More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0064 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0064  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 412 aa  852    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  79.37 
 
 		 412 aa  672    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  80.1 
 
 		 412 aa  687    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1617  serine hydroxymethyltransferase  76.64 
 
 		 414 aa  645    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  75.12 
 
 		 420 aa  652    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2432  serine hydroxymethyltransferase  75.97 
 
 		 412 aa  625  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139104  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  69.36 
 
 		 416 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  70.32 
 
 		 413 aa  600  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  70.07 
 
 		 415 aa  596  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  70.07 
 
 		 415 aa  597  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  68.61 
 
 		 415 aa  589  1e-167  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  67.64 
 
 		 415 aa  584  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  65.21 
 
 		 415 aa  571  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  65.45 
 
 		 415 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  66.42 
 
 		 411 aa  568  1e-161  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  64.18 
 
 		 424 aa  555  1e-157  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  64.39 
 
 		 410 aa  554  1e-156  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  64.15 
 
 		 410 aa  551  1e-156  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  65.01 
 
 		 415 aa  551  1e-155  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  62.44 
 
 		 412 aa  547  1e-154  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  63.41 
 
 		 413 aa  545  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  63.17 
 
 		 413 aa  545  1e-154  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  63.41 
 
 		 414 aa  545  1e-154  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  63.41 
 
 		 414 aa  546  1e-154  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  63.41 
 
 		 413 aa  545  1e-154  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  63.66 
 
 		 413 aa  546  1e-154  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  63.66 
 
 		 413 aa  547  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  62.77 
 
 		 412 aa  543  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  63.17 
 
 		 414 aa  544  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  62.16 
 
 		 415 aa  542  1e-153  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  62.68 
 
 		 414 aa  541  1e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  64.23 
 
 		 419 aa  542  1e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  62.77 
 
 		 412 aa  543  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  63.97 
 
 		 412 aa  543  1e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  63.41 
 
 		 413 aa  543  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  62.68 
 
 		 413 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  63.55 
 
 		 417 aa  535  1e-151  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  62.04 
 
 		 412 aa  535  1e-151  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  61.52 
 
 		 418 aa  535  1e-151  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  62.68 
 
 		 413 aa  536  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  64.46 
 
 		 417 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  63.4 
 
 		 422 aa  535  1e-151  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  62.44 
 
 		 412 aa  535  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  62.22 
 
 		 417 aa  532  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  60.73 
 
 		 412 aa  531  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  62.44 
 
 		 411 aa  533  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  63.97 
 
 		 417 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  63.73 
 
 		 417 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  62.96 
 
 		 417 aa  533  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  61.22 
 
 		 413 aa  531  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  63.64 
 
 		 417 aa  529  1e-149  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  61.92 
 
 		 413 aa  529  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 		 412 aa  528  1e-149  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  58.78 
 
 		 414 aa  528  1e-149  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  62.41 
 
 		 420 aa  530  1e-149  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04405  serine hydroxymethyltransferase  62.44 
 
 		 417 aa  528  1e-149  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  60.84 
 
 		 417 aa  528  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  60.73 
 
 		 416 aa  526  1e-148  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  61.86 
 
 		 413 aa  521  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  61.12 
 
 		 417 aa  523  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  59.47 
 
 		 412 aa  524  1e-147  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  63.17 
 
 		 427 aa  523  1e-147  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  63.17 
 
 		 427 aa  524  1e-147  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  60.84 
 
 		 417 aa  522  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0169  serine hydroxymethyltransferase  61.54 
 
 		 422 aa  521  1e-147  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  59.81 
 
 		 422 aa  518  1e-146  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  61.08 
 
 		 417 aa  518  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  60.74 
 
 		 416 aa  519  1e-146  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  60.88 
 
 		 417 aa  518  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0851  glycine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 		 419 aa  519  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0407045  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  61.08 
 
 		 417 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  61.33 
 
 		 417 aa  521  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  60.55 
 
 		 415 aa  521  1e-146  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  61.37 
 
 		 417 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3274  serine hydroxymethyltransferase  63.7 
 
 		 412 aa  519  1e-146  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000462006  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  58.29 
 
 		 414 aa  521  1e-146  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  61.33 
 
 		 417 aa  521  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1851  serine hydroxymethyltransferase  60.73 
 
 		 417 aa  514  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  63.71 
 
 		 415 aa  517  1.0000000000000001e-145  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 		 417 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 		 417 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0745  serine hydroxymethyltransferase  57.66 
 
 		 415 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 		 417 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  58.99 
 
 		 423 aa  516  1.0000000000000001e-145  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 		 417 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  60.88 
 
 		 417 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 		 417 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 		 417 aa  514  1e-144  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 417 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 		 417 aa  511  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  61.8 
 
 		 427 aa  511  1e-144  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1033  serine hydroxymethyltransferase  59.85 
 
 		 417 aa  511  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414818  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1912  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 		 430 aa  513  1e-144  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.637321  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1344  serine hydroxymethyltransferase  60.92 
 
 		 417 aa  511  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  63.38 
 
 		 433 aa  509  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0373  serine hydroxymethyltransferase  61.23 
 
 		 419 aa  509  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.238829  normal  0.155765 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  59.12 
 
 		 413 aa  511  1e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0703  serine hydroxymethyltransferase  59.41 
 
 		 417 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0671  serine hydroxymethyltransferase  59.41 
 
 		 417 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.557812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4270  serine hydroxymethyltransferase  59.17 
 
 		 417 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>