More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0389 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1155  serine hydroxymethyltransferase  95.86 
 
 		 436 aa  867    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0389  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 436 aa  900    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285606 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3859  serine hydroxymethyltransferase  62.29 
 
 		 423 aa  555  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0127  Glycine hydroxymethyltransferase  62.04 
 
 		 435 aa  557  1e-157  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3410  serine hydroxymethyltransferase  64.22 
 
 		 424 aa  553  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.751124  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1617  serine hydroxymethyltransferase  64.65 
 
 		 424 aa  550  1e-155  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1789  serine hydroxymethyltransferase  60.47 
 
 		 438 aa  546  1e-154  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0584  serine hydroxymethyltransferase  59.59 
 
 		 440 aa  542  1e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0130889  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0630  serine hydroxymethyltransferase  59.23 
 
 		 440 aa  539  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0727  serine hydroxymethyltransferase  60.47 
 
 		 438 aa  532  1e-150  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  59.15 
 
 		 410 aa  532  1e-150  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0275  serine hydroxymethyltransferase  61.19 
 
 		 422 aa  531  1e-150  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.246164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7293  Glycine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 425 aa  529  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  58.92 
 
 		 410 aa  530  1e-149  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0601  serine hydroxymethyltransferase  58.56 
 
 		 440 aa  530  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1965  serine hydroxymethyltransferase  58.72 
 
 		 441 aa  531  1e-149  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.128494  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1590  serine hydroxymethyltransferase  59.3 
 
 		 440 aa  525  1e-148  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09233  serine hydroxymethyltransferase  62.38 
 
 		 439 aa  525  1e-148  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.293634  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  60.37 
 
 		 418 aa  525  1e-148  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  59.21 
 
 		 415 aa  523  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  59.21 
 
 		 415 aa  523  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  60.09 
 
 		 414 aa  524  1e-147  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4970  Glycine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 		 428 aa  518  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00413503  hitchhiker  0.000000000000204325 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3814  serine hydroxymethyltransferase  58.06 
 
 		 433 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.866873  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  58.69 
 
 		 412 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  58.51 
 
 		 415 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  57.81 
 
 		 415 aa  514  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  58.92 
 
 		 411 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  56.88 
 
 		 412 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  60.14 
 
 		 419 aa  511  1e-144  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  57.28 
 
 		 415 aa  513  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  56.74 
 
 		 415 aa  513  1e-144  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  58.49 
 
 		 417 aa  510  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  57.85 
 
 		 416 aa  508  1e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  56.57 
 
 		 412 aa  511  1e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  59.21 
 
 		 413 aa  511  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  56.35 
 
 		 422 aa  508  9.999999999999999e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  56.64 
 
 		 415 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 417 aa  507  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  56.15 
 
 		 424 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  58.71 
 
 		 417 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3633  serine hydroxymethyltransferase  58.47 
 
 		 431 aa  507  9.999999999999999e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  58.43 
 
 		 417 aa  501  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  56.81 
 
 		 413 aa  503  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  58.19 
 
 		 417 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  58.19 
 
 		 417 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  58.19 
 
 		 417 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  56.71 
 
 		 416 aa  503  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  55.71 
 
 		 413 aa  503  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  56.98 
 
 		 420 aa  503  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  59.38 
 
 		 417 aa  503  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04405  serine hydroxymethyltransferase  58.67 
 
 		 417 aa  504  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0851  glycine hydroxymethyltransferase  58.24 
 
 		 419 aa  502  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0407045  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  57.75 
 
 		 422 aa  501  1e-141  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  58.91 
 
 		 417 aa  504  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  58.43 
 
 		 417 aa  501  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  58.19 
 
 		 417 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  57.98 
 
 		 413 aa  504  1e-141  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  56.57 
 
 		 413 aa  499  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  56.57 
 
 		 413 aa  499  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  56.57 
 
 		 413 aa  499  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  56.74 
 
 		 414 aa  498  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  56.97 
 
 		 414 aa  499  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  56.34 
 
 		 413 aa  498  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  57.57 
 
 		 427 aa  498  1e-140  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2762  serine hydroxymethyltransferase  58.23 
 
 		 417 aa  500  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  56.34 
 
 		 413 aa  500  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6283  glycine hydroxymethyltransferase  58.28 
 
 		 419 aa  498  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  58.47 
 
 		 417 aa  501  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3468  serine hydroxymethyltransferase  59.72 
 
 		 418 aa  499  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  58.19 
 
 		 417 aa  501  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  58.19 
 
 		 417 aa  501  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1033  serine hydroxymethyltransferase  57.96 
 
 		 417 aa  500  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414818  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  57.51 
 
 		 417 aa  499  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  55.16 
 
 		 414 aa  499  1e-140  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  58.19 
 
 		 417 aa  501  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  59.62 
 
 		 417 aa  494  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  57.45 
 
 		 420 aa  496  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  56.5 
 
 		 414 aa  495  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  53.83 
 
 		 423 aa  498  1e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  56.1 
 
 		 413 aa  495  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  56.34 
 
 		 413 aa  497  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  55.66 
 
 		 425 aa  497  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  56.1 
 
 		 413 aa  495  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  57.48 
 
 		 417 aa  496  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  55.66 
 
 		 425 aa  497  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  57.55 
 
 		 415 aa  496  1e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1265  serine hydroxymethyltransferase  57.76 
 
 		 417 aa  491  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000077829  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0004  serine hydroxymethyltransferase  56.41 
 
 		 416 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  56.64 
 
 		 417 aa  491  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3044  serine hydroxymethyltransferase  57.52 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.196975  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0445  serine hydroxymethyltransferase  57.76 
 
 		 417 aa  491  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000471586  hitchhiker  0.0000012571 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  57.28 
 
 		 412 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  57.11 
 
 		 417 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0373  serine hydroxymethyltransferase  57.55 
 
 		 419 aa  492  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.238829  normal  0.155765 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  57.28 
 
 		 417 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  56.64 
 
 		 417 aa  491  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  58.45 
 
 		 417 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3262  serine hydroxymethyltransferase  57.82 
 
 		 454 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  56.1 
 
 		 411 aa  493  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>