More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1833 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1833  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 423 aa  877    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.785323  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0745  serine hydroxymethyltransferase  72.45 
 
 		 415 aa  627  1e-178  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2187  serine hydroxymethyltransferase  70.85 
 
 		 417 aa  614  1e-175  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.911574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0023  serine hydroxymethyltransferase  68.48 
 
 		 436 aa  587  1e-166  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1356  serine hydroxymethyltransferase  68.01 
 
 		 416 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0821973  hitchhiker  0.0000000382903 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  61.85 
 
 		 414 aa  528  1e-149  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  60.38 
 
 		 410 aa  511  1e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  60.14 
 
 		 410 aa  509  1e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  59.67 
 
 		 415 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  60.67 
 
 		 412 aa  506  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  59.67 
 
 		 415 aa  503  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  59.43 
 
 		 415 aa  501  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  59.67 
 
 		 412 aa  502  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  60.14 
 
 		 415 aa  503  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  59.67 
 
 		 413 aa  501  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  58.99 
 
 		 416 aa  499  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  59.67 
 
 		 415 aa  499  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  58.8 
 
 		 413 aa  495  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  57.55 
 
 		 420 aa  496  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  57.76 
 
 		 412 aa  489  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0851  glycine hydroxymethyltransferase  58.19 
 
 		 419 aa  490  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0407045  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  56.56 
 
 		 420 aa  489  1e-137  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  58.31 
 
 		 417 aa  487  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  58.06 
 
 		 413 aa  485  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  58.23 
 
 		 415 aa  488  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  58.29 
 
 		 411 aa  487  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  57.82 
 
 		 413 aa  482  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  57.04 
 
 		 412 aa  482  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  57.82 
 
 		 413 aa  482  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  57.82 
 
 		 413 aa  484  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  57.76 
 
 		 414 aa  478  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  57.76 
 
 		 414 aa  479  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  58 
 
 		 414 aa  480  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  57.35 
 
 		 413 aa  478  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  57.58 
 
 		 413 aa  479  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  56.09 
 
 		 414 aa  480  1e-134  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  56.8 
 
 		 414 aa  478  1e-134  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  57.97 
 
 		 415 aa  479  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  57.58 
 
 		 413 aa  481  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  54.74 
 
 		 423 aa  475  1e-133  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  56.9 
 
 		 424 aa  478  1e-133  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  57.11 
 
 		 413 aa  473  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  57.66 
 
 		 415 aa  474  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3274  serine hydroxymethyltransferase  57.25 
 
 		 412 aa  472  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000462006  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  56.43 
 
 		 418 aa  473  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  55.37 
 
 		 412 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  55.58 
 
 		 422 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  56.19 
 
 		 412 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  55.37 
 
 		 412 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  56.56 
 
 		 412 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  56.63 
 
 		 422 aa  469  1.0000000000000001e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  55.37 
 
 		 413 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  57.21 
 
 		 413 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  53.22 
 
 		 412 aa  467  9.999999999999999e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0915  Glycine hydroxymethyltransferase  54.76 
 
 		 413 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  56.12 
 
 		 419 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  54.89 
 
 		 412 aa  462  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2187  Glycine hydroxymethyltransferase  53.35 
 
 		 418 aa  463  1e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  57.01 
 
 		 417 aa  462  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  56.56 
 
 		 412 aa  463  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1647  serine hydroxymethyltransferase  55.95 
 
 		 415 aa  461  1e-129  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  57.11 
 
 		 413 aa  464  1e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  56.01 
 
 		 417 aa  458  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  53.19 
 
 		 423 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0575  Glycine hydroxymethyltransferase  56.67 
 
 		 415 aa  458  9.999999999999999e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00199338  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  55.08 
 
 		 416 aa  461  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  56.01 
 
 		 417 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1264  serine hydroxymethyltransferase  57.76 
 
 		 426 aa  460  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  54.87 
 
 		 432 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1610  serine hydroxymethyltransferase  54.39 
 
 		 429 aa  458  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2312  serine hydroxymethyltransferase  54.68 
 
 		 412 aa  456  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.297378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  54.87 
 
 		 433 aa  457  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  53.68 
 
 		 431 aa  455  1e-127  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2432  serine hydroxymethyltransferase  56.32 
 
 		 412 aa  455  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139104  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  55.77 
 
 		 417 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  54.89 
 
 		 417 aa  455  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  54.39 
 
 		 432 aa  455  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0127  Glycine hydroxymethyltransferase  53.76 
 
 		 435 aa  457  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  55.53 
 
 		 417 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0064  serine hydroxymethyltransferase  56.32 
 
 		 412 aa  457  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  53.33 
 
 		 427 aa  457  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3004  serine hydroxymethyltransferase  55.82 
 
 		 432 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21133  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  55.34 
 
 		 431 aa  458  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  57.24 
 
 		 427 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0834  serine hydroxymethyltransferase  53.59 
 
 		 415 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  54.11 
 
 		 425 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0603  serine hydroxymethyltransferase  54.78 
 
 		 416 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1551  serine hydroxymethyltransferase  55.26 
 
 		 416 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3234  serine hydroxymethyltransferase  53.59 
 
 		 415 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1942  serine hydroxymethyltransferase  53.59 
 
 		 415 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  53.81 
 
 		 427 aa  452  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  54.05 
 
 		 424 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  53.59 
 
 		 415 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1155  serine hydroxymethyltransferase  52.41 
 
 		 436 aa  454  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3196  serine hydroxymethyltransferase  53.59 
 
 		 415 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  57.24 
 
 		 427 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5930  glycine hydroxymethyltransferase  54.07 
 
 		 438 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.0770182 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  54.18 
 
 		 411 aa  454  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  54.29 
 
 		 425 aa  454  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1630  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  54.42 
 
 		 566 aa  454  1.0000000000000001e-126  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>