More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2316 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 412 aa  853    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  74.7 
 
 		 414 aa  657    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  65.05 
 
 		 415 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  65.29 
 
 		 415 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  64.32 
 
 		 415 aa  568  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  65.21 
 
 		 414 aa  568  1e-161  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  64.08 
 
 		 415 aa  565  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  64.08 
 
 		 413 aa  567  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  64.37 
 
 		 416 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  64.08 
 
 		 415 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  63.35 
 
 		 415 aa  556  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  64.55 
 
 		 415 aa  550  1e-155  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  61.72 
 
 		 422 aa  549  1e-155  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  63.26 
 
 		 412 aa  542  1e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  61.65 
 
 		 420 aa  542  1e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  61.11 
 
 		 424 aa  544  1e-153  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  63.95 
 
 		 412 aa  536  1e-151  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  59.85 
 
 		 419 aa  536  1e-151  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  62.29 
 
 		 414 aa  535  1e-151  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  62.22 
 
 		 420 aa  537  1e-151  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  61.86 
 
 		 412 aa  536  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  63.95 
 
 		 412 aa  534  1e-150  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  59.61 
 
 		 411 aa  533  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  63.24 
 
 		 412 aa  534  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  63.24 
 
 		 410 aa  530  1e-149  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 		 427 aa  525  1e-148  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1617  serine hydroxymethyltransferase  61.41 
 
 		 414 aa  525  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  59.12 
 
 		 412 aa  526  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  62.99 
 
 		 410 aa  527  1e-148  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  59.61 
 
 		 412 aa  524  1e-147  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  58.88 
 
 		 413 aa  523  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  58.74 
 
 		 413 aa  523  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  58.5 
 
 		 414 aa  522  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  58.5 
 
 		 413 aa  522  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  58.5 
 
 		 413 aa  521  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  58.54 
 
 		 418 aa  522  1e-147  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  58.88 
 
 		 413 aa  523  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  58.98 
 
 		 413 aa  524  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 		 427 aa  524  1e-147  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  58.25 
 
 		 414 aa  519  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  58.25 
 
 		 414 aa  520  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  58.5 
 
 		 413 aa  520  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  58.64 
 
 		 413 aa  519  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 422 aa  518  1e-146  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  58.98 
 
 		 412 aa  515  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  59.66 
 
 		 417 aa  515  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  59.76 
 
 		 423 aa  516  1.0000000000000001e-145  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0745  serine hydroxymethyltransferase  61.17 
 
 		 415 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2432  serine hydroxymethyltransferase  63.86 
 
 		 412 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139104  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  59.85 
 
 		 413 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  61.52 
 
 		 417 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  61.27 
 
 		 413 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  59.66 
 
 		 417 aa  516  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  58.64 
 
 		 423 aa  511  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  57.42 
 
 		 427 aa  513  1e-144  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  59.22 
 
 		 412 aa  513  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  57.28 
 
 		 411 aa  512  1e-144  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  59.22 
 
 		 412 aa  513  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  59.61 
 
 		 411 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  59.36 
 
 		 411 aa  510  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  58.82 
 
 		 431 aa  511  1e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  58.88 
 
 		 423 aa  510  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  57.91 
 
 		 423 aa  508  1e-143  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  58.78 
 
 		 417 aa  509  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  59.02 
 
 		 417 aa  509  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  58.44 
 
 		 417 aa  510  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  58.78 
 
 		 417 aa  508  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  58.78 
 
 		 417 aa  508  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5930  glycine hydroxymethyltransferase  58.02 
 
 		 438 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.0770182 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  57.95 
 
 		 417 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  58.29 
 
 		 417 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  58.29 
 
 		 417 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  59.02 
 
 		 415 aa  508  9.999999999999999e-143  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0762  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 		 417 aa  505  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  58.82 
 
 		 429 aa  506  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  58.44 
 
 		 416 aa  506  9.999999999999999e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  58.07 
 
 		 431 aa  507  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  58.54 
 
 		 417 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  58.44 
 
 		 415 aa  506  9.999999999999999e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  58.54 
 
 		 417 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04405  serine hydroxymethyltransferase  59.02 
 
 		 417 aa  503  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0791  serine hydroxymethyltransferase  59.51 
 
 		 417 aa  502  1e-141  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  58.29 
 
 		 417 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  58.29 
 
 		 417 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  58.39 
 
 		 416 aa  504  1e-141  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  59.02 
 
 		 417 aa  503  1e-141  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  58.31 
 
 		 438 aa  502  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  58.44 
 
 		 417 aa  502  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2762  serine hydroxymethyltransferase  56.93 
 
 		 417 aa  501  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  57.42 
 
 		 417 aa  502  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  58.29 
 
 		 417 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  57.7 
 
 		 417 aa  502  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  57.83 
 
 		 432 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0671  serine hydroxymethyltransferase  57.46 
 
 		 417 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.557812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  57.83 
 
 		 432 aa  500  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2083  serine hydroxymethyltransferase  55.88 
 
 		 418 aa  499  1e-140  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0004  serine hydroxymethyltransferase  57.11 
 
 		 416 aa  499  1e-140  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0703  serine hydroxymethyltransferase  57.7 
 
 		 417 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4513  serine hydroxymethyltransferase  57.7 
 
 		 417 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0695784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  59.17 
 
 		 413 aa  501  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>