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02841  serine hydroxymethyltransferase  58.62 
 
 		 416 aa  488  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3410  serine hydroxymethyltransferase  57.28 
 
 		 424 aa  483  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.751124  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  57.8 
 
 		 432 aa  483  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  57.73 
 
 		 438 aa  481  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  57.77 
 
 		 417 aa  482  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  58.74 
 
 		 412 aa  481  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3274  serine hydroxymethyltransferase  64.13 
 
 		 412 aa  481  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000462006  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1965  serine hydroxymethyltransferase  57.18 
 
 		 441 aa  481  1e-135  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.128494  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09233  serine hydroxymethyltransferase  59.26 
 
 		 439 aa  483  1e-135  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.293634  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1789  serine hydroxymethyltransferase  56.97 
 
 		 438 aa  483  1e-135  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  59.8 
 
 		 417 aa  481  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  57.52 
 
 		 417 aa  481  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  59.85 
 
 		 417 aa  482  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  58.52 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  59.41 
 
 		 433 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  60.61 
 
 		 413 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  57.88 
 
 		 415 aa  482  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1678  serine hydroxymethyltransferase  62.21 
 
 		 426 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  58.01 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4132  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000588766  normal  0.517769 
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  57.73 
 
 		 438 aa  479  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3004  serine hydroxymethyltransferase  59.22 
 
 		 432 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21133  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  57.52 
 
 		 415 aa  478  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  58.87 
 
 		 415 aa  481  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21550  serine hydroxymethyltransferase  58.84 
 
 		 418 aa  479  1e-134  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.968894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2634  serine hydroxymethyltransferase  58.5 
 
 		 433 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  59.41 
 
 		 440 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>